高原 作品数:9 被引量:92 H指数:6 供职机构: 湖南农业大学生物科学技术学院作物基因工程湖南省重点实验室 更多>> 发文基金: 中国农业科学院杰出人才科研启动经费资助 公益性行业(农业)科研专项 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 更多>>
亚麻木质素合成途径中关键酶基因片段的克隆与序列分析 被引量:6 2008年 亚麻是一种重要的韧皮纤维作物,木质素对亚麻纤维的性能和品质具有较大影响。以亚麻(Linum usitatis simum L.)茎秆表皮细胞的mRNA为模板,利用木质素合成途径中关键酶基因的同源基因保守序列设计简并引物,通过RT-PCR扩增,电泳获得13个特异带。分别将这些DNA片段连接到T载体后转化大肠杆菌,从重组质粒转化菌分别挑取5~8个单菌落测定插入片段序列,得到关键酶基因新的片段序列8个。生物信息学分析结果表明,这些新片段分别属于3个基因家族。其中,2个CCoAOMT基因片段(GenBank登录号为EF214740,EF214741),3个4CL基因片段(GenBank登录号为EF214737,EF214738,EF214739),3个F5H基因片段(GenBank登录号为EF214745,EF214746,EF214747),推测亚麻中这几个木质素代谢关键调控酶基因存在多基因家族。新获得的基因片段序列为进一步克隆全序列和了解调控亚麻木质素的生物合成奠定了基础。 高原 陈信波 龙松华 邓欣 邹杰 刘爱玲亚麻木质素合成关键酶基因表达分析 被引量:9 2009年 以亚麻(Linum usitatissimum)栽培品种白花为材料,采用半定量RT-PCR方法对亚麻木质素合成关键酶基因CCoAOMT1、4CL1、4CL2、COMT、F5H1、F5H2和F5H3在不同组织及不同时期木质部、韧皮部的表达规律进行了研究。结果显示,除F5H1在根部未表达外,其他基因在幼苗、根、花期木质部、花期韧皮部、叶、花和幼果中均有不同程度表达。CCoAOMT1在各部位都有较高的表达。2个4CL之间和3个F5H基因之间的部位表达的差异存在一定互补性。在韧皮部中,各基因均在幼嫩(30d)阶段表达量最低;除4CL2在花期(60d)达到表达高峰外,其他基因均在花后(70d)表达量最高;4CL1在各时期均有较强表达,而F5H3在各时期弱表达。在木质部中,除4CL1在各时期均表达弱和F5H1在花前期为表达高峰外,其余基因均在幼嫩阶段表达量最高;随后逐渐降低,在花期后表达量大幅降低;4CL1的表达量明显区别于其他基因,其各时期韧皮部的表达量明显高于木质部。 王进 陈信波 高原 张彦红 龙松华 邓欣 何东锋 王玉富关键词:亚麻 木质素 半定量RT-PCR 木质素生物合成途径及其基因调控的研究进展 被引量:30 2007年 木质素是植物体内含量仅次于纤维素的一类高分子有机物质,在植物体的机械支持、水分运输及抵抗外界不良环境的侵袭方面起着重要的作用。然而,它的存在严重影响植物材料在造纸工业、纺织业、畜牧业生产中的应用。木质素代谢过程中存在多基因现象使得木质素的合成途径出现多样性,利用共抑制、反义抑制等转基因技术开发低木质素含量的优良新品种具有重要的意义。 高原 陈信波 张志扬关键词:木质素 生物合成 基因调控 亚麻纤维素合成酶及其类蛋白基因部分序列的克隆 被引量:5 2008年 分离和克隆了亚麻纤维素合成酶基因(CesA)及其类蛋白D基因家族(CSLD)的部分序列,并对其进行生物信息学分析。纤维素合成酶类蛋白(CSL)作为一种重要的膜蛋白与纤维素合成酶具有相似的蛋白结构,都含有D,D,D,QXXRW保守区。利用其它物种中CesA基因的保守序列设计简并引物,采用RT-PCR方法扩增基因片段,经多次重复测序,获得了6个CesA基因片段和5个CSL基因片段。应用ClustalW和NCBI数据库对获得的基因片段进行序列分析,它们分别属于CesA基因家族和CSLD基因家族,6个CesA基因片段之间核酸和蛋白的相似性分别在67%~88%和71%~98%之间,5个CSLD基因片段之间核酸和蛋白的相似性分别在68%~83%和76%~94%之间。