王栋
- 作品数：10 被引量：54H指数：4
- 供职机构：中国农业科学院作物科学研究所更多>>
- 发文基金：国家食用豆产业技术体系建设专项国家科技支撑计划中央级公益性科研院所基本科研业务费专项更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 山黧豆分子标记的开发及遗传多样性研究进展被引量：2
- 2021年
- 山黧豆是一年生冷季豆类作物,因其抗旱、耐涝、耐贫瘠,具有极端气候条件下的生存能力,可作食品、牧草、绿肥等兼用,具有较高的经济价值。因山黧豆属作物普遍含有神经毒素β-ODAP,使其发展受阻;相比其他农作物,对山黧豆分子水平的研究甚少。笔者对山黧豆属种质资源研究及分子标记开发利用进行概述,为山黧豆资源挖掘和遗传改良提供依据。
- 严昕李孟伟刘荣李冠王栋季一山王晨瑜黄淑贤宗绪晓杨涛
- 关键词：山黧豆分子标记
- 利用SSR标记分析蚕豆品种(品系)与优异种质的遗传多样性被引量：10
- 2018年
- 利用99对SSR荧光标记对102份国内蚕豆育成品种(品系)和优异种质资源进行遗传多样性分析。结果表明:99对SSR标记共检测出937个等位变异,每对标记平均检测出4~19个等位变异,平均为9.46个;多态性信息量(PIC)变化范围为0.38~0.88,平均为0.63;有效等位变异(Ne)变化范围为1.79~9.22,平均为3.41;Shannon信息指数变化范围为0.79~2.44,平均为1.45。基于邻接法(NJ)的聚类分析将102份国内育成蚕豆品种(品系)及优异种质划分成春播和秋播两大生态类型;优异蚕豆资源的遗传多样性最高,其次为青海品种(品系)和云南品种,江苏品种遗传多样性相对较低。群体遗传结构和主成分分析将供试蚕豆材料分为三大类,第一大类主要以云南育成品种为主,第二大类全部为青海育成品种(品系),第三大类主要为大部分优异种质资源以及全部江苏育成品种;供试材料具有生态适应性狭窄和极强的地域生态特点。
- 张红岩郭兴莲郭兴莲杨涛刘荣季一山王栋王栋
- 关键词：SSR标记蚕豆优异种质
- SSR标记分析种子老化及繁殖世代对大豆种质遗传完整性的影响被引量：22
- 2010年
- 选取大豆品种中黄18为试验材料,利用60对SSR核心引物对经过不同老化时间处理的群体及其繁殖后代群体进行遗传完整性分析。经过老化处理的群体及其繁殖子代群体与未经老化处理的对照群体相比,等位基因频率、有效等位基因数没有显著差异,结果表明经过老化处理种子及其繁殖子代群体的等位基因频率变化不大。未经老化处理、发芽率为98%的对照群体(G_0-1)与其繁殖一代、繁殖二代群体相比,等位变异数、遗传多样性指数、香农指数和稀有等位基因数没有显著差异,且遗传一致度相对较高;而经过老化处理、发芽率低于85%的群体(G_0-3和G_0-4)及其后代繁殖群体与对照群体相比,等位变异数、遗传多样性指数、香农指数和稀有等位基因数显著或极显著降低,且遗传一致度相对较低。因此,种子老化较繁殖世代对大豆种质群体的遗传结构影响更大。
- 王栋卢新雄张志娥陈晓玲辛霞辛萍萍耿立格
- 关键词：大豆种子老化繁殖世代SSR种质保存
- 鹰嘴豆种子表型性状多样性评价被引量：7
- 2019年
