黄蔚 作品数:8 被引量:47 H指数:5 供职机构: 南京农业大学园艺学院作物遗传与种质创新国家重点实验室 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 江苏省杰出青年基金 教育部“新世纪优秀人才支持计划” 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 更多>>
芹菜AgERF4转录因子基因的克隆与表达分析 被引量:3 2016年 以‘六合黄心芹’芹菜为材料,克隆出编码乙烯反应元件结合蛋白基因AgERF4。序列分析表明,AgERF4含有1个长度为597 bp的开放阅读框,编码198个氨基酸,预测其蛋白质相对分子质量为21.43 kD,等电点为8.51。进化分析表明,ERF4转录因子在植物中高度保守。AgERF4属于亲水性蛋白。酵母单杂交和β–半乳糖苷酶活性测定结果确定AgERF4转录因子和乙烯应答元件GCC Box具有较高的结合活性。RT-qPCR分析表明,AgERF4在芹菜叶片中的表达水平较高,在根和叶柄中表达水平较低;高温和干旱条件下AgERF4的表达呈先上升后下降的趋势,在盐处理的24 h内AgERF4的表达始终高于对照。AgERF4转录因子在芹菜非生物逆境胁迫调控过程中起着重要作用。 吴蓓 李梦瑶 王广龙 黄蔚 王枫 熊爱生关键词:芹菜 酵母单杂交 非生物胁迫 基因表达 芹菜赤霉素氧化酶基因AgGA2ox的克隆及非生物逆境下表达分析 被引量:6 2016年 赤霉素(GAs)对植物生长发育有重要影响,赤霉素氧化酶基因(GA2ox)在GAs合成过程中起重要调控作用。本文从不同芹菜(Apium graveolens)品种‘六合黄心芹’和‘文图拉’中分别克隆得到编码赤霉素氧化酶的基因AgGA2ox,序列分析显示两个品种AgGA2ox基因均包含一个全长996 bp的开放阅读框,编码331个氨基酸,在核苷酸水平上有8个碱基位点的差异,氨基酸水平上有2个位点的差异。AgGA2ox蛋白在‘六合黄心芹’和‘文图拉’两个品种中的相对分子质量分别为37 044.6和36984.5,理论等电点均为8.31。进化分析表明,芹菜Ag GA2ox在植物进化间具有高度保守性,与西洋参(Panax quinquefolius)进化关系最为接近。实时定量PCR显示,AgGA2ox基因表达具有组织特异性,在芹菜叶柄中表达量最高;另外,AgGA2ox基因在4种非生物逆境条件[4°C低温、38°C高温、20%聚乙二醇(polyethylene glycol,PEG)及0.2 mol·L^(-1)NaCl]下均有响应,低温处理下AgGA2ox基因表达为明显上调,高温、干旱和盐处理下AgGA2ox基因表达为下调。‘六合黄心芹’与‘文图拉’AgGA2ox基因在逆境下的表达差异可能与不同品种抗逆性有关。 冯凯 王广龙 黄莹 徐志胜 黄蔚 熊爱生关键词:芹菜 赤霉素 非生物逆境 茶树两个Dof转录因子的分离及其在温度胁迫中的响应分析 被引量:12 2016年 茶树是一种重要的经济作物,温度胁迫对茶叶生产影响较大.本研究以茶树品种迎霜为实验材料,克隆获得2个编码Dof转录因子的基因CsDof1和CsDof2.序列分析显示,CsDof1含有1 389 bp,编码463个氨基酸;CsDof2含有1 458 bp,编码486个氨基酸.CsDof1和CsDof2转录因子都具有典型的锌指结构域,分别位于第133-195和124-186个氨基酸位点之间.对CsDof1和CsDof2转录因子理化性质、亲/疏水性、二级和三级结构分析显示,两者都是亲水性蛋白且显偏碱性.空间结构分析显示,CsDof1和CsDof2均有1个α-螺旋,且Dof结构域的位点完全相同,均有4个半胱氨酸残基.实时定量PCR表明,CsDof1和CsDof2在不同茶树品种、不同温度胁迫下均能诱导表达,且表达呈现差异. 李辉 黄蔚 刘志薇 王永鑫 吴致君 庄静关键词:茶树 锌指结构 温度胁迫 基因表达 胡萝卜AP2/ERF-B1亚族两个转录因子基因的克隆及其非生物胁迫响应分析 被引量:7 2014年 AP2/ERF是植物中普遍存在的一类重要转录因子,参与植物整个生命周期的生长发育和逆境信号转导。本研究以胡萝卜(Daucus carota)‘黑田五寸’为试验材料,基于其转录组和基因组数据,检索和拼接获得胡萝卜AP2/ERF家族2个转录因子基因序列g39811和g47170。采用RT-PCR方法,分别从‘黑田五寸’中克隆DcERF-B1-1(g39811)和DcERF-B1-2(g47170)转录因子基因。