曹卿 作品数:18 被引量:130 H指数:7 供职机构: 江苏省农业科学院 更多>> 发文基金: 国家科技支撑计划 江苏省农业科学院科研基金 江苏省自然科学基金 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 更多>>
水稻广亲和基因S5-n的功能标记开发及其应用 被引量:36 2009年 广亲和基因S5-n是能够恢复籼、粳杂种育性的基因,利用常规育种方法回交转育广亲和基因需要通过配组杂种F1,根据F1的育性判断和选择S5-n,选育周期长,方法繁琐。因此,在广亲和遗传改良和聚合育种中需要寻找一种快速、简便的广亲和基因检测方法。本研究根据水稻广亲和基因和籼粳S-5等位基因序列存在136bp缺失的特征,设计了InDel标记S5136。前人研究已经明确02428、Dualr、CPSLO17具有S5-n,分子标记S5136 PCR扩增这3个材料的带型为缺失带型,而不携带广亲和基因S5-n的材料的带型为非缺失带型。利用该标记对3037与02428的F2群体分析表明,该标记能准确区分S5-n、S5-i纯合及杂合基因型,标记基因型符合1∶2∶1比例,没有发生偏分离现象。利用该标记从554份水稻品种资源(O.sativa L.)和27份普通野生稻(O.rufipogen Griff.)以及24份江淮流域杂草稻资源中筛选出具有缺失带型的资源材料13份,并对其PCR产物测序证实为S5-n,对Kasalath的广亲和性进行了初步验证;从20份02428的高世代育种材料中,筛选到携带广亲和基因S5-n的恢复系2份。该标记可以用于S5-n基因资源筛选、分子标记辅助选择育种和培矮64S为母本的杂交种种子纯度鉴定。 杨杰 王军 曹卿 陈志德 仲维功关键词:亚洲栽培稻 普通野生稻 杂草稻 杂草稻红色果皮基因的功能标记开发 被引量:8 2009年 红色果皮是杂草稻的基本特征之一,为了给杂草稻的分子鉴定提供依据,本研究根据已克隆的普通野生稻(Oryza rufipogen)红色果皮Rc与白色果皮rc等位基因第6外显子的差异,设计了InDel标记RID14。利用RID14标记对F2群体和江淮流域所收集到的24份红色果皮杂草稻、3份普通野生稻以及21份品种资源进行了标记基因型分析。研究表明,红色果皮均为非缺失带型,而白色果皮和紫色果皮为缺失带型,F2群体中杂合带型和非缺失带型均为红色果皮,而缺失带型为白色果皮。因此,RID14标记与白色果皮和红色果皮共分离,可以作为鉴定红色果皮杂草稻的分子标记。 杨杰 王军 曹卿 陈志德 汤陵华 仲维功关键词:杂草稻 灰飞虱共生菌groEL基因的克隆、生物信息学分析及其植物双元表达载体构建 2010年 本研究克隆了江苏南京地区灰飞虱(Laodelphax striatellus Fallén)体内共生菌Wolbachia的groEL基因全长序列。序列分析表明,其开放阅读框为1659bp,编码552个氨基酸残基,分子量为58.884kD,等电点为5.01。序列比对发现克隆的groEL基因与已登录的groEL基因(登录号:EF468716)起始密码子下游424bp处存在一个核苷酸的差异,与另一groEL基因(登录号:DQ356890)完全一致。利用PROTEIN DATA BANK在线软件对灰飞虱的groEL蛋白立体结构进行预测,结果表明灰飞虱的groEL蛋白为同型寡聚复合物,具有分子伴侣功能。本研究进一步构建了含该groEL基因和潮霉素基因的双元表达载体,为下一步转化水稻奠定了基础。 曹卿 杨杰 王军 范方军 仲维功 张玉琼 张云华关键词:灰飞虱 共生菌 WOLBACHIA GROEL 生物信息学分析 分子伴侣 利用显性标记ST10对96份江苏省杂草稻基因型的分析 被引量:2 2011年 本研究利用显性标记ST10对96份江苏省部分地区杂草稻抗条纹叶枯病基因进行检测,同时对供试材料进行了田间抗性调查。