- 以中国农业科学院作物科学研究所国家资源库提供的251份鹰嘴豆种质资源为参试材料,利用相关分析、主成分分析及聚类分析方法,对数码考种仪获得的11个鹰嘴豆种子表型性状数据进行综合分析,可深入了解鹰嘴豆种质资源种子表型性状特征及其相关性。结果显示:供试鹰嘴豆种子表型性状变异幅度较大,遗传多样性丰富,百粒重变异系数高于其余性状;直径、周长、粒长、粒宽、投影面积与百粒重的相关系数均大于0.75,达到极显著水平。对11个性状进行主成分分析,前3个主成分的贡献率分别为64.14%、22.17%、7.70%,表明3个主成分几乎包含供试鹰嘴豆材料11个种子表型相关性状的全部信息,直径、周长、粒长、粒宽、投影面积及百粒重等6个表型性状对主成分Ⅰ的贡献较大,且描述籽粒大小性状;在遗传距离9.11处,将所有参试材料分为4个类群,第Ⅳ类群6个表型性状均值均高于其他类群。为鹰嘴豆优异基因发掘、育种改良以及种质创新提供了理论依据。
- 周生坛周生坛郭瑞军杨涛杨涛刘荣王栋王栋王晨瑜黄宇宁宗绪晓
- 关键词：种质资源主成分分析聚类分析
- 一种基于RNA-Seq开发的小扁豆KASP标记及应用
- 本发明提供一种基于RNA‑Seq开发的小扁豆KASP标记及应用。本发明通过通过转录组测序组装技术大规模开发了78个小扁豆KASP标记，给出这些标记所对应的正向引物1、正向引物2和反向引物序列，提供了这些标记的筛选过程，并...
- 丁汉凤王栋宗绪晓杨涛李娜娜刘荣王效睦张晓冬李润芳李群
- 文献传递
- 一种基于RNA-Seq开发的小扁豆KASP标记及应用
- 本发明提供一种基于RNA‑Seq开发的小扁豆KASP标记及应用。本发明通过通过转录组测序组装技术大规模开发了78个小扁豆KASP标记，给出这些标记所对应的正向引物1、正向引物2和反向引物序列，提供了这些标记的筛选过程，并...
- 丁汉凤王栋宗绪晓杨涛李娜娜刘荣王效睦张晓冬李润芳李群
- 文献传递
- 利用2个F2群体整合中国豌豆高密度SSR遗传连锁图谱被引量：2
- 2020年
- 豌豆(Pisum sativum L.)是一种重要的食用豆类作物,在全世界范围内广泛种植,既可作为人类食物,也可作为牲畜饲料。用SSR标记构建的遗传连锁图谱在豌豆和其他作物的标记辅助育种中发挥着重要的作用。尽管对豌豆遗传连锁作图的研究已有悠久历史,但公众可获得且可转移的SSR标记以及基于遗传独特的中国豌豆种质的高密度遗传连锁图谱仍然有限。为了获得更多可转移的SSR标记和中国豌豆的高密度遗传连锁图谱,本研究首先从自主开发和文献获取的12,491个全基因组SSR标记中筛选了617个多态性SSR标记,并用于G0003973×G0005527 F2群体遗传连锁图谱的加密。加密后的图谱全长扩展到5330.6 cM,包含603个SSR标记,标记平均间距离8.8 cM,相比之前的图谱有明显改善。基于上述结果,我们又筛选了119个具有多态性的SSR标记,用于构建大样本W6-22600×W6-15174 F2群体的遗传连锁图谱,新图谱累积长度为1127.1 cM,包含118个SSR标记,装配在7条连锁群上。最后,将来自以上2个遗传图谱的数据进行整合,得到了一张覆盖范围6592.6 cM的整合图谱,包含668个SSR标记,由509个基因组SSR、134个EST-SSR和25个锚定标记组成,分布在7条连锁群上。这些SSR标记和遗传连锁图谱将为豌豆的遗传研究和标记辅助育种提供有力工具。
- 刘荣王芳方俐杨涛张红岩黄宇宁王栋季一山徐东旭李冠郭瑞军宗绪晓
- 关键词：豌豆SSR遗传连锁图谱标记辅助育种
- AFLP标记分析生活力影响大豆中黄18种质遗传完整性被引量：12
- 2010年
