杨发达
- 作品数：7 被引量：28H指数：3
- 供职机构：南方医科大学南方医院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- 锌指转录因子Snail在结直肠癌中的表达及其意义被引量：14
- 2008年
- 目的确定锌指转录因子Snail与结直肠癌发生发展及演进的相关性。方法应用免疫细胞化学及免疫荧光细胞化学方法分析Snail在结直肠癌细胞株SW480与SW620内的表达情况,同时以结直肠癌组织68例及对应癌旁组织68例、腺瘤组织33例、淋巴结转移癌35例为研究对象,运用免疫组织化学方法分析Snail在这些组织中的表达情况。结果Snail在结直肠癌细胞株SW620、SW480中的表达较强,Snail定位在结直肠癌细胞株SW620、SW480的细胞核里;Snail在正常结直肠粘膜、腺瘤、癌及淋巴结转移癌组织中的表达明显不同(χ2=92.852,P=0.000);两两比较发现,腺瘤Snail表达比正常结直肠黏膜组织强(P<0.01),淋巴结转移灶中癌组织Snail表达比原发结直肠癌组织强(P<0.01),而原发结直肠癌组织Snail表达比腺瘤组织强(P<0.01)。结论锌指转录因子Snail与结直肠癌发生、演进及转移相关。
- 高维哲李建明杨发达周军丁彦青
- 关键词：锌指转录因子SNAIL结直肠肿瘤腺瘤淋巴结转移
- 人大肠癌细胞PRL-3基因启动子Snail结合位点的初步研究
- 目的确定转录因子 Snail 可与 PRL-3 基因启动子区结合。方法应用生物信息学方法获得 PRL-3基因启动子区域,并对其潜在的 Snail 结合位点进行预测,进一步应用 Snail 抗体染色质免疫共沉淀技术结合 P...
- 杨发达李建明周军柳玉红丁彦青
- 关键词：启动子
- 文献传递
- 人PRL-3基因启动子的克隆及转录因子Snail结合位点的初步鉴定被引量：3
- 2008年
- 促肝细胞再生磷酸酶-3(PRL-3)是重要的肿瘤转移相关基因,其转录调控机制一直未被阐明.应用TRED在线分析系统共获得3种可能的人PRL-3基因启动子区域.通过与人基因组序列进行比对,发现其中3号启动子序列距离人PRL-3基因距离最近,位于该基因上游约1kb的DNA区域,与5′端非翻译区域邻接.在线Consite分析系统发现,-500bp至-451bp之间存在Snail结合的核心寡核苷酸序列CACCTG.运用分子克隆的方法获得PRL-3基因启动子2段区域-699bp至299bp及-642bp至-383bp区域,后者具有Snail结合位点核心寡核苷酸序列CACCTG.构建具有荧光素酶报告基因的pGL3载体并检测其启动子活性.-699～299bp区域与-642～-383bp区域的DNA片段在SW480、SW620、CNE2、293A细胞中均具有启动子活性,其中含有Snail结合位点核心寡核苷酸序列CACCTG的短片段活性强于较完整的序列.染色质免疫沉淀结合PCR扩增技术及凝胶迁移阻滞实验确定PRL-3基因启动子区域具有Snail结合位点.研究确定,PRL-3基因的启动子位于转录起始位点上游700bp与下游300bp的DNA区域,PRL-3基因启动子存在转录因子Snail结合元件.
