陈继圣
- 作品数:11 被引量:60H指数:4
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- 稻瘟病菌中一个假定Rho GTP酶激活蛋白与Rho族蛋白的互作关系被引量:1
- 2013年
- Rho族蛋白是重要的分子开关,受GTP酶激活蛋白(GAP)调控。MGG_09303在稻瘟病菌中编码一个假定的Rho GTP酶激活蛋白。为探讨其与Rho族蛋白的互作关系,本文首先将基因MGG_09303与酵母中RhoGAPs蛋白序列进行多重比对,结果表明MGG_09303与酿酒酵母中的RhoGAP蛋白的氨基酸同源性较高的有BEM3(29%)、BEM2(28%)、LRG1(27%),而相似性较高的有RGD2(53%)、LRG1(52%),还发现MGG_09303与酿酒酵母中的RhoGAP具有共同的保守的精氨酸。据此初步预测它有可能与Rho1和Rho3存在互作,本研究构建了pGADT7-MGG_09303捕获表达载体,利用酵母双杂交技术将捕获载体pGADT7-MGG_09303分别与Rho族蛋白持续激活态(CA)和失活态(DN)诱饵载体共转AH109酵母细胞,进行双杂交实验。结果表明,MGG_09303蛋白与Rho1和Rho3的持续激活态(CA)互作,而不与其负显性失活态(DN)互作,研究结果验证了预测的结果,为进一步研究RhoGAP蛋白对Rho族蛋白负调控的分子机制奠定了重要的基础。
- 叶文雨陈四妙陈晓林艺娟汪洋余文英鲁国东陈继圣王宗华
- 关键词:稻瘟病菌酿酒酵母RHOGAP酵母双杂交
- 稻瘟病菌中一个假定的ADP核糖基化因子ARF6的功能分析
- 稻瘟病菌(Magnaporthe oryzae)是目前水稻三大流行病害中,影响最为广泛的一种,是造成水稻减产的主要原因之一。稻瘟病菌基因组序列已于2005年全部测序完成,为我们对该菌展开分子机理研究,探索水稻防疫稻瘟病菌...
- 朱晓寒周腾胜陈继圣王宗华
- 文献传递
- 全基因组预测稻瘟病菌的分泌蛋白
- <正>分泌蛋白多为病原微生物与植物受体蛋白起作用的激发子和其他致病因子,深入研究分泌蛋白将有助于明确植物与病原微生物互作的分子机制。利用稻瘟病菌基因组学研究成果, 结合计算机技术和生物信息学的方法,分析其分泌蛋白组学,将...
- 陈继圣郑士琴郑武周洁鲁国东王宗华
- 文献传递
- 基因表达分析稻瘟菌7个Rho GTP酶的关系被引量:2
- 2006年
- 【目的】Rho GTP酶是Ras超家族小G蛋白最主要成员。不同生物均含多种Rho GTP酶,相互之间存在密切关系,并共同参与调控多个信号转导途径。稻瘟菌基因组中存在7个Rho GTP酶,分析它们相互关系意义甚大。【方法】通过RT-PCR分析了MgCdc42不同状态下以及MgRho3插入失活状态下其它Rho GTP酶基因的表达变化。【结果】结果表明MgCdc42可能处于MgRho1、MgRho2和MgRhoX上游,对这些蛋白起正调控作用,对MgRac1和MgRho4起着负调控作用;MgRho3对MgRho1和MgCdc42的表达起正调控,对MgRac1和MgRho4的表达则起负调控作用;MgRho3与MgCdc42间关系复杂。【结论】稻瘟菌Rho GTP酶信号途径复杂,不同Rho GTP酶间存在相互调控关系,这将有助于进一步了解稻瘟菌等丝状真菌Rho GTP酶之间的相互关系。
- 郑武陈继圣郑士琴刘文德陈晓周洁鲁国东王宗华
- 关键词:稻瘟菌
- 全基因组预测稻瘟菌的分泌蛋白被引量:44
- 2006年
- 目的分泌蛋白多为病原微生物与植物受体蛋白起作用的激发子和其它致病因子,深入研究分泌蛋白将有助于明确植物与病原微生物互作的分子机制。利用稻瘟菌基因组学研究成果,结合计算机技术和生物信息学的方法,分析其分泌蛋白组学,将有助于全面掌握其致病因子的结构与功能。方法利用SignalP对稻瘟菌基因库中所有ORF的N-端信号肽存在与否进行预测,再依次通过Protcomp、TMHMM、big-PIPredictor和TargetP预测程序进行验证,寻找出所有可编码信号肽的基因。结果对11108个稻瘟菌的ORF进行分析,最终预测出共有1235个ORF可编码分泌蛋白。结论经验证此预测方法之可靠性较高,这为深入研究分泌蛋白组学奠定了基础。
