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EMA-PCR法快速检测啤酒中腐败短乳杆菌被引量：4: 2017年; 将叠氮溴乙锭(ethidium bromide monoazide,EMA)与聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)技术相结合,以酒花耐受基因hor C为靶基因,用啤酒腐败短乳杆菌基因组DNA作为模板进行扩增。结果发现,在前处理过程中加入EMA,当终质量浓度小于20μg/m L时,对活的短乳杆菌中靶基因的扩增没有明显抑制作用;而当EMA终质量浓度为1.0μg/m L时可有效抑制10~5 CFU/m L短乳杆菌死细胞的扩增。本实验建立的EMA-PCR检测方法的灵敏度为10~4活细胞/m L酒液样品。验证实验结果表明,在13株乳酸菌中,建立的hor C特异性EMA-PCR能有效检测到其中的全部5株啤酒污染菌,同时可区分这5株菌的活/死细胞混合体系,降低检测过程中的假阳性。; 马艳琳徐振波刘君彦汪东风邓阳; 关键词：聚合酶链式反应啤酒腐败菌短乳杆菌

金黄色葡萄球菌基因组岛对多重耐药表型与生物被膜能力的影响机制被引量：1: 2015年; 本文选择常见的典型食源性微生物金黄色葡萄球菌,从耐药性微生物感染防控角度出发,对广州地区临床分离的127株葡萄球菌的耐药表型、基因组岛分型与生物被膜生长能力进行研究。通过微量肉汤稀释法检测确定菌株对26种抗菌药物的药敏结果;PCR扩增葡萄球菌属特异性基因16S r RNA、金黄色葡萄球菌菌株特异性基因fem A、耐药基因mec A以检测确定菌株耐药特性;多重PCR检测金葡菌基因组岛SCCmec基因元件中ccr复合物,mec复合物以对其进行分型。107株耐药型金葡菌均为多重耐药,且呈耐9种或以上抗生素占76.1%(86/113)。113株葡萄球菌SCCmec分型结果为:I型0株,II型12株,III型73株,IV型10株,V型11株,5株为无法分型;本文对基因组岛和金黄色葡萄球菌耐药表型与生物被膜能力的相关性进行分析与探讨,为进一步对各种食源性微生物引起的食品污染进行安全控制,提供了研究基础。; 邓阳梁晏瑞苗健李琳李冰徐振波; 关键词：金黄色葡萄球菌多重耐药性生物被膜防控措施

基因组De novo组装结合比较RNA-Seq策略在VBNC状态乳杆菌转录组学研究中的应用被引量：3: 2016年; 本文应用有参考基因组组装策略对一株提取自啤酒中的乳杆菌的两种生理状态进行转录组学分析。利用基因组测序技术得到此株乳杆菌的全部基因组信息之后,把此株乳杆菌用低温诱导至VBNC状态,对正常状态和VBNC状态乳杆菌提取总RNA。对RNA质量进行验证,将符合要求的RNA进行逆转录形成c DNA,之后进行文库构建和Solexa测序。通过相关指标对测序结果进行评估,之后以此前获得的全基因组序列为对照,进行转录组与基因组的序列比对和基因表的达差异分析。结果显示比对率大于95%,表达上调的基因有21个,表达下降的基因有7个。本文所应用的基因组De novo组装结合比较RNA-Seq策略与常规De novo RNA-Seq策略相比,省却De novo拼接与组装的繁琐步骤,具有更高的准确性,为今后食品微生物在不同生理状态中分子调控机制的研究提供重要基础。; 徐振波侯玉超刘君彦邓阳张霞李冰李琳; 关键词：乳杆菌转录组 VBNC

细菌的VBNC状态及在研究啤酒易感微生物中的探索: 2013年; VBNC（viable but non-culturable）是指处于“活的但不可培养”状态的微生物体，此时微生物细胞仍具有代谢活性。但用常规方法较难或无法分离培养。VBNC作为一种生理状态．对传统微生物学产生了深远的影响，同样在改进啤酒易感微生物尤其是难培养有害菌的检测方面具有十分重要的意义。本文从形成机理、种类、最新的检测方法以及复苏过程等方面综述了VBNC状态菌的生物学特性。旨在深入了解和认识VBNC菌。从而对VBNC状态下啤酒易感微生物的检测与防控起到积极作用。; 邓阳李惠萍李琳涂京霞房慧婧陈江; 关键词：VBNC 生物学特性