- 周军李建明杨发达柳玉红丁彦青
- 关键词：PRL-3启动子SNAIL转录调控
- 人PRL-3基因真核表达载体构建及相关蛋白生物信息学分析
- 2008年
- 目的克隆人PRL-3基因并构建其真核表达载体,并运用生物信息学方法对PRL-3的相互作用蛋白进行预测分析。方法运用RT-PCR技术,从人大肠癌细胞系SW480细胞中扩增出人PRL-3cDNA,经T-A克隆,构建人PRL-3基因的真核表达载体pcDNA3-PRL-3,通过双酶切鉴定及测序确认,并利用生物信息学方法预测分析其相互作用蛋白。结果成功扩增出人PRL-3全长cDNA,构建pcDNA3-PRL-3真核表达载体,测序结果表明PRL-3全长cDNA与GeneBank中PRL-3序列完全一致。利用模式生物果蝇相互作用蛋白数据库DIP,利用基于保守的蛋白相互作用分析方法,预测认为肌动蛋白家族成员ARP6和功能尚不清楚的小G蛋白家族ARL-3可能是PRL-3的相互作用蛋白,提示PRL-3可能是联系信号分子和细胞骨架系统的重要桥梁,参与构建了一条独特的结直肠癌转移信号途径。结论成功克隆PRL-3基因全长cDNA并构建其真核表达载体,并利用生物信息学方法,初步预测PRL-3的相互作用蛋白,为进一步深入研究PRL-3在大肠癌发生发展中的作用奠定了基础。
- 周军李建明杨发达柳玉红丁彦青
- 关键词：PRL-3蛋白相互作用生物信息学
- CDH22基因克隆及其真核表达载体的构建与表达
- 2008年
- 目的克隆人CDH22基因并构建其真核表达载体。方法设计CDH22特异性引物,提取人大肠癌细胞系SW480总RNA,用RT-PCR方法获取人CDH22cDNA,经T-A克隆,通过双酶切及测序鉴定,将CDH22克隆至pCDNA3/HA,构建人CDH22基因的真核表达载体pCDNA3/HA-CDH22,转染HEK293A细胞,用WesternBlot及免疫荧光细胞化学技术检测目的蛋白的表达。结果成功扩增出人CDH22全长cDNA,双酶切鉴定证实成功构建pCDNA3/HA-CDH22真核表达载体,测序结果表明CDH22全长cDNA与GeneBank中CDH22序列完全一致,转染HEK293A细胞后,可检测出Mr约为86KD的目的蛋白,而免疫荧光细胞化学技术也检测到蛋白表达。结论获得人CDH22基因全长cDNA并成功构建了CDH22真核表达载体,证实pCDNA3/HA-CDH22转染HEK293A细胞后可表达HA-CDH22蛋白,为深入研究CDH22基因在肿瘤发生发展中的作用奠定了基础。
- 周军李建明杨发达柳玉红丁彦青
- 关键词：基因克隆真核表达
- 人CDH22基因RNAi慢病毒载体的构建及稳定干扰CDH22基因的表达被引量：7
- 2008年
- 目的构建人CDH22基因RNA干扰(RNAi)慢病毒载体,有效沉默大肠癌细胞的CDH22基因表达,为研究CDH22在大肠癌转移中参与的信号转导机制提供研究基础。方法利用在线软件设计人CDH22基因shRNA序列,合成、退火形成双链寡核酸后克隆到pENTRTM/U6载体的黏性末端,测序。得到的阳性重组子再与慢病毒载体进行重组,获得真核表达慢病毒干扰载体。在脂质体的介导下将慢病毒包装辅助质粒和CDH22基因重组慢病毒载体导入293FT细胞包装病毒,测定病毒滴度,感染大肠癌细胞SW480,杀稻瘟菌素筛选获得稳定干扰CDH22基因的细胞亚系。结果成功构建CDH22真核表达慢病毒干扰载体并获得相应的慢病毒,病毒滴度为8×105U/ml。荧光定量PCR结果表明,所获得的细胞克隆11中CDH22 mRNA水平的表达显著降低。结论成功构建出CDH22基因慢病毒RNAi表达载体,并获得CDH22基因稳定干扰的大肠癌细胞亚系,为研究CDH22在大肠癌转移中的作用机制提供了研究基础。
- 周军李建明杨发达柳玉红丁彦青
- 关键词：RNA干扰慢病毒结直肠癌
- 人大肠癌细胞PRL-3基因启动子Snail结合位点的初步研究被引量：6
- 2007年
- 目的确定转录因子Snail可与PRL-3基因启动子区结合。方法应用生物信息学方法获得PRL-3基因启动子区域,并对其潜在的Snail结合位点进行预测,进一步应用Snail抗体染色质免疫共沉淀技术结合PCR技术检测PRL-3基因启动子序列,以确定转录因子Snail可与PRL-3基因启动子结合。结果应用TRED在线分析系统确定PRL-3基因的启动子区域位于PRL-3基因上游-700bp至299bp之间,在该启动子区域存在多个转录因子如Snail、n-MYC、ARNT、E74A、NF-kappaB、NRF-2及AML-1等的结合位点;在启动子区域的-500bp至-451bp之间存在Snail结合的核心寡核苷酸序列CACCTG,在其他多个区域存在多个类似这一核心序列的DNA序列;应用染色质免疫沉淀技术结合PCR扩增的方法对人大肠癌细胞株SW480细胞进行分析,发现Snail可与人大肠癌细胞株SW480PRL-3基因的启动子区域的DNA片断结合。结论转录因子Snail可与人大肠癌细胞SW480PRL-3基因启动子结合,参与PRL-3基因的调控。
- 杨发达李建明周军柳玉红丁彦青
- 关键词：SNAIL
