高顺玉 作品数:15 被引量:17 H指数:3 供职机构: 楚雄师范学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 云南省应用基础研究基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 农业科学 生物学 理学 更多>>
人恶性胸膜间皮瘤DNA从头测序及基因突变分析 2024年 通过DNA从头测序分析人胸膜间皮瘤发生的高关联度突变基因。提取恶性胸膜间皮瘤(MPM)组织和正常胸膜组织DNA,构建基因文库,用Illumina HiSeqX Ten PE 150平台测序,将测序结果与人类基因组数据库的参考序列进行比对、注释,并对测序结果进行过滤、错误率分布检查、GC含量分布检查分析。MPM组织DNA平均过滤37829946 bp,错误率小于0.12%,GC含量占41.17%,而正常胸膜组织DNA平均过滤39089681 bp,错误率小于0.1%,GC含量占41.7%,两者测序质量均在Q 30(≥80%)以上,MPM为87.43%,正常胸膜为88.36%。以上高质量测序数据通过BWA比对到参考基因组(GRCh 37/hg 19),得到最初比对序列,利用重复标记后的比对序列进行覆盖度、深度等统计,覆盖深度达到10 X以上该突变位点可信。结果显示,实验病例XL14覆盖深度达到10 X的占98.59%,覆盖率达到99.83%;对照病例Z5占98.50%,覆盖率达到99.79%。对该序列进行基因注释分析,发现一系列单核苷酸多态性、基因插入缺失、基因结构变异、基因拷贝数变异,筛选出总变异位点数29277个,可能致病的变异位点数22个,致病性的变异位点数5个,不确定变异有害性的位点数为3353个,其余变异位点均为良性。进一步对突变基因进行富集、关联性分析,预测出突变基因TXNDC2与人胸膜间皮瘤的发生高度相关,相关系数达到0.8以上;突变基因PIEN、ABCC1、UGT1A7、UGT1A3、UGT1A4、UGT1A9、ALDH3B1、UGT1A5等与人胸膜间皮瘤有一定关联性,关联度在0~0.2之间。基因TXNDC2、PIEN、ABCC1、UGT1A7、UGT1A3、UGT1A4、UGT1A9、ALDH3B1、UGT1A5的变异可能与人胸膜间皮瘤的发生发展有关。本实验为人胸膜间皮瘤分子诊断提供了参考。 邱璐 王播勇 田梦丽 高顺玉 熊海波 熊伟关键词:从头测序 单核苷酸多态性 防治高原特色粳稻“楚粳”水稻白叶枯病的有效药剂筛选 2024年 [目的]为了筛选出可用于防治高原特色粳稻水稻白叶枯病的有效药剂。[方法]采用平板抑菌试验进行有效药剂筛选,并对有效药剂进行田间防效评价。[结果]四霉素、喹啉铜·四霉素、中生菌素、噻唑锌对水稻白叶枯病菌均有较好的抑制效果,其EC_(50)值分别为2.694×10^(-4)、3.485×10^(-4)、7.682×10^(-4)、3.983×10^(-3)mg/L。[结论]温室试验和田间试验中都是四霉素的效果最好,温室试验中治愈效果为69.31%,预防效果为73.81%;田间试验中四霉素对日本晴的防效为31.68%,增产率达到94.73%,对楚粳53的防效为44.38%,增产率达到43.44%。 邱曦锦 方绍兴 方飞艳 杨宇 胡爱 阮文忠 高顺玉 王振吉 杨俊 姬广海关键词:水稻白叶枯病菌 药剂筛选 同型半胱氨酸诱导肝星状细胞激活和增殖在肝纤维化发生中的作用 被引量:1 2009年 目的探讨同型半胱氨酸诱导肝纤维化的机制.方法采用高甲硫氨酸喂养小鼠,制成高同型半胱氨酸血症模型;采用HE染色检测肝组织纤维化;肝星状细胞周期蛋白D1基因表达升高测定采用RT-PCR.结果高甲硫氨酸饮食造成小鼠同型半胱氨酸血症,导致诱导肝纤维化;同型半胱氨酸处理肝星状细胞,导致周期蛋白D1表达升高;同型半胱氨酸的作用可被抗氧化剂维生素E和TEMPO所抑制.结论同型半胱氨酸诱导肝纤维化作用与促进肝星状细胞激活和增殖有关,活性氧自由基参与了这一过程. 廖媛晖 高顺玉 张彦 李树德 冯维杨关键词:同型半胱氨酸 肝纤维化 周期蛋白D1 活性氧自由基 p53基因在内质网应激诱导的晶状体上皮细胞凋亡中的作用 被引量:4 2009年 目的探讨在内质网应激诱导的晶状体上皮细胞凋亡中,p53基因的作用.方法衣霉素用于诱导晶状体上皮细胞株LEC内质网应激.细胞凋亡用Hoechst染色法.基因表达测定采用RT-PCR.结果衣霉素处理导致CHOP基因表达升高,LEC细胞凋亡率和caspase-3活性增加.同时,衣霉素诱导细胞p53表达升高.通过转染的方式过表达CHOP基因可加强衣霉素诱导的LEC细胞凋亡以及p53表达升高.但是仅仅过表达CHOP基因并不能诱导LEC细胞凋亡以及p53表达升高.