De novo测序技术在啤酒易感乳杆菌全基因组研究中的应用被引量：2: 2015年; 本文应用De novo测序技术对一种未经测序的啤酒易感乳杆菌进行全基因组研究,包括全基因组遗传信息的首次获取以及基因功能的生物信息学分析与注释。通过对1株从啤酒中分离获得的乳杆菌基因组DNA进行提取与纯化,构建了符合质量要求的测序文库,并进行了De novo测序;通过对De novo测序数据进行筛选与质量评价,进一步对筛选后的数据进行了De novo组装与结果评价,最后获得乳杆菌全基因组序列;在获得全基因组序列的基础上,对全基因组序列进行基因预测,并对预测基因进行GO基因功能注释、COG基因功能注释与KEGG生物通路注释,获取了该乳杆菌的基因序列与基因功能信息。该乳杆菌全基因组测序数据与组装结果良好,获得的序列中共有1,824个预测基因,其中分别有545、1,303、120条预测基因有相应的GO、COG、KEGG注释。本研究为该啤酒易感乳杆菌功能基因的研究与生物信息学分析提供了基础数据和技术参考。; 刘君彦李琳李冰邓阳徐振波; 关键词：DE

食源性微生物MRSA及其检测方法在食品安全中的研究进展被引量：6: 2015年; 食品安全在世界卫生组织的定义是指所有食品中有毒、有害物质对人体健康影响的公共卫生问题。2008年"三聚氰胺"事件后,在近几年的全国两会上,食品安全问题连续成为焦点话题;而同期全国人大常委会通过的《食品安全法》,更显示了食品安全的严重与令人担忧,其监测与控制显得迫在眉睫。作为典型的食源性微生物,金葡菌尤其是耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(Methicillin-resistant Staphylococcus aureus,MRSA)其新型的耐药特点显示了细菌耐药性的发展和进化可能是由于大量抗生素在畜牧业中的滥用而造成的。由于抗菌药物的研制周期跟不上耐药性出现的速度,使得细菌治疗面临越来越严峻的考验,甚至出现无药可用的情况,严重威胁人类健康。本文结合食品安全抗生素滥用问题与最近出现的超级细菌耐药问题,根据在相关领域多年的研究数据,对常见的食源性微生物MRSA及其检测方法在食品安全中的研究进展进行综述。; 邓阳刘晓晨李冰李琳徐振波; 关键词：食品安全

"活的但不可培养"状态有害片球菌的形成及复苏研究: 有害片球菌(Pediococcus damnosus)是报道可引起啤酒污染的一种主要且破坏力较大的一类腐败菌.本文采用低温储藏和啤酒内连续传代驯化两种方法分别诱导获得进入VBNC 状态的P.damnosus.细菌总数在整...; 邓阳刘君彦房慧婧李惠萍李琳; 关键词：啤酒腐败菌

VBNC状态啤酒易感乳杆菌的诱导及复苏被引量：4: 2014年; 本文研究了一种典型的难培养啤酒易感乳杆菌-耐酸乳杆菌(Lactobacillus acetotolerans)形成"活的但不可培养"(VBNC)的诱导方式,以及从此状态复苏至可培养状态的方法。将培养至对数期的耐酸乳杆菌2011-11菌株采用啤酒内连续传代驯化法还原其在啤酒酿造过程中的实际生存状况,并通过荧光染料染色对诱导后的耐酸乳杆菌细胞进行活性检测;利用逐步升温和添加促进物法对VBNC菌进行复苏试验。当连续传代至第19代,MRS检测平板上可培养菌数降为零,此时菌体多数仍存在呈现绿色荧光的活细胞,表明耐酸乳杆菌已形成VBNC状态,且仍具有污染啤酒能力;将刚进入VBNC状态的耐酸乳杆菌菌悬液经过氧化氢酶处理后涂布于MRS平板,于26℃厌氧培养,可使耐酸乳杆菌复苏至可培养状态。本研究证实,可通过啤酒内连续传代诱导获得VBNC状态耐酸乳杆菌,而添加过氧化氢酶改良常规MRS平板是一种有效的复苏方法。; 邓阳刘君彦房慧婧陈江李惠萍李琳涂京霞刘静冯智坚; 关键词：过氧化氢酶

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邓阳

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