郑超
- 作品数:3 被引量:11H指数:2
- 供职机构:四川大学生命科学学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金四川省科技支撑计划四川省卫生厅科研基金更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- 四川地区北京型结核分枝杆菌的MIRU-VNTR基因分型被引量:6
- 2014年
- 用寡核苷酸多态性基因分型(Spoligotyping)对2008年1月至2010年10月间采集的211株结核分枝杆菌临床分离株进行基因分型,然后对北京型结核分枝杆菌VNTR位点的多态性进行检测.选用的12个VNTR位点存在较高的基因多态性,该12位点组合分辨能力(HGI=0.99985)高于标准的VNTR-12位点组合(HGI=0.99546),其中多态性较高的7位点组合HGI指数为0.99977.因此,7位点组合可以作为四川地区北京家族分枝杆菌的一线分型方法.
- 冯钦景誉庆黄正辉段菁岳郑超孙宏虎钟晶孙群
- 关键词:结核分枝杆菌北京家族寡核苷酸数目可变串联重复序列
- 四川地区利福平耐药结核分枝杆菌rpoB基因利福平耐药决定区突变分析被引量:4
- 2013年
- 本文对268株结核分枝杆菌临床分离株(包括213株利福平耐药株、55株利福平敏感株)rpoB基因RRDR区进行测序并比较分析.结果表明,在213株利福平耐药株中有200株(93.90%)在rpoB基因RRDR区发生了突变,在55株利福平敏感株中RRDR均未发生突变.突变频率最高的类型依次为:531位点(55.87%),526位点(16.43%),516位点(10.33%)和511位点(8.92%),以上四个位点的突变菌株数占所有利福平耐药株的91.55%.四川地区利福平耐药株中511位点突变频率高于全国其他地区.
- 汤科孙宏虎郑超冯钦郭建华张聪聪赵于丁孙群
- 关键词:结核分枝杆菌利福平RPOB基因突变
- 四川省结核分枝杆菌基因分型中MIRU-VNTR位点稳定性评价及保守位点分析被引量:2
- 2015年
- 本文收集了四川省2009-2013年184株结核分枝杆菌菌株,用标准12 MIRUVNTR位点组对四川省结核分枝杆菌菌株进行基因分型研究,评估四川地区一线VNTR分型位点的稳定性,确定四川地区保守位点组合及主要MIT型.184株结核分枝杆菌基因分型后得到51个基因型,12个基因型成簇.本研究确定当前四川地区12高分辨力位点VNTR分型方法中的7个MIRU位点依然具有较高的分辩能力(h〉0.55).MIRU02,MIRU20,MIRU23,MIRU24为多态性最低的4个位点(0≤h〈0.4),保守位点组的主要MIT型为“2251”.四川省结核分枝杆菌VNTR位点的多态性保持稳定,目前采用的12高分辨力VNTR位点依然稳定可靠.
- 罗槑郑超吴桂辉李松孙群徐园红韩源平岳冀
- 关键词:结核分枝杆菌