赵大球 作品数:64 被引量:408 H指数:10 供职机构: 扬州大学园艺与植物保护学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 江苏省农业科技自主创新基金 江苏省高校自然科学研究项目 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 文化科学 建筑科学 更多>>
芍药C4H基因的克隆及其在钙处理下的表达特性分析 被引量:5 2018年 以芍药花茎RNA为模板,采用PCR技术对芍药肉桂酸-4-羟化酶基因(C4H)进行克隆与序列分析,并采用实时荧光定量PCR技术对C4H在钙处理下花茎中的表达特性进行分析。结果表明:芍药C4H基因长1 715 bp,具有完整的开放阅读框1 548 bp,共编码515个氨基酸,等电点为9.33,不具有信号肽、存在1个明显的跨膜结构域,属于不稳定蛋白和亲水性蛋白。花茎中C4H基因的表达水平随着芍药植株的发育而呈逐渐上升趋势,并且钙处理增强了C4H基因的表达。本研究有助于通过分子手段培育花茎挺直的芍药品种以及在生产上推广钙处理来提高芍药花茎挺直程度。 陈德伟 王昕 李红叶 汤梓岸 汤寓涵 陶俊 赵大球关键词:芍药 木质素合成 克隆 芍药等8种植物COMT基因的生物信息学分析 被引量:3 2020年 植物咖啡酸-O-甲基转移酶(caffeic acid O-methyltransferase,COMT)基因对木质素的合成具有重要的调控作用。本研究采用生物信息学方法对芍药等8种植物COMT基因编码的氨基酸序列进行比对,进而对其蛋白理化性质、信号肽、跨膜结构域、磷酸化位点、亚细胞定位、二级结构与三级结构进行了预测与分析。结果表明,芍药等8种植物COMT基因编码氨基酸的一致性可达65.91%,平均相对分子量为39437.79 Da,带有酸性等电点,含量最丰富的氨基酸为亮氨酸(Leu)和丙氨酸(Ala),无信号肽,无跨膜结构域,磷酸化位点数量最多的为丝氨酸和苏氨酸,定位于细胞骨架和细胞质中可能性最大,二级结构则以α-螺旋和无规则卷曲为主,三维结构具有一定的相似性。这一结果为今后深入开展植物COMT基因功能研究提供了科学依据。 许聪 石文波 高天祥 胡蕴钰 陶俊 赵大球关键词:芍药 甲基转移酶 生物信息学 种子休眠与萌发综述 被引量:29 2020年 种子休眠是高等植物中显花植物(即裸子植物和被子植物)经过长期进化而获得的一种对环境条件及季节性变化的生物学适应。休眠的种子可以在不适宜幼苗生长的情况下阻止种子的萌发,减少子代在恶劣环境萌发的的风险,一定程度上保障了种群的延续。本综述重点介绍种子休眠的类型、外界环境因素与母体环境因素以及植物激素对种子休眠与萌发的影响,并介绍了休眠的进化,各种不同类型的休眠在系统发生树上的分布,以期在阐明种子休眠机制的基础上提出一些解决生产过程中种子休眠问题的方法与路径,并为破坏严重的野生植物资源的保护,引种栽培提供理论依据。 刘慧娜 张克亮 赵大球 孙静 孟家松 陶俊关键词:种子 休眠 萌发 进化 激素 柿果实SQS基因cDNA全长的克隆和序列分析(摘要) 根据GenBank中所登录的灵芝(DQ494675)、甘草(EU851909)和东北红豆杉(DQ836053)等植物鲨烯合成酶(Squalene synthase,SQS)基因序列的保守区域,运用DNAMAN、Prime... 盛艳乐 赵大球 陶俊 周春华文献传递 芍药的景观美学价值与园林造景分析 被引量:1 2018年 芍药作为我国传统名花,具有很好的景观美学价值,是园林造景的重要资源。本文在分析芍药独具魅力的景观美学价值的基础上,对芍药在古典园林和现代园林中的应用进行考察和分析,论述了芍药在古典园林造景中的作用,对其在现代园林的应用提出了一些构想。 孙燕 李成忠 赵大球关键词:芍药 园林造景 《园林工程施工与管理》课程教学改革与实践 被引量:5 2018年 《园林工程施工与管理》是园林专业主干课程之一,研究园林工程施工技术和项目组织与管理两大体系,具有较强的专业性和实践性。该文分析了目前《园林工程施工与管理》课程教学中的不足,从教学内容、教学方法、教学手段、考核方式等多方面进行教学改革和实践,旨在为该课程教学提供一些教学思路。 孟家松 赵大球 陶俊关键词:教学内容 课程设计 教学改革 芍药查尔酮异构酶基因(CHI)克隆、密码子偏好性分析以及蛋白结构功能预测 被引量:14 2016年 为了丰富芍药CHI基因研究的基础数据,首先利用RACE技术对芍药CHI基因的CDS区进行克隆,并通过EMBOSS软件分析序列的密码子偏好性,其次利用生物信息学软件和在线数据库对芍药CHI进行蛋白结构与功能预测。