- 整合分析方法在肿瘤转录组学和遗传易感性研究中的应用
- 癌症是世界范围内的一种恶性疾病,其中,肺癌与乳腺癌的发病率和死亡率相对较高,一直是研究的重点。研究方向包括癌发生机理与预防、存活期预测、药物治疗、药物靶点等诸多方面。目前在公共平台上已积累了相关的大量芯片数据和文献数据。...
- 陈诚文
- 关键词:遗传易感性信号通路基因多态性肺腺癌
- 文献传递
- 基因芯片的Meta分析和组织芯片分析表明AXL在肺腺癌(LAD)癌旁组织中的表达高于肺腺癌组织(英文)被引量:2
- 2014年
- 目的研究比较AXL在肺腺癌(lung adenocarcinoma,LAD)和正常及癌旁组织中的表达。方法通过文献检索和数据库查询,得到了21套人LAD组织基因芯片表达谱,其中18组数据来源于NCBI的GEO数据库。共包含1 060例LAD组织及正常组织(或癌旁组织),对这些数据进行了AXL基因表达的Meta分析。进一步用包含48例LAD及每例相对应的癌旁组织的人LAD组织芯片进行了AXL蛋白的检测。结果Meta分析数据表明,在LAD癌旁组织中,AXL的表达量显著高于LAD组织(Z=-7.21,P<0.0001);而在正常组织中,AXL的表达量与LAD中相比差异无统计学意义(Z=-1.62,P=0.106)。LAD组织芯片水平的研究表明,与癌旁组织相比,LAD组织中AXL蛋白量显著降低(P=0.005)。结论 AXL在癌旁组织中的表达高于LAD组织,其意义有待进一步研究。
- 朱杏丽陈诚文杨秀方褚凯丽李瑶黄燕
- 关键词:AXLMETA分析癌旁组织