邓阳 作品数:13 被引量:40 H指数:4 供职机构: 第二军医大学 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 山东省自然科学基金 国家重点基础研究发展计划 更多>> 相关领域: 医药卫生 化学工程 更多>>
一个跖骨短小症家系全基因组测序研究 2018年 目的对一个跖骨短小症家系的成员进行全基因组测序,探究其可能的致病因素。方法应用Illumina Hi Seq X ten测序平台对一个跖骨短小症家系中2例病例和3例正常人进行测序,测序数据经过1 000 Genomes Project和db SNP数据库过滤,筛选出突变基因。结果跖骨短小症呈X染色体隐性遗传。在X染色体上得到1 527个特异性单核苷酸多态性位点(single nucleotide polymorphism,SNP)。没有筛选到符合条件的特异性小片段的插入/缺失(insertion/deletion,In/del)。经过1 000 Genomes Project和db SNP数据库比对后,得到位于11个基因上的39个特异性SNP位点,包括CCNB3、CYSLTR1、GK、NR0B1、PCYT1B、PRPS2、SHROOM4、SMS、TBL1X、TLR7、TLR8基因。结论这些基因SNP位点在我国汉族人群中也是存在的,提示本家系疾病并非单纯由遗传因素导致。 邓阳 龚弘强 李宝华 侯海峰 焦凤萍 李群伟关键词:全基因组测序 致病因素 家系 肱骨短小症致病相关基因及其变异的筛选与验证 被引量:2 2016年 目的寻找肱骨短小症的特异致病基因及其变异。方法利用全基因组重测序技术,采用Illumina Hi Seq X ten测序系统检测3例肱骨短小症患者和3例正常对照者全基因组,测序数据经过1000 Genomes Project和db SNP数据库过滤,将测序所得的特异性单核苷酸多态性位点(SNP)在全部患者和对照者中验证,并通过GO和KEGG Pathway分析,筛选致病相关的重要候选基因及变异。结果肱骨短小症患者没有特异致病基因,但具有31个特异性SNP,其中PLCB4rs6077510和PLAU rs2227564变异与肱骨短小症发病密切相关。结论肱骨短小症不是遗传病。但其发病与PLCB4和PLAU基因多态性有关,可能是本病发病的重要机制。 邓阳 李宝华 侯海峰 焦凤萍 龚弘强 李群伟关键词:单核苷酸多态性 致病基因 肝细胞癌外周血淋巴细胞中参与关键HBV变异选择的关键分子预测及网络构建 肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma, HCC)居全球最常见肿瘤的第6位及肿瘤相关死亡的第3大常见原因。超过50%的HCC病例发生在我国,HCC的发生受环境因素、病毒因素和机体遗传因素等综合影响。H... 邓阳关键词:肝细胞癌 外周血淋巴细胞 基因芯片 免疫选择 文献传递 2009-2014年山东省泰安市居民原发性肝癌生存状况分析 被引量:7 2016年 目的我国为原发性肝癌(primarylivercancer,PLC)的高发地区,且山东省1970—2005年肝癌死亡率呈上升趋势。本研究探讨影响山东省泰安市居民PLC患者生存状况的独立危险因素,为PLC防治和预测PLC患者预后提供依据。方法利用2009—2014年山东省泰安市辖区内监测登记报告的PLC发病及死亡患者资料,应用Kaplan-Meier法、Log-rank检验和Cox回归比例风险模型,分析性别、职业、家庭住址、TNM分期、发病年龄和手术治疗与否对PLC患者生存状况的影响。结果共纳入4856例PLC患者,其中男性3498例,平均发病年龄为(60.94±13.49)岁;女性1358例,平均发病年龄为(69.01±14.29)岁。