冯文芳
- 作品数：2 被引量：8H指数：2
- 供职机构：华中科技大学同济医学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 消化后片段长度差异等位基因特异性PCR技术——印记SNP rs220028多态性和甲基化模式研究被引量：5
- 2005年
- 目的建立一种能同时分析甲基化和单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphism,SNP)的新方法。方法以印记SNPrs220028(A/G)为例,基因组DNA经甲基化敏感限制酶消化后用片段长度差异等位基因特异性PCR(fragmentlengthdiscrepantallele-specificPCR,FLDAS-PCR)分型;用扩增产物酶消化法来排除酶切位点序列变异,证实检出的是甲基化等位基因。结果消化后FLDAS-PCR可选择性检出甲基化等位基因,家系分析表明其来自母亲。等位基因频率A=0.5085,G=0.4915,多态信息含量为0.3749。结论消化后FLDAS-PCR技术可以实现甲基化和SNP的复合分析;印记SNPrs220028在Prader-Willi/Angelman综合征诊断中有潜在意义。
- 赵贵森黄代新冯文芳杨庆恩
- 关键词：甲基化SNP等位基因PCR技术酶切位点
- 一种用于DNA甲基化分析的改进型亚硫酸氢盐转化法被引量：3
- 2007年
- DNA甲基化分析是认识生理、病理条件下基因表达变化的重要途径.亚硫酸氢盐转化是DNA甲基化分析的瓶颈.本文旨在改进琼脂糖-亚硫酸氢盐DNA处理方案(agarose bisulfite method),建立一种简便稳定、适合常规甲基化分析的亚硫酸氢盐转化法.把DNA包入普通琼脂糖,以饱和亚硫酸氢盐在较高的温度下快速处理,然后用离心柱型琼脂糖凝胶DNA回收试剂盒,集DNA凝胶回收、脱盐、脱磺基和纯化于一体,完成整个转化过程.Bisulfite-PCR、克隆测序和酶切法分析转化率、转化特异性和转化物的质量.用该方案处理的HeLa细胞DNA,多个片段的转化率均大于98%,甲基化片段96.2%的CpG保持不变,可以扩增605bp的较大片段,灵敏度介于普通法和琼脂糖亚硫酸氢盐法之间,而重复性较二者都好.改良后的方案简化了操作流程,快速稳定,易学易用,可实现高效特异转化,适合于一般实验者对常规检材进行DNA甲基化分析.
- 赵贵森郑海燕莫耀南冯文芳杨渝珍
- 关键词：DNA甲基化亚硫酸氢钠琼脂糖