研究结果表明,在96份杂草稻材料中,有5份材料能够扩增出727bp的ST10特异条带,91份材料没有获得PCR产物,说明其中5份材料可能携带Stv-bi基因,而其它91份材料不携带该基因。根据田间调查结果显示96份杂草稻均抗条纹叶枯病,推测91份不携带Stv-bi基因的杂草稻材料中含有其它抗病基因。本研究结果为开发杂草稻抗病基因提供参考。 曹卿 张玉琼 董召荣 杨杰 王军 仲维功关键词:杂草稻 水稻条纹叶枯病 分子标记辅助选择 水稻白化转绿突变体基因v12的超微结构和精细定位 在籼稻品种9311中发现了1个苗期白化转绿的自然突变体(Virescent 12)。在低温度(<26.0℃)条件下,突变体前3张叶片均表现为白色,只有叶尖和叶鞘表现出少许绿色,以后逐渐死亡;该突变体在28℃温度下1... 王军 杨杰 曹卿 范方军 陈志德 朱金燕 杨金欢 仲维功关键词:水稻 超微结构 分子标记ST10对水稻条纹叶枯病抗性基因Stv-b^i的检测 被引量:8 2009年 近年来,利用与抗病基因紧密连锁的分子标记进行辅助选择已经成为抗病育种的重要手段。本研究利用显性标记ST10对24个水稻品种以及24个水稻品种中的镇稻88/武育粳3号和武运粳7号/徐稻3号的2个F2群体进行检测。PCR结果显示,17个抗病品种有8个能扩增出约727bp的目标片段;在镇稻88/武育粳3号杂交组合中,感病亲本武育粳3号和F2群体中的8个感病单株均不能扩增出目标片段,抗病亲本镇稻88、F1和13个不感病单株中的11株都能够扩增出目标片段;用于检测的武运粳7号/徐稻3号的F2群体中,8株感病单株没有检测出目标片段,而13株不感病的单株有9株扩增出目标片段。结果表明,ST10与条纹叶枯病抗性基因Stv-bi紧密连锁,表现为共分离。 王军 杨杰 曹卿 陈志德 范方军 仲维功关键词:水稻 条纹叶枯病 水稻胚乳低直链淀粉含量基因Wx-mq的分子标记 本发明涉及水稻胚乳低直链淀粉含量基因Wx-mq的分子标记,属于分子遗传学领域。用两对特异扩增水稻胚乳低直链淀粉含量控制基因Wx-mq及其等位基因Wx-b的PCR分子标记引物,其中Wx-b和Wx-mq正向共用引物1Wx-b... 杨杰 仲维功 曹卿 王军 陈涛 范方军 王才林文献传递 江淮流域杂草稻遗传多样性的研究 水稻(亚洲栽培稻,Oryza sativa L)是世界上重要的粮食作物之一,为世界上近70﹪的人口提供粮食。但是,现在水稻的生产受到了愈发严重的杂草危害。杂草稻(Weedy rice,O.Sativa L.f.spont... 曹卿关键词:杂草稻 亲缘关系 遗传育种 文献传递 稻瘟病抗病基因Pita和Pib在中国水稻地方品种中的分布 被引量:42 2011年 主效抗稻瘟病基因Pita和Pib在我国很多稻区表现高水平的稻瘟病抗性,被广泛应用于我国的水稻育种和生产。但这2个基因在国内品种资源中的分布及利用情况缺乏详细的资料,致使育种利用上存在着盲目性。本研究利用Pita和Pib基因的功能标记,检测和分析了我国115份水稻地方品种的Pita和Pib基因型。结果表明,Pita在我国浙江、福建、广东、广西、贵州、四川、安徽、江西、河南、河北、吉林均有分布,在江苏、上海、山东、湖南、湖北、辽宁没有发现;而只有来自四川的地方品种桂东籼和来自河南的德国稻携带Pib,其他省均未发现。在江苏的主要推广粳稻品种中,晚粳品种几乎都携带这两个基因,部分迟熟中粳携带这两个基因,中熟中粳多数不携带。 杨杰 杨金欢 王军 范方军 朱金燕 曹卿 田胜尼 仲维功关键词:水稻 稻瘟病 主栽品种 抗性基因 水稻多酚氧化酶基因功能标记的开发与应用 水稻酚反应是水稻分类的重要依据.控制水稻酚反应的多酚氧化酶基因(PPO)已经克隆,根据其等位基因的DNA序列差异设计了InDel功能标记FMppo-18和FMppo-29.利用这两个标记对45份品种资源材料进行了标记基因... 杨杰 曹卿 王军 范方军 张玉琼 仲维功关键词:多酚氧化酶 杂草稻 基因漂流