章明 作品数:183 被引量:371 H指数:11 供职机构: 中国农业科学院家禽研究所 更多>> 发文基金: 国家现代农业产业技术体系建设项目 国家自然科学基金 江苏省自然科学基金 更多>> 相关领域: 农业科学 医药卫生 轻工技术与工程 自动化与计算机技术 更多>>
广西麻鸡m6A甲基转移酶基因表达与肌纤维类型及成肌分化的关系 被引量:6 2022年 【目的】肌纤维类型及其转化的调节是改善肉质的重要途径,最新研究表明,m6A RNA甲基化修饰在肌肉的分化中发挥着重要作用。以优良的地方品种--广西麻鸡作为研究对象,研究其性成熟日龄不同部位肌纤维类型的组成差异,探究m6A甲基化转移酶相关基因甲基化转移酶样蛋白3/14(methyltransferase like 3/14,METTL3/14)、Wilm肿瘤1-相关蛋白(Wilms’tumor 1-associating protein,WTAP)和病毒样m6A甲基转化酶(vir like m6A methyltransferase associated,VIRMA,也称KIAA1429)在不同部位肌肉组织和成肌细胞分化前后的表达差异,为阐明肌纤维类型组成及转换的调控机理提供参考。【方法】采用ATPase染色法比较广西麻鸡胸部、腿部和背部肌肉群7个部位肌纤维类型、直径和密度等肌纤维性状差异,采用比色法检测成肌细胞分化前后不同时间点内源性m6A甲基化水平,采用实时荧光定量PCR方法检测上述4个基因在广西麻鸡7个部位肌肉以及成肌细胞分化前后的表达差异,并将其与肌纤维性状和m6A甲基化水平进行相关性分析。【结果】广西麻鸡性成熟日龄胸部肌肉群的胸大肌和胸小肌全部由白肌纤维组成,腿部肌肉群的耻坐骨肌内侧头、腓肠肌内侧头和缝匠肌均以红肌纤维为主,而髂胫外侧肌以白肌纤维为主,背部肌肉群的背阔肌则以红肌纤维为主;总体上,红肌纤维比例多的肌肉肌纤维密度显著高于白肌纤维比例多的肌肉。METTL3、METTL14、WTAP和KIAA1429基因表达存在显著的组织和时间特异性,总体上,在红肌纤维为主的肌肉中的表达量高于白肌纤维为主的肌肉,在分化期成肌细胞中的表达量要显著高于增殖期成肌细胞。肌肉中METTL3、METTL14和WTAP具有相似的表达模式,均在背阔肌中表达量最高,显著高于其他肌肉组织;在耻坐骨肌内侧头和腓肠肌内侧头的表达量次之,显著高于缝匠肌、胸大肌、胸小肌和髂胫外侧肌。K 束婧婷 单艳菊 姬改革 章明 屠云洁 刘一帆 巨晓军 盛中伟 唐燕飞 李华 邹剑敏关键词:基因表达 肌纤维类型 成肌分化 立华麻黄鸡体重和肉品质性状全基因组关联分析 2023年 旨在利用全基因组关联分析(GWAS)方法挖掘影响肉鸡体重和肉品质性状的位点和功能基因,为快速型黄羽肉鸡的选育积累理论基础。本试验对象为393只立华麻黄终端父系公鸡,60日龄时进行称重并采集胸肌以测定肉品质性状。通过全基因组重测序获得个体遗传变异,使用PLINK、GEMMA和R软件对体重及肉品质性状进行GWAS分析。结果,共筛选到2个与体重、8个与肉品质性状显著关联的SNPs位点(P<1.15×10-7);在潜在显著水平鉴定到52个与体重、296个与肉品质关联的位点(P<2.31×10^(-6))。通过对这些关联的SNPs进行注释,共筛选到了99个与体重、27个与剪切力、28个与系水力、57个与pH、113个与肉色相关的候选基因。分析认为FSTL3、MBNL3、NPFF、PFKM、PRKG1、SLC13A5、MDFIC、FGD3、AQP 1等基因可作为肉鸡体重和肉质性状的关键候选基因。以上研究结果为快速型黄羽肉鸡重要经济性状提供了重要的遗传变异位点和后续基因,为完善优质肉鸡分子选育方法、加快品种选育进展提供了关键的基础数据。 范晨宇 单艳菊 章明 姬改革 巨晓军 屠云洁 贺喜 束婧婷 刘一帆 张海涵关键词:全基因组关联分析 体重 肉品质 一种抑制鸡Wnt3a基因表达的ASO及其应用 本发明属于基因功能研究领域,具体涉及一种通过抑制鸡Wnt3a(Wnt family member 3A)基因表达的ASO及其应用。本发明公开了一种抑制鸡Wnt3a基因表达的ASO,所述ASO的核苷酸序列为5’‑AGUGC... 