序列分析显示,胡萝卜DcERF-B1-1和DcERF-B1-2转录因子基因分别含有630个和594个开放阅读框,分别编码209和197个氨基酸;均含有相对保守的AP2结合域,具有典型的植物AP2/ERF类转录因子特征。从氨基酸组成成分、理化性质、亲水性/疏水性和三级结构上分析显示,胡萝卜DcERF-B1-1和DcERF-B1-2转录因子亲水性大于疏水性,其氨基酸序列可能属于亲水性蛋白。空间结构分析显示,它们都具有1个α螺旋和3个β折叠。进化树分析显示,二者均属于AP2/ERF家族转录因子中ERF亚族的B1组。实时定量荧光PCR显示,在低温、干旱、盐胁迫的条件下,DcERF-B1-2转录因子比DcERF-B1-1转录因子对逆境的响应更大;在高温的条件下,DcERF-B1-1转录因子比DcERF-B1-2转录因子对逆境的响应更大。 黄蔚 王枫 谭国飞 徐志胜 李梦瑶 熊爱生关键词:ERF 胡萝卜 转录因子 胡萝卜肉桂醇脱氢酶基因的克隆及其对非生物胁迫的响应 被引量:5 2016年 该实验采用RT-PCR技术,从胡萝卜‘黑田五寸’中克隆获得了编码肉桂醇脱氢酶(Cinnamyl alcohol dehydrogenase,CAD)的基因DcCAD。DcCAD序列长1 074bp,编码357个氨基酸。亲水/疏水性分析表明,DcCAD属于亲水性蛋白。系统进化分析显示,DcCAD与番茄CAD(XP_010314515.1)亲缘关系最近。荧光定量PCR结果显示,DcCAD基因在胡萝卜根、叶片和叶柄中的表达量差异显著,其相对表达量为叶片>根>叶柄。DcCAD基因对高温(38℃)、低温(4℃)、干旱(20%PEG)和盐(0.2mol·L-1 NaCl)胁迫均有响应,尤其对高温胁迫和低温胁迫响应明显,而且高温处理后1h和低温处理后2h表达量最高。研究推测,DcCAD基因对胡萝卜抗逆性具有一定的作用。 刘堰珺 马静 王广龙 黄蔚 王枫 熊爱生关键词:肉桂醇脱氢酶 同源分析 非生物胁迫 胡萝卜 芹菜肉桂酰辅酶A还原酶基因的克隆与表达分析 被引量:7 2016年 [目的]肉桂酰辅酶A还原酶CCR(cinnamoyl-Co A reductase)在植物木质素代谢中起重要的作用,能够将羟基肉桂酸还原生成肉桂醛。本文目的是研究不同芹菜中肉桂酰辅酶A还原酶基因AgCCR在芹菜中组织表达和非生物胁迫过程中的响应情况。[方法]以2个芹菜品种‘六合黄心芹’和‘文图拉’为材料,分别克隆出编码肉桂酰辅酶A还原酶的基因AgCCR。利用荧光定量PCR分析不同芹菜组织和2种芹菜在高温、低温、干旱和盐胁迫下AgCCR的表达情况。[结果]序列分析表明,‘六合黄心芹’和‘文图拉’中AgCCR基因均含有1个长度为1 014 bp的开放阅读框,编码337个氨基酸,二者的核苷酸位点有3个位点的差异,编码的氨基酸有1个位点的差异。对2个芹菜中的AgCCR基因进行多重比对并绘制进化树,发现其编码的氨基酸序列与其他15种植物的CCR蛋白同源性较高,氨基酸高度保守。荧光定量PCR(qRT-PCR)分析表明,芹菜AgCCR基因在‘六合黄心芹’和‘文图拉’叶中的表达水平较高,AgCCR基因在高温和低温下表达上调,在干旱处理下表达下调。[结论]芹菜AgCCR基因对多种非生物胁迫均有响应。特别是低温下该基因响应明显,表明AgCCR基因或许与芹菜抗寒机制相关。 吴蓓 李梦瑶 王广龙 黄蔚 熊爱生关键词:芹菜 非生物胁迫 基因表达 胡萝卜抗坏血酸过氧化物酶基因的分离及其对非生物胁迫的响应 被引量:8 2016年 [目的]抗坏血酸过氧化物酶(APX)利用抗坏血酸作为电子供体,清除植物中的过氧化物,在植物应对非生物胁迫中起重要作用。本文目的是研究胡萝卜Dc APX基因在抵御逆境胁迫过程中的响应情况。[方法]以胡萝卜‘黑田五寸’为研究材料,克隆获得胡萝卜Dc APX基因(Gen Bank登录号为KR364573),对该基因进行序列分析,并研究其主要非生物胁迫(高温、低温、干旱和盐胁迫)下的基因表达情况。[结果]序列分析表明,胡萝卜Dc APX基因全长753个碱基,编码250个氨基酸,预估其蛋白质相对分子质量为27.76×103,p I值5.65。进化分析表明,胡萝卜Dc APX在进化关系上与同属伞形科的短果茴芹同源性最高。空间结构分析表明,胡萝卜Dc APX的氨基酸二级结构由38.40%的α-螺旋、10.40%的延伸主链和51.20%的随机卷曲构成。胡萝卜Dc APX的氨基酸三级结构由10个α-螺旋和4个β-折叠构成。实时荧光定量PCR结果显示,胡萝卜‘黑田五寸’中Dc APX基因表达具有组织特异性,在叶中表达量最高。[结论]胡萝卜中Dc APX基因可以响应多种非生物逆境胁迫,在胡萝卜非生物逆境胁迫调控过程中起着重要作用。 张馨月 王广龙 黄蔚 王枫 倪桢燚 熊爱生关键词:抗坏血酸过氧化物酶 基因克隆 非生物胁迫 胡萝卜