推测LusiCesA1与LusiCesA3,LusiCesA4与LusiCesA5及LusiCSLD1与LusiCSLD2的亲缘关系较近。 高原 陈信波 龙松华 邓欣 周小云 王进 何东锋亚麻木质素和纤维素合成相关基因部分序列的克隆 亚麻是一种重要的韧皮纤维作物,分离和克隆了亚麻木质素合成关键酶基因和纤维素合成相关基因的部分序列,并对其进行生物信息学分析。以亚麻(Linum usitatissimum)茎杆表皮mRNA为模板,利用这些基因的同源基因保... 高原关键词:木质素 纤维素 文献传递 亚麻组织培养高频不定芽诱导体系 被引量:17 2007年 对适合南方地区冬季种植的纤用亚麻品种组织培养过程中基本培养基、激素配比、外植体材料的基因型和苗龄以及再生不定芽的生根条件进行了比较研究。结果表明,适合于亚麻白花品种组织培养的最佳培养基为YB1,不定芽诱导率可达98.50%。在此培养基上,白花、黑亚4号、K6531、K7697、HI026、HI045、I039和阿丽亚那下胚轴不定芽的诱导率分别为98.50%、98.50%、56.50%、42.47%、54.40%、0、27.13%和97.30%,平均出芽数为11.43、9.33、2.17、0.77、1.10、0、0.90和10.68。苗龄为7-10天的下胚轴最适于诱导不定芽,随苗龄增加,不定芽的诱导率呈下降趋势。RB5培养基最适于不定芽的生根,生根率达100%,平均生根数为15.3。实验还确定了亚麻对卡那霉素、氨苄青霉素和头孢霉素的抗性浓度阈值。 张志扬 陈信波 张瑜 龙松华 高原 刘爱玲关键词:不定芽 下胚轴 亚麻 亚麻遗传多样性的RAPD分析 被引量:10 2008年 从600个随机引物筛选出28个扩增稳定性较好的引物,对18份来自不同国家和地区的亚麻资源遗传多态性进行RAPD分析。结果表明:共扩增出条带529,其中多态性条带201,总的多态性百分率(PPB)为38.0%。用NTSYSpc(2.10)软件进行UPGMA聚类分析,18个亚麻品种遗传距离为0.0469~0.1332之间,可分3大类,其中红木5号与匈牙利5号亲缘关系最近,ABYSSINIA(BROWN)和匈牙利5号遗传距离相差最显著,达到0.1332。 何东锋 陈信波 邓欣 龙松华 高原 王进 王玉富关键词:RAPD分析 亚麻 亲缘关系 用磁珠富集法分离亚麻基因组微卫星分子标记 被引量:17 2008年 应用Dynal磁珠-生物素标记的微卫星探针(CT)15与亚麻基因组DNA酶切片段杂交,捕获300~1500bp含有微卫星序列的DNA片段,连接到pMD18-T载体中,构建富集微卫星序列的小片段插入文库。利用接头引物和根据微卫星核心序列设计的引物VRV(CT)15使用PCR方法直接对文库筛选,从422个转化子中获得了104个阳性克隆,对其进行测序分析,获得了97个微卫星序列,微卫星序列的富集效率达到22.99%,PCR扩增筛选效率93.27%。对97个微卫星序列进行比对分析,其中51个重复序列的两端序列高度相似,据其设计的特异引物对阳性克隆进行2次筛选,能淘汰相似度高的同类序列,提高筛选亚麻微卫星标记的效率。 邓欣 陈信波 龙松华 王孝纯 高原 何东锋 王进 王玉富关键词:亚麻 微卫星 磁珠富集 SMART技术构建亚麻韧皮部全长cDNA文库 被引量:5 2008年 采用SMART(switching mechanism at 5'end of RNA transcript)技术构建了亚麻白花品种韧皮部的全长cDNA文库。经过涂平板测定和酶切反应快速鉴定表明,原始文库的滴度为4.3×106cfu,重组率达99%,插入片段大小多在0.7-2.5 kb间,平均大小在1 kb左右,采用涂平板均匀扩增得到的扩增文库滴度达到了1.1×1010,可用于长期保存。所构建文库的代表性和重组片段的序列完整性达到了用于目的基因的分离筛选和克隆表达的建库要求。 龙松华 陈信波 邓欣 高原关键词:亚麻 CDNA文库 SMART