姬改革 束婧婷 巨晓军 章明 单艳菊 屠云洁 刘一帆 邹剑敏 盛中伟 肖芹一种与高邮鸭肌肉生长发育性状相关的SNP分子标记、其获取方法及应用 本发明公开了一种与高邮鸭肌肉生长发育性状相关的SNP分子标记、其获取方法和应用,所述分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,其来自TNNI1基因,该序列的第130位为SNP突变位点,该位点的碱基为A或G。通过本... 束婧婷 姬改革 章明 屠云洁 邹剑敏 单艳菊 刘一帆 巨晓军 张笛文献传递 笼养密度对公母分饲黄羽肉鸡生长性能、免疫器官发育、抗氧化能力、肠道组织形态及免疫相关基因mRNA表达的影响 被引量:1 2024年 本试验旨在探讨笼养密度对公母分饲黄羽肉鸡生长性能、免疫器官发育、抗氧化能力、肠道组织形态及免疫相关基因mRNA表达的影响。选用21日龄黄脚麻鸡720只,3层层叠式笼内饲喂,鸡笼规格为长×宽×高=1.2 m×0.8 m×0.4 m,公鸡和母鸡分开饲养,均随机分为4组(每组5个重复),笼养密度分别为15(低密度组)、17(中密度组)、19(中高密度组)和21只/m 2(高密度组)。试验期42 d。结果表明:1)对于公鸡,21~42日龄时,高密度组平均日采食量显著低于低密度组和中密度组(P<0.05);43~63日龄时,中高密度组和高密度组平均日采食量显著低于低密度组和中密度组(P<0.05),中高密度组和高密度组平均日增重显著低于低密度组(P<0.05)。对于母鸡,21~42日龄时,中高密度组和高密度组平均日采食量显著低于低密度组(P<0.05),高密度组平均日增重显著低于低密度组(P<0.05);43~63日龄时,高密度组平均日采食量显著低于低密度组和中密度组(P<0.05),中高密度组平均日增重显著低于低密度组(P<0.05)。2)对于公鸡,低密度组肝脏重量显著低于其他各组(P<0.05),肝脏指数显著低于高密度组(P<0.05)。3)对于母鸡,中密度组血清超氧化物歧化酶活性显著高于高密度组(P<0.05),中高密度组血清丙二醛含量显著高于高密度组(P<0.05)。4)对于公鸡,中密度组空肠绒毛高度/隐窝深度显著高于高密度组(P<0.05)。对于母鸡,高密度组十二指肠隐窝深度显著高于中高密度组(P<0.05),中高密度组十二指肠绒毛高度/隐窝深度显著高于高密度组(P<0.05);高密度组空肠绒毛高度显著低于中密度组和中高密度组(P<0.05),高密度组空肠绒毛高度/隐窝深度显著低于低密度组(P<0.05);高密度组回肠隐窝深度显著高于其他各组(P<0.05)。5)对于公鸡,中高密度组空肠肿瘤坏死因子-α(TNF-α)mRNA相对表达量显著高于其他各组(P<0.05)。对于母鸡,中高密度组空肠核因子E2相� 姬改革 巨晓军 单艳菊 章明 邹剑敏 屠云洁 刘一帆 束婧婷 庞立川 范晨宇关键词:黄羽肉鸡 笼养密度 免疫 鸡肌纤维类型性状相关基因的分子标记及其应用 本发明公开了一种鸡肌纤维类型性状相关基因的分子标记及其应用,选择PGC-1α基因外显子第646位核苷酸G→A的突变点作为分子标记,所述分子标记的核苷酸序列为SEQ ID NO.1所示,在SEQ ID NO.1的第97bp... 李慧芳 束婧婷 单艳菊 徐文娟 宋卫涛 章明 刘宏祥 陶志云 姬改革文献传递 泰和乌鸡蛋营养价值和小分子代谢物成分的综合分析 2024年 为了探究泰和乌鸡蛋的营养价值和小分子代谢物成分,通过与同批生产的麻黄鸡蛋进行比较,首先对泰和乌鸡蛋的外观、蛋品质和水解氨基酸含量进行分析,然后运用全局精准非靶向代谢组学方法对泰和乌鸡蛋蛋白和蛋黄的代谢物分别进行综合表征,筛选泰和乌鸡蛋的标志性代谢物。结果显示,泰和乌鸡蛋外型小于麻黄鸡蛋,小头尖,大部分蛋壳表面有黑斑沉积。泰和乌鸡蛋质量、蛋黄色泽、蛋黄质量、蛋黄比率显著低于麻黄鸡蛋(P<0.05),蛋形指数、哈氏单位显著高于麻黄鸡蛋(P<0.05)。泰和鸡蛋中含有17种水解氨基酸,与麻黄鸡蛋中水解氨基酸含量差异较小,仅组氨酸含量显著高于麻黄鸡蛋(P<0.05)。代谢组学比较研究发现,泰和乌鸡蛋蛋白中共有51个差异代谢物(P<0.05,变量投影重要性>1),其中有32个代谢物相对含量高于麻黄鸡蛋,19个代谢物相对含量低于麻黄鸡蛋,这些差异物质主要富集在氨基酸代谢途径,其中丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢途径的富集程度最显著且影响因子最大;蛋白中含量差异较大、影响较大的代谢物有硬脂酰胺、花生四烯酸、L-赖氨酸、L-天冬氨酸等,它们可作为鉴别泰和乌鸡蛋潜在的标志性代谢物。