李臻鹏
- 作品数：9 被引量：8H指数：2
- 供职机构：中国疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金中国初级卫生保健基金会佑安肝病/艾滋病基金首都卫生发展科研专项更多>>
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- HIV-1CRF_07BC重组型逆转录酶区耐药进化通路分析被引量：4
- 2014年
- 目的 探讨HIV-1的CRF_07BC重组型在药物压力下的进化通路,并与B亚型进行比较.方法 病毒样本来自2007-2011年新疆维吾尔自治区和四川省参加艾滋病多中心队列研究的共862例AIDS患者.根据未治疗的588例和治疗的274例AIDS患者病毒样本的逆转录酶区序列,采用选择压力的方法识别耐药相关位点,使用贝叶斯网络法构建CRF 07BC重组型在抗病毒治疗下的耐药进化通路,同时利用国际HIV耐药数据库中的数据构建B亚型在相同治疗方案下耐药进化通路,并与CRF_07BC重组型进行比较.结果 预测的CRF_07BC重组型主要耐药位点为K103N、Q197K、V179D和Y188L.预测的B亚型主要耐药位点为M184V、K103N、Y181C、T69N、G190A、K238T、Y188H和P225H.两者重叠较小,但经典的TAM1（41L、210W和215Y）和TAM2（67N、70R和219E/Q）通路均存在于两个病毒类型中.不同于B亚型的是,预测的CRF_07BC重组型的主要耐药位点中不包含TAM相关突变,并且在核苷类药物相关突变与非核苷类药物相关突变之间存在强的依赖关系.结论 HIV-1 CRF_07BC重组型形成了以K103N、Q197K、V179D和Y188L为主要耐药位点的独特耐药进化通路,并与B亚型的耐药进化通路有较大差异.
- 李臻鹏黄洋欧阳雅博邢辉廖玲洁邵一鸣马丽英
- 关键词：生物进化
- 一种引物组合及在制备盖尔森基兴诺卡菌复合群检测试剂盒中的应用
- 本发明提供了一种引物组合及在制备盖尔森基兴诺卡菌复合群检测试剂盒中的应用，所述引物组合包括以盖尔森基兴诺卡菌的NCTC10797_05230为靶基因、宁夏诺卡菌的IU407_RS05750为靶基因，和/或以银川诺卡菌的N...
- 李振军徐帅李臻鹏
- 基于重组酶聚合酶扩增技术快速检测霍乱弧菌中SXT元件被引量：3
- 2022年
- 目的利用重组酶聚合酶扩增技术与测流层析相结合方法建立霍乱弧菌中SXT元件的快速检测方法。方法基于SXT元件的保守区设计重组酶聚合酶扩增方法的引物及探针,评价该方法的特异度及灵敏度。结果该方法可检测核酸浓度最低为20拷贝/μl,与实时荧光定量PCR方法的检测下限相近,且特异性较好。结论该检测方法操作简单,特异性良好,敏感度高且无需大型精密实验设备,适合现场使用。
- 陈家良卢盼王鲁彦闫悦李臻鹏逄波
- 关键词：霍乱弧菌
- HIV-1 CRF_BC重组亚型耐药相关新突变位点的复制动力学研究
- 2015年
- 目的研究HIV-1CRF_BC重组亚型逆转录酶（RT）区耐药相关新突变位点1132L、T139K／R对非核苷类逆转录酶抑制剂（NNRTIs）药物敏感性和病毒复制动力的影响。方法通过点突变的方法将HIV-1B亚型感染性克隆PNL4—3RT区的第132位和第139位氨基酸分别突变为亮氨酸（L）和苏氨酸（T）／精氨酸（R），与本课题组已经构建的HIV．．CRF07-BC亚型RT区1132L和T139K／R突变感染性克隆，共同转染293T细胞系进行病毒包装并检验病毒感染性。检测突变病毒对于NNRTIs的药物f依曲韦林（TMC-125）、地拉夫定（DLV）、奈韦拉平（NVP）、依非韦伦（EFV）]敏感性，及其复制动力学特征。结果通过点突变的方法成功构建感染性克隆PNL4-3-RT—1132L、PNL4—3-RT．T139K和PNL4—3-RT—T139R。1132L和T139K／R在B亚型和CRF07-BC亚型中均能降低HIV．1对于NNRTIs的药物敏感性，体现为半数有效浓度（EC50）的升高。