- 以中黄18种子为试验材料,采用不同时间(0、112、154和196d)老化处理,获得4个群体G0-1、G0-2、G0-3和G0-4,其发芽率分别为98.0%、95.0%、81.0%和79.0%。将这4个群体进行2次田间繁殖,得到4个繁殖一代群体G1-1、G1-2、G1-3和G1-4及4个繁殖二代群体G2-1、G2-2、G2-3和G2-4。以群体G0-1为对照,选用12对AFLP引物组合分析12个群体的遗传完整性。结果显示,所有处理群体与对照群体G0-1的等位基因频率t检验概率值均为1.00,即无显著差异。群体G2-4与对照群体G0-1的遗传相似系数仍高达0.9333,表明发芽率为79.0%群体的繁殖二代群体与对照群体的遗传相似性仍然较高。显著性t检验结果显示,与对照群体G0-1相比,群体G1-1、G2-1、G1-2和G2-2的每位点有效等位基因数(Ae)、遗传多样性指数(H)和香农指数(I)差异不显著;群体G0-3、G0-4、G1-3、G1-4、G2-3和G2-4的上述遗传多样性参数则显著降低。与对照群体G0-1相比,群体G1-1、G2-1、G1-2和G2-2的稀有等位基因数无显著变化;而群体G0-3、G0-4、G1-3、G1-4、G2-3和G2-4的稀有等位基因数则大幅下降。以上结果表明,与对照群体相比,由发芽率分别为98.0%和95.0%的群体更新的子代群体,其群体遗传多样性和稀有等位基因数无显著变化,而由发芽率分别为81.0%和79.0%的群体更新的子代群体,则显著下降。因此,生活力下降比繁殖世代对大豆种质群体的遗传结构影响更大,建议初始发芽率为98.0%的大豆种质更新发芽率标准不应低于81.0%。
- 王栋张志娥陈晓玲辛霞辛萍萍卢新雄
- 关键词：大豆生活力繁殖世代种质保存
- 利用EST-SSR标记评价羽扇豆属(Lupinus L.)遗传多样性被引量：3
- 2020年
- 利用基于窄叶羽扇豆转录组开发并筛选出的95对多态性EST-SSR标记,对羽扇豆属的22个种133份资源进行全基因组扫描,初步探究羽扇豆属下种间的进化关系,分析来源于“旧世界”羽扇豆种间的遗传多样性,为羽扇豆优异资源的挖掘和创新利用提供理论依据。结果表明,用95对SSR标记共检测出1318个等位变异,每对标记平均检测出3~37个等位变异,平均为13.87个;多态性信息量(PIC)变化范围0.39~0.91,平均为0.75;基因多样性变化范围0.41~0.92,平均为0.78。基于邻接法(NJ)的系统发育初步探究了羽扇豆种间的进化关系,22个羽扇豆种分别来源于“旧世界”和“新世界”,与之前研究结果相对一致。聚类分析、群体结构分析和主成分分析结果均表明,来源于“旧世界”的7个羽扇豆种被划分为4个组群,各组群所包含的参试资源没有种间交叉重叠。
- 张红岩张红岩杨涛刘荣晋芳张力科于海天杨峰杨峰王栋何玉华
- 关键词：EST-SSR转录组
- 基于选择消除分析挖掘豌豆耐冻相关基因被引量：1
- 2020年
- 近年来,冬季的低温对豌豆生产造成严重损失。本试验对16份极端耐冻豌豆和14份极端冷敏感豌豆的全基因组重测序数据与参考基因组进行比对获得SNP,再基于过滤后的SNP数据对所有材料进行系统发育树构建、主成分分析、连锁不平衡分析以及选择消除分析等,并依据选择消除分析的群体多样性(θπ)、杂合率(Hp)和群体分化(Fst)三者交集的前5%候选区域,最终筛选获得34个与豌豆耐冻相关的基因。研究结果为豌豆耐冻品种选育和“冬豆北移”栽培模式提供理论支撑。
- 季一山王晨瑜刘荣李冠王栋黄宇宁严昕李孟伟杨涛宗绪晓
- 关键词：豌豆基因组学