泰和乌鸡蛋黄中差异代谢物相对较少,仅有33个且在代谢物分类中比较分散,蛋黄中含量差异较大、影响较大的代谢物有3-氨基-4-甲基戊酸、亚氨基精氨酸、D-葡萄糖,可作为鉴别泰和乌鸡蛋潜在的标志性代谢物。本研究结果可为泰和乌鸡蛋的推广和食品开发提供基础数据支持。 巨晓军 章明 姬改革 单艳菊 屠云洁 刘一帆 邹剑敏 赵伟东 郑国庆 束婧婷关键词:蛋品质 鸭骨骼肌TNNI1基因CpG岛区甲基化与mRNA差异表达 2018年 本研究旨在通过克隆鸭慢速骨骼肌型肌钙蛋白I 1(Slow skeletal muscle troponin I 1,TNNI1)基因5'侧翼区序列,检测鸭骨骼肌组织TNNI1基因的mRNA表达水平和启动子CpG岛区甲基化状态,初步探索TNNI1基因转录调控机制。采用染色体步移方法克隆测序获得鸭TNNI1基因5'侧翼区序列,进行生物信息学分析,采用荧光定量PCR(Real-time quantitative PCR,RT-PCR)检测鸭胸肌和腿肌TNNI1基因mRNA表达水平,采用亚硫酸氢盐测序法(Bisulfite sequencing PCR,BSP)检测核心启动子区CpG岛在鸭肌肉组织中的甲基化水平。结果表明,克隆获得鸭TNNI1基因5'侧翼区序列2 078 bp,预测存在2个CpG岛,其中CpG岛(-2 032~-1 833 bp)位于预测的核心启动子区内,并存在多个真核生物结构元件和转录因子结合位点;甲基化检测发现,其总体甲基化水平在胸肌和腿肌组织中分别为52. 66%、57. 04%,差异不显著(P>0. 05);荧光定量检测结果表明,鸭胸肌和腿肌TNNI1基因表达量差异显著(P<0. 05);相关性分析结果表明,CpG4位点甲基化程度与胸肌TNNI1基因表达量呈极显著负相关(P<0. 01)。鸭胸肌和腿肌TNNI1基因的mRNA表达量存在显著差异,其总体甲基化水平无显著差异。在胸肌中,启动子区CpG4位点可能通过甲基化修饰影响TNNI1基因的转录调控。 姬改革 束婧婷 单艳菊 章明 屠云洁 巨晓军 刘一帆关键词:启动子 MRNA表达 甲基化 基于表达谱芯片筛选鸡不同部位皮肤组织差异表达基因 被引量:7 2018年 旨在筛选鸡不同部位(背部和腿部)皮肤组织中的差异表达基因,探讨二者皮肤毛囊出现表型差异的分子机制。以处于上市日龄的(63日龄)商品代肉鸡为素材,利用Agilent鸡全基因组表达谱芯片对皮肤厚度、毛囊密度和直径出现显著差异的背部和腿部皮肤组织mRNA表达水平进行检测,对与皮肤毛囊发生发育相关的候选基因及信号通路进行系统筛查,并运用实时荧光定量PCR技术对部分差异表达基因进行验证。结果显示,芯片分析共筛选到差异表达基因676个(|FC|≥2,P<0.05),以腿部皮肤为参照,背部皮肤组织中上调基因223个,下调基因453个。荧光定量PCR验证部分差异表达基因的表达趋势与芯片结果基本一致。GO分析表明,差异表达基因参与细胞增殖和凋亡调控、Wnt信号通路、神经元分化、细胞间黏附调节、细胞命运的确定等生物学过程。KEGG信号通路分析发现,除了部分已知的与皮肤毛囊生长发育相关的信号通路(Wnt和Hedgehog信号通路),ECM受体相互作用、黏着、细胞黏附分子、黏合连接等信号通路也被富集。蛋白互作网络分析表明,这些差异表达基因相互作用形成一个调控网络,可能通过影响皮肤毛囊的生长发育和周期变化来影响皮肤毛囊的性状,推测ECM受体相互作用、黏着、运输等调控通路及DKK1、WNT3A、SHH、FGF1、IGF1等基因可能是参与鸡不同部位皮肤毛囊性状出现差异的重要调控通路和候选基因。 姬改革 束婧婷 单艳菊 章明 屠云洁 刘一帆 巨晓军 邹剑敏关键词:皮肤 毛囊 表达谱芯片 家禽性别快速鉴定试剂盒 本实用新型公开了一种家禽性别快速鉴定试剂盒,属于生物技术领域,包括盒体和盒体内的衬垫,所述衬垫上设有孔腔,所述孔腔内分别设有特异性引物混合物JYp、扩增缓冲液、DNAMarker和琼脂糖粉。本实用新型根据同时存在于家禽性... 李慧芳 刘宏祥 胡艳 徐文娟 贾雪波 宋迟 陶志云 姬改革 章明文献传递