结果表明,克隆获得芍药CHI基因c DNA序列长度为898 bp(Gen Bank序列号:JN119872),芍药CHI基因偏好使用以A/U结尾的密码子,28种偏好密码子(RSCU>1),其中偏好性较强的有UUG、UGU、CAU、AGA、AGG、CGG(RSCU≥2),在密码子的使用频率上,芍药CHI基因与酵母、大肠杆菌等模式生物基因组的差异均大于拟南芥基因组。芍药CHI为非跨膜亲水的稳定蛋白,无信号肽,属于非分泌蛋白;主要分布在细胞质(45.0%)和微体(42.5%)中;无糖基化位点,14个磷酸化位点,其中第20位氨基酸处存在一个典型的磷酸激酶PKC,含有1个异构酶Chalcone保守结构域;二级结构包括α螺旋(39%)、延伸链(20%)、β-转角结构(13%)和无规则卷曲(27%);三级结构呈β-三明治折叠形成的倒置花束。发现了一个异构酶催化活性区域和一个重要的特异性蛋白质激酶PKC位点,为今后深入研究CHI基因功能提供有利的基础资料,此外,拟南芥真核表达更适合作为芍药CHI基因的外源表达系统。 吴彦庆 赵大球 王静 陶俊关键词:芍药 密码子偏好性 PCR引物设计方法综述 被引量:49 2011年 为了获得PCR引物设计的理想方法,笔者运用NCBI等数据库与引物设计软件Primer Premier 5.0等工具,结合引物设计的原则,完成目的基因的引物设计,并对设计后的引物进行BLAST比对、综合评价和基因的重新检测等分析,据此对PCR反应条件进行优化研究。结果表明,通过这些数据库和软件所设计的引物能基本满足后续的RT-PCR反应,可以进行进一步的分子生物学研究。 尤超 赵大球 梁乘榜 周春华关键词:PCR 引物设计 分子生物学 芍药分生组织决定基因APETALA2(AP2)的克隆及生物信息学分析 被引量:4 2017年 花分生组织决定基因APETALA2(AP2)属于植物ABCDE模型基因,在花器官发育过程中起着重要的调控作用。为进一步了解芍药AP2基因的生物学功能,利用RACE扩增和测序技术克隆plAP2基因序列,利用生物信息学在线程序对其序列特征、蛋白结构及功能、亚细胞定位进行预测,并利用MEGA 5.0构建不同植物AP2分子进化树,最后利用qPCR检测其在内外花瓣中的差异表达情况。结果显示,克隆获得芍药AP2基因(plAP2)cDNA序列全长1 935 bp,其ORF全长为1 578 bp,编码525个氨基酸。蛋白结构与功能分析表明,plAP2蛋白为亲水性不稳定蛋白,无跨膜结构和信号肽,表明为非分泌蛋白;核定位信号位于氨基酸序列139-147(KKSRRGPRS);二级结构包括α-螺旋(24%)、β-折叠(19%)、β-转角(28%)和无规则卷曲(28%);plAP2蛋白存在8个糖基化位点和64个磷酸化位点,plAP2蛋白包含2个相同的保守结构域:AP2/(Ethylene-Responsive factors,ERF)(151-213aa和243-306aa)。亚细胞定位主要在细胞质(45.0%)中,少量分布于微体、线粒体基质间隙和溶酶体;进化树分析表明,芍药AP2基因与牡丹高度同源且亲缘关系最近;qPCR检测显示外瓣AP2表达量均极显著高于内瓣(P<0.01)。克隆出芍药AP2全长cDNA序列,系统地揭示了plAP2蛋白基本结构、功能位点区域、细胞定位以及组织表达情况,为今后深入研究plAP2基因功能提供基础素材和理论参考。 吴彦庆 成梦琳 赵大球 陶俊关键词:芍药 RACE 生物信息学 柿法呢基焦磷酸合酶基因的克隆与序列分析 被引量:1 2012年 在萜类生物合成途径中起重要作用的关键酶—法呢基焦磷酸合酶(Farnesyl Diphos-phate Synthase,FPS),对植物的生长发育、抗逆性以及次生代谢都起着重要的调节作用。通过cDNA末端快速克隆的技术(Rapid-amplification of cDNA Ends,RACE)从柿果实中克隆到法呢基焦磷酸合酶基因cDNA片段,并进行了序列的相关分析。结果表明:所克隆的FPS基因和NCBI数据库中已登录的云杉、腊梅、百合等植物FPS基因核苷酸序列的同源性分别达到88%、75%、73%,并且与香蕉、水稻、橄榄等植物FPS基因氨基酸序列的同源性分别达到72%、67%、66%。该基因已提交GenBank数据库,登录号为JN108022。 尤超 赵大球 梁乘榜 陶俊 周春华关键词:克隆