王冬阳
- 作品数：2 被引量：4H指数：2
- 供职机构：上海交通大学更多>>
- 发文基金：上海市科学技术委员会科研基金更多>>
- 相关领域：医药卫生自动化与计算机技术更多>>
- 基于癌症基因组图谱数据分析筛选结肠癌预后相关长链非编码RNA被引量：2
- 2020年
- 目的:通过分析癌症基因组图谱(TCGA)数据库中有关结肠癌的转录组测序数据,筛选结肠癌预后相关长链非编码RNA(lncRNA),寻找新的lncRNA结肠癌分子标志物。方法:下载TCGA数据库中结肠癌转录组测序数据及结肠癌患者临床资料,利用R语言进行数据整理。采用edgeR包筛选差异表达lncRNA,采用单因素Cox回归模型对差异表达lncRNA进行生存分析。提取与这些lncRNA共表达的编码基因,行京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析。结果:差异表达分析共筛选出227个在肿瘤各TNM分期中均异常表达的lncRNA,其中表达上调169个,表达下调58个。生存分析鉴定出15个差异表达lncRNA与预后显著相关(P<0.05),其中2个为保护因素,13个为危险因素。KEGG分析发现,这些预后相关lncRNA的共表达基因主要富集在核糖体生物合成、mRNA监视通路等。结论:通过挖掘TCGA结肠癌数据集,发现了一些具有预后意义的异常表达lncRNA,为后续深入研究其功能奠定了基础,这些lncRNA有望成为新的结肠癌诊断或治疗分子标志物。
- 闫军浩郭魁元吴万庆罗昭峰杨战锋王冬阳王争
- 关键词：结肠癌长链非编码RNA预后
- 面向云计算的异常检测技术的研究与实现
- 云计算在可靠性问题上面临着巨大的挑战。随着越来越多的个人和企业将信息放在云上,如何提高云计算的可靠性成为一个研究热点。而云计算平台上丰富的信息和资源也是各种入侵者的热点目标。云计算体系的每一层结构都面临着各种危险,可能是...
- 王冬阳
- 关键词：云计算异常检测局部异常因子
- 文献传递