结论p53基因很可能在内质网应激所介导的细胞凋亡起重要作用,但p53基因不是CHOP的直接靶基因. 赵学英 高顺玉 李树德 张远平 冯维杨关键词:CHOP 晶状体上皮细胞 细胞凋亡 珍珠鸟和家鸡甲状旁腺激素3型受体(PTH3R)的结构与表达图谱分析 2016年 本研究采用RT-PCR方法,首先克隆珍珠鸟和家鸡的PTH3R基因全长cDNA序列.结果显示,家鸡PTH3R(cPTH3R)cDNA全长1632bp,编码543个氨基酸,珍珠鸟PTH3R(zPTH3R-w)cDNA序列全长1563bp,编码520个氨基酸,其蛋白均含有信号肽序列、七次跨膜区等特征性结构.此外,在珍珠鸟中还发现一个新剪接变体zPTH3R-v1,其cDNA序列全长1468bp,编码488个氨基酸,其缺失第3外显子进而导致第1跨膜结构域缺失.利用生物信息学方法,我们还对珍珠鸟和家鸡PTH3R蛋白序列进行三维建模.采用RT-PCR方法,本研究也对珍珠鸟PTH3R基因进行组织表达分析.结果显示,zPTH3R及其剪切变体zPTH3R-v1在珍珠鸟脑及外周组织中广泛表达. 高顺玉 何晨 程绍臣 李娟 王亚军关键词:家鸡 珍珠鸟 分子克隆 楚雄冬春季城郊鸟类多样性初步调查 被引量:1 2011年 为了确定楚雄市冬春季城郊区鸟类多样性,采用样点法在4个样地内对随机设置的17个样点进行了调查。本次调查共记录了鸟类2808只次,隶属于4目、16科、44种,雀形目鸟类占调查总数的88.64%,非雀形目占11.36%。结果表明,郊区的鸟类种数(33,27 vs 18,16)、物种多样性(Shannon's index 2.21,2.43 vs 2.12,2.00)、均匀度(0,68,0,75 vs 0.74,0.69)、科属多样性(G-index 3.06,2.92 vs 2.63,2.39 and F-index 6.12,3.64 vs 1.48,0.95)均比城区高,但相对多度(abundance)较低。 邝粉良 高顺玉 李冰花 李雪玲 梁晓华 杨丽梅关键词:鸟类多样性 元谋巨峰葡萄种子缩合单宁抗氧化性的研究 被引量:2 2016年 缩合单宁是最有效的自由基清除剂之一,具有非常强的清除自由基和抗氧化的能力。论文以楚雄元谋地区巨峰葡萄籽为原料,通过单因素试验和正交试验探究了种子中缩合单宁的提取工艺及抗氧化活性。结果表明:缩合单宁提取的最佳条件是料液比为1∶6,乙醇浓度为70%,提取温度50℃,提取时间定为30min,清除DPPH·(二苯基苦基肼)自由基的能力最佳的缩合单宁浓度为120ug/ml,清除率最高为85.98%。 张伦 胡小安 高顺玉 徐成东关键词:巨峰葡萄 缩合单宁 抗氧化性 师范类高校“无机化学”课程思政建设探索 被引量:1 2023年 文章首先阐述了师范类高校“无机化学”课程思政建设现状,然后论述了师范类高校“无机化学”课程思政元素挖掘,最后提出了师范类高校“无机化学”课程思政建设策略。 束易锦 高顺玉 夏梦颖 徐成东关键词:师范类高校 家鸡卵泡刺激素受体新型剪接变体(FSHR-v)的克隆及功能探究 2016年 以家鸡为材料,利用RT-PCR技术,从家鸡卵巢中克隆了卵泡刺激素受体的一种新型剪接变体(cFSHR-v).基因结构与氨基酸序列比对分析表明,该剪接变体在8号外显子的5′端发生了差别剪切,导致了其相比于正常形式FSHR多出21个核苷酸,由此推测该变体(cFSHR-v)可以编码含有700个氨基酸残基的受体蛋白.与正常形式cFSHR相比较,cFSHR-v在N端胞外域增加了7个氨基酸残基.采用RT-PCR技术和pGL3-CRE荧光素酶报告系统,本研究也探究了cFSHR-v的功能及其在家鸡组织中的表达情况.结果显示,FSHR在家鸡卵巢及精巢组织中均有较高表达水平,但在CHO细胞中表达的cFSHR-v不能有效介导卵泡刺激素(FSH)对下游cAMP-PKA信号通路的刺激效应,说明在家鸡性腺中,FSHR存在剪切变体形式. 何晨 高顺玉 黄龙 孟风艳 卜贵鲜 王亚军关键词:家鸡 卵泡刺激素受体 性腺 蕨菜中黄酮类化合物的提取及稳定性研究 被引量:5 2011年 [目的]提取、纯化蕨菜中黄酮类化合物,并对其稳定性进行研究。[方法]用浓度为70%的乙醇提取蕨菜中黄酮类化合物,用分光光度法测定黄酮的含量;并考察温度、光照、pH值、稳定剂、碳水化合物和金属离子对蕨菜黄酮稳定性的影响。[结果]蕨菜根中黄酮含量达4.2640%。蕨菜黄酮在pH值为4-6及有碳水化合物存在的条件下都能稳定存在,自然光和强光对黄酮含量有一定的影响,还原剂对黄酮含量有较大影响,Mg2+、A l3+、Fe3+等金属离子对黄酮稳定性有影响。[结论]该研究可为蕨菜的进一步开发利用提供理论依据。 陶永元 高顺玉 舒康云 徐成东关键词:蕨菜 黄酮 稳定性