单因素分析显示,男性和女性之间的生存时间差异有统计学意义,χ2=25.511,P〈0.001;体力劳动者和非体力劳动者之间的生存时间差异有统计学意义,χ2=43.786,P〈0.001;家庭住址位于城市和农村患者的生存时间差异无统计学意义,χ2=1.352,P=0.245;TNM高(Ⅲ+Ⅳ期)和低(Ⅰ+Ⅱ期)分期者的生存时间差异有统计学意义,χ2=66.728,Pd0.001;高(〉65岁)、中(44~65岁)和低(〈44岁)发病者年龄的生存时间差异有统计学意义,χ2=86.422,P〈0.001;手术和未手术治疗者的生存时间差异有统计学意义,χ2=71.394,P〈0.001。Cox多因素分析显示,TNM高分期、高发病年龄与未手术治疗是影响PLC患者总体生存期的独立危险因素,P〈0.001。结论TNM高分期、高发病年龄与未手术治疗是影响PLC患者总体生存期的独立危险因素,手术治疗和肿瘤早发现是改善PLC患者预后的关键。 邓阳 陈清梅 陈睿关键词:原发性肝癌 预后 干骺端骨发育障碍一例报告 被引量:1 2015年 李群伟等报道,西藏局部地区发现一种命名为"肱骨短小症"的特殊骨发育不良疾病,其突出临床体征为肱骨短小[1,2]。2011年9月,笔者在对肱骨短小症进行流行病学调查时发现1例多发性骨疣病例[3],2014年9月再次调研时还发现跖骨短小1家系2例[4],同时,又发现1例干骺端骨发育障碍(Metaphyseol dysostosis)患者,现报告如下。1病例女,藏族,19岁,未婚。 李群伟 索朗次登 边巴次仁 李宝华 龚红强 邓阳关键词:干骺端 发育障碍 软骨发育不全 管状骨 膝内翻 APOBECs家族成员在癌症进化发育过程中的核心作用 被引量:3 2014年 癌症形成于促炎症状态的微环境之中,遵循着"变异-选择-适应"的达尔文进化规律。这一过程的遗传学基础是体细胞突变的产生与积累。目前,大量体细胞突变的产生机制以及环境压力下变异细胞的自然选择过程尚不明确。载脂蛋白B mRNA编辑酶催化多肽(apolioprotein B mRNA-editing enzyme catalytic polypeptide,APOBEC)家族是一类高效的胞苷脱氨酶,其转录可被促炎症细胞因子和趋化因子激活,并在人体的固有和获得性免疫机制中发挥重要作用。APOBECs家族在抑制病毒复制的同时,也驱使有促癌作用的病毒突变体形成;其基因编码功能还可以诱发有促癌作用的驱动突变产生。作为在炎-癌转化中发挥桥梁作用的标志性酶,APOBECs家族对癌症的进化发育至关重要。 刘文斌 邓阳 于浩义 曹广文关键词:胞苷脱氨酶 肿瘤 进化 肝细胞癌组织中APOBEC3s类胞苷脱氨酶基因家族成员的表达观察 被引量:1 2018年 目的观察载脂蛋白B mRNA编辑酶催化多肽3(APOBEC3s)类胞苷脱氨酶基因家族成员在肝细胞癌(HCC)组织中的表达变化,并探讨其意义。方法分别采用实时定量PCR和免疫组化法检测155例HCC患者癌组织和癌旁组织中的APOBEC3s类胞苷脱氨酶基因家族成员A3A、A3B、A3C、A3D、A3F、A3G、A3H的mRNA和蛋白。以癌组织中APOBEC3s类胞苷脱氨酶基因家族成员mRNA相对表达量的中位数为界,将155例HCC患者分为高表达组和低表达组,并分析APOBEC3s类胞苷脱氨酶基因家族各成员mRNA相对表达量与HCC预后的关系。结果 HCC患者癌组织中APOBEC3s类胞苷脱氨酶基因家族成员A3A、A3B、A3C、A3D、A3F、A3G、A3H mRNA相对表达量分别为4. 08±0. 11、6. 61±0. 17、6. 42±0. 10、5. 29±0. 12、6. 64±0. 12、7. 49±0. 07、4. 32±0. 08,HCC患者癌旁组织中APOBEC3s类胞苷脱氨酶基因家族成员A3A、A3B、A3C、A3D、A3F、A3G、A3H mRNA相对表达量分别为2. 93±0. 11、4. 60±0. 11、5. 