- 陈继圣郑士琴郑武周洁鲁国东王宗华
- 关键词:稻瘟菌分泌蛋白信号肽
- 稻瘟菌Cdc42若干推测互作蛋白的结构和表达特点被引量:4
- 2006年
- 目的已有研究表明稻瘟菌Cdc42(MgCdc42)与酵母Cdc42(ScCdc42)高度同源,参与调控其形态分化和侵染过程,通过分析可能的MgCdc42互作蛋白,以明确这些蛋白结构和功能。方法用ScCdc42互作蛋白经BLAST搜索获得了稻瘟菌基因组中的相应同源物,分析了这些同源物的结构,并通过半定量RT-PCR分析MgCdc42不同突变情况下这些可能的调控蛋白及效应蛋白的表达情况。结果MgCdc42正显性突变后,导致所有推测互作蛋白表达量均有所提高;MgCdc42负显性突变,除MgBem1、Chm1、MgGic1表达量未见明显变化外,其余表达量均有所降低;当MgCdc42失活后,所有可能的MgCdc42调控蛋白及效应蛋白之表达量均有所降低。结论稻瘟菌可能存在酵母Cdc42相似的信号途径,MgCdc42在其中起着重要的调控作用。
- 郑武陈继圣郑士琴鲁国东王宗华
- 关键词:CDC42稻瘟菌
- 稻瘟病菌Rho族同源蛋白RAC1功能分析及相关信号途径初探
- Racl是Rho族蛋白/(也称为Rho GTP酶/)主要成员之一。Rho GTP酶在真菌的生长发育过程中发挥着关键的作用,几乎所有Rho GTP酶都被证实参与调控细胞极性生长,在丝状真菌中其还参与调控侵染致病过程。稻瘟病...
- 陈继圣
- 关键词:稻瘟病菌孢子发育
- 文献传递
- 稻瘟菌Rho族蛋白及其编码基因表达特点被引量:6
- 2006年
- Rho族蛋白是Ras超家族小G蛋白最主要成员,在真核生物中极为保守,包括Rho、Rac、Cdc42等,作为分子开关,参与细胞极性、细胞运动、细胞形状、细胞间及细胞与其基质互作等多个信号转导途径。基因组数据库分析显示,稻瘟菌中含有30余个小G蛋白,其中7个可能是Rho族蛋白,包括Cdc42、Rac1及5个Rho亚家族蛋白。结构分析表明,7个推导的Rho族蛋白均具有典型结构域。进一步以半定量RT-PCR分析了稻瘟菌7个Rho族蛋白编码基因在菌丝、分生孢子、芽管以及附着胞等不同生长发育阶段的表达情况。结果表明,Rho族蛋白编码基因具有不同的表达模式。通过BLASTP搜索GenBank等数据库,获得迄今已公布的真菌Rho1、Cdc42和Rac1蛋白序列,建立了系统发育树,一定程度地反映了真菌进化关系,说明在真菌进化中Rho族蛋白的结构与功能也经历了共同演化的过程。
- 郑武陈继圣郑士琴刘丽华刘淑集鲁国东周洁王宗华
- 关键词:稻瘟菌
- 稻瘟病菌RhoGAP基因表达特征及其生物信息学分析被引量:4
- 2013年
- Rho GAPs(GTPase activating proteins)是真核生物中Rho GTP酶的负调控因子之一,通过激活Rho GTP结合蛋白内在的GTP酶活性,使其加速水解成结合GDP的失活态。全基因组分析指出稻瘟病菌有8个Rho GAP成员(MoRhoGAP),但是其功能不清。本研究利用在线工具分析了其蛋白MoRhoGAP蛋白结构域及其定点突变后的三级结构,以及MoRhoGAP的互作蛋白网络,构建了系统发育树;利用基因芯片和公共数据库分析了在稻瘟病菌不同发育和侵染阶段Rho GAP的基因表达情况,为进一步研究稻瘟病菌RhoGAP的功能提供了理论依据。
- 叶文雨胡芳辉连璧陈晓余文英鲁国东陈继圣王宗华
- 关键词:生物信息学基因表达稻瘟病菌
- 稻瘟病菌中一个假定的ADP核糖基化因子ARF6的功能分析
- 稻瘟病菌(Magnaporthe oryzae)是目前水稻三大流行病害中,影响最为广泛的一种,是造成水稻减产的主要原因之一.稻瘟病菌基因组序列已于2005年全部测序完成,为对该菌展开分子机理研究,探索水稻防疫稻瘟病菌提供...
- 朱晓寒周腾胜陈继圣王宗华
- 关键词:稻瘟病菌生物学作用