在CRF07-BC亚型中，1132L分别使EC50升高2．55、19．35、28．05和6．13倍；T139K分别使EC50升高4．67、3．66、7．35、3．30倍；T139R分别使EC50升高1．82、4．69、25．12和1．89倍；在B亚型中，1132L分别使EC50升高3．91、4．61、6．38和3．56倍；T139K分别使EC50升高3．13、1．78、2．26和2．10倍；T139R分别使EC50升高5．79、3．99、5．78和2．75倍。PNL4．3．RT-132L／139K／139R与野毒株PNL4—3的复制速度相近，且P24均在第11天达到峰值。但与对照株BC—wT相比，BC—RT—1132L／T139R推迟了P24到达峰值的时间，BC—RT-T139R的P24值在第14天达到峰值，BC—RT-I132L在第21天达到峰值，且峰值略低。结论HIV-1CRF_BCRT区新的耐药相关位点1132L和T139K／R在B亚型及CRF07-BC亚型感染性克隆上均可降低病毒对NNRTIs的药物敏感性，1132L在CRF_07BC亚型的感染性克隆上能够降低病毒的复制能力。
- 焦洋黄洋李书明李臻鹏王彦殷倩倩马丽英
- 关键词：HIV-1药物敏感性
- 一种引物组合及在制备盖尔森基兴诺卡菌复合群检测试剂盒中的应用
- 本发明提供了一种引物组合及在制备盖尔森基兴诺卡菌复合群检测试剂盒中的应用，所述引物组合包括以盖尔森基兴诺卡菌的NCTC10797_05230为靶基因、宁夏诺卡菌的IU407_RS05750为靶基因，和/或以银川诺卡菌的N...
- 李振军徐帅李臻鹏
- 我国HIV-1流行株CRF07_BC和B'耐药进化研究
- HIV-1CRF07_BC和HIV-1B亚型是我国艾滋病的主要流行病毒。尽管抗病毒治疗能够延长HIV-1感染者的生存寿命、有效的减少艾滋病的传播,但HIV耐药性的产生不仅导致了抗病毒治疗失败,而且增加了耐药病毒株传播的风...
- 李臻鹏
- 关键词：HIV-1耐药模式抗病毒治疗
- 文献传递
- 用于产毒型霍乱弧菌血清群O1和O139鉴定的试剂盒和方法
- 本发明涉及微生物检测技术领域，具体涉及用于产毒型霍乱弧菌血清群O1和O139鉴定的试剂盒和方法。本发明提供的用于产毒型霍乱弧菌血清群O1和O139鉴定的试剂盒包含引物组、crRNA、CRISPR‑Cas蛋白和ssDNA报...
- 卢盼逄波李臻鹏李哲阚飙
- 不同治疗效果的艾滋病患者抗病毒治疗前HIV-1 gp120准种特征差异被引量：1
- 2017年
- 目的探讨HIV-1 gpl20准种在不同治疗效果的艾滋病患者抗病毒治疗前的特征差异。方法回顾性收集治疗方案为AZT＋NVP＋3TC的艾滋病患者在抗病毒治疗前的血浆样本，包括病毒抑制（vs）组12例，治疗失败（TF）组12例。采用单基因组扩增技术获得gp120准种序列，分析比较遗传多样性、氨基酸长度、潜在糖基化位点及特征性氨基酸的特点。结果本研究共获得gpl20序列365条序列，其中vs组168条（6-20条），TF组197条（7-28条）。TF组的gpl20准种复杂度高于vs组，差异有统计学意义（P=O．003）；TF组的gpl20准种ds及dN中位数均高于vs组（P=0．017；P=0．002）。TF组HIV-1准种gpl20氨基酸长度长于VS组（P=0．001）。TF与vs组的gpl20准种相比共有9个氨基酸位点存在明显差异，多数分布在V1/V2区（6／9，66．6％）。结论不同治疗效果的艾滋病患者治疗前的HIV-1gpl20准种基因特征存在差异，TF组患者来源的HIV-1准种遗传多样性更高。
- 欧阳雅博孔德生王彦王琛李臻鹏焦洋殷倩倩陈德喜马丽英
- 关键词：GP120准种
- HIV-1 B'病毒包膜蛋白序列特征与广谱中和活性相关性的初步分析
- 目的 探讨HIV-1 B'亚型感染者广谱中和活性样本膜蛋白(env)基因的序列特征.方法 应用基于HIV-1 env假病毒的TZM-bl中和抗体分析技术筛选有广谱中和活性的样本,采用SGA方法对env基因进行扩增,并分析...
- 胡园园陈燕丽胡新韬李臻鹏马丽英邵一鸣洪坤学