48±0. 11、5. 22±0. 08、6. 97±0. 08、5. 91±0. 12、4. 21±0. 10,癌组织与癌旁组织中A3A、A3B、A3C、A3G mRNA相对表达量相比,P均<0. 05。HCC患者癌组织中APOBEC3s类胞苷脱氨酶基因家族成员A3A、A3B、A3C、A3D、A3F、A3G、A3H蛋白阳性表达率分别为92. 3%、96. 8%、89. 0%、58. 1%、69. 7%、85. 9%、52. 9%,HCC患者癌旁组织中APOBEC3s类胞苷脱氨酶基因家族成员A3A、A3B、A3C、A3D、A3F、A3G、A3H蛋白阳性表达率分别为61. 3%、63. 2%、57. 4%、61. 9%、74. 8%、47. 7%、47. 7%,癌组织与癌旁组织中A3A、A3B、A3C、A3G蛋白阳性表达率相比,P均<0. 05。155例HCC患者癌组织中A3A mRNA低表达者、高表达者5年生存率分别为27. 3%、17. 7%,两者相比,P <0. 05; A3B mRNA低表达者、高表达者5年生存率分别为30. 0%、17. 1%,两者相比,P <0. 05; A3G mRNA低表达者、高表达5年生存率分别为33. 6%、13. 7%,两者相比,P <0. 05。结论APOBEC3s类胞苷脱氨酶基因家族成员A3A、A3B、A3C� 陈清梅 陈睿 邓阳关键词:肝肿瘤 肝细胞癌 西藏大骨节病特征性病变原因及新临床亚型的流行病学意义 被引量:6 2016年 西藏大骨节病的临床表现与内地有很大差异,表现为大关节的严重畸形,其中尤以下肢为重,重者导致瘫痪。而且大骨节病有新的临床亚型,既往未被人们所认识。其临床表现特殊,即以"肱骨短小、身材矮小和手足正常"为主要临床表现。本文讨论了西藏大骨节病临床病变的可能原因及大骨节病新临床亚型在病因研究、病情监测和现场防治的流行病学意义。 李群伟 龚弘强 邓阳 侯海峰 李宝华 焦凤萍关键词:大骨节病 流行病学 HLA--DR等免疫相关分子在乙肝病毒变异选择和致癌过程中的作用研究 目的: 研究HLA-DR单核甘酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)与HBV感染慢性化和致HCC的相关性及HLA-DRSNP与致癌HBV突变在HCC发生中的交互作用;阐明免疫组... 邓阳关键词:致病机制 人类白细胞抗原-DR 单核甘酸多态性 PTPRD rs2279776及其与HBV变异的交互作用对肝细胞癌风险的影响 2013年 目的探讨PTPRD遗传多态性rs2279776及其与HBV变异的交互作用和肝细胞癌(HCC)发生风险的关联性。方法采用实时定量PCR对1012例健康对照(对照组)、990例非肝细胞癌HBV感染者(非癌HBV感染组)及1021例乙型肝炎后肝细胞癌患者(HCC组)进行PTPRDrs2279776多态性检测,应用PCR测序法分别测定HBV核心启动子区及前s区变异。采用多因素logistic回归分析rs2279776、HBV变异及它们之间的交互作用和HCC发生风险的关联性。结果rs2279776基因型和等位基因频率的分布在HCC组与对照组之间、HCC组与非癌HBV感染组之间以及HCC组与非癌组(非癌HBV感染组+对照组)之间的差异均无统计学意义。而rs2279776GC基因型与HBV变异T1753V和preS缺失的交互作用显著增加女性HBV感染者患HCC的风险。rs2279776GC基因型与HBVG1896A变异的交互作用可以降低HBV基因型B感染者患HCC的风险;CC基因型与HBVAl652G变异的交互作用可以显著降低基因型CHBV感染者患HCC的风险。结论PTPRDrs2279776与HCC易感性无直接相关性,但可通过与HBV变异的交互作用对HCC发生风险产生影响。 邓阳 张琪 张玉伟 韩雪 曹广文关键词:肝细胞癌 乙型肝炎病毒 单核苷酸多态性