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徐波: 作品数：11 被引量：46H指数：5; 供职机构：福建农林大学作物科学学院作物遗传育种与综合利用教育部重点实验室更多>>; 发文基金：国家自然科学基金福建省自然科学基金贵州省自然科学基金更多>>; 相关领域：生物学农业科学更多>>

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聚丙烯酰胺凝胶电泳技术的改进及其在cDNA-AFLP分析中的应用被引量：9: 2007年; 利用电解质梯度变性聚丙烯酰胺凝胶电泳系统对稻纵卷叶螟取食的水稻叶片进行cDNA-AFLP分析,结果表明产生的cDNA条带比普通变性聚丙烯酰胺凝胶电泳系统大约增加30%,解决了传统的聚丙烯酰胺凝胶电泳在同一块胶板中大片段DNA条带堆积而小片段DNA条带间距过大,且读带数量有限的问题..; 曹蕾徐波朱万里张国华黄木坤应辰哲何水林; 关键词：聚丙烯酰胺凝胶电泳 CDNA-AFLP

辣椒抗菌蛋白cDNA的分离与表达的初步分析: 2007年; 本研究从经辣椒疫霉侵染处理的辣椒叶片cDNA文库中分离获得了一个辣椒抗菌蛋白cDNA阳性克隆,其长度为255bp,含有长度为85个氨基酸的开放读码框架,与其它植物抗菌蛋白或几丁质酶有不同程度的同源性,推测为辣椒抗菌蛋白,命名为CansLTPS.cDNA-AFLP分析表明,CansLTPS的转录受UV-B照射和辣椒疫霉侵染的诱导,外源脱落酸(ABA)、乙烯(ETH)、水杨酸(SA)等可不同程度的诱导CansLTPS基因的转录,而MeJA处理对CansLTPS基因的转录表达影响不大,表明CansLTPS基因可应答生物和非生物逆境胁迫,其上游可能涉及ABA、ETH、SA等介入的信号传递途径.; 邱敏曹蕾贺俐王育娜徐波许先松赖燕林明何水林; 关键词：辣椒抗菌蛋白 CDNA克隆基因表达

水稻叶片cDNA-AFLP选择性扩增反应体系的优化被引量：11: 2008年; 在水稻Oryza sativa叶片响应稻纵卷叶螟Cnaphalocrocis medinalis取食后的cDNA-AFLP试验中,对25μL体系中预扩增和选择性扩增的引物浓度、dNTP浓度、镁离子浓度及TaqDNA聚合酶用量4种反应条件影响因子进行不同梯度的优化研究。结果表明,PCR选择性扩增反应时,总反应液25μL体系中引物浓度为0.2μmol/L、dNTP浓度为0.2mmol/L、镁离子浓度为2.0mmol/L、TaqDNA聚合酶用量为13.336n kat/25μL时,可得到更多鲜明可辨的TDFs。; 曹蕾林明王育娜许先松赖燕徐波何水林; 关键词：水稻 CDNA-AFLP

胡萝卜根中特异性表达基因的cDNA-AFLP分析: 2009年; 胡萝卜是一种具有重要保健功能的蔬菜,其块状根系富含胡萝卜素等多种营养物质,可开发作为生物反应器。以转基因胡萝卜根作为生物反应器生产生物活性成分需要应用其根部高效、特异性表达的启动子。本研究应用cDNA-AFLP分析胡萝卜根、叶中基因的差异表达,获得32个在根中高效表达而在叶中不表达的转录衍生片段(TDF)。测序和同源比对分析结果表明,其中有20个TDF在基因库中未发现同源基因,其他12个分别是推定的植物激素抑制蛋白、金属硫因-1蛋白及其他有关基因。; 刘志钦徐波贺俐林明周忞牟少亮官德义何水林; 关键词：胡萝卜差异基因 CDNA-AFLP

辣椒疫霉作用下叶绿素a/b结合蛋白的表达被引量：4: 2008年; 从基于cDNA-AFLP分析的辣椒应答疫霉侵染的表达谱中找到1个特异表达基因的序列;利用这个序列设计引物,采用基于PCR技术的96孔文库筛选方法,从疫霉处理的辣椒cDNA文库中筛选出这个应答辣椒疫霉侵染的候选基因的全长cDNA;经生物信息学分析,推测这个长度为1022 bp的候选基因为辣椒叶绿素a/b结合蛋白(chlorophyll a/b binding protein,cab)基因;并利用荧光定量PCR法检测cab在疫霉侵染下的表达情况。; 林明贺俐徐波官德义牟少亮何水林; 关键词：辣椒辣椒疫霉 CDNA-AFLP 实时荧光定量PCR

疫霉侵染的辣椒cDNA文库的构建及非特异性脂转移蛋白cDNA的筛选被引量：5: 2009年; 建立了辣椒疫霉侵染的辣椒幼苗cDNA文库,该原始文库含有1.5×106个独立克隆,插入片段约为0.5-2 kb.采用基于PCR技术的96孔文库筛选方法,从该cDNA文库中筛选出了1个应答辣椒疫霉侵染的候选基因的全长cDNA.经生物信息学分析,推测这个候选基因为非特异性脂转移蛋白(non-specific lipid-transfer protein,nsLTP)基因.; 林明贺俐徐波刘志钦王育娜官德义马洪丽何水林; 关键词：辣椒辣椒疫霉 CDNA文库非特异性脂转移蛋白

辣椒应答UV-B的转录组差异分析及相关功能基因的分离: 辣椒是我国重要的蔬菜以及工业加工原料作物，近年来发展辣椒生产已经成为我国各地农业增效和农民增收的一条有效的途径，但在栽培过程中，各种生物与非生物产生的逆境胁迫，对辣椒的产量与品质造成严重的影响，研究表明，UV-B(Ult...; 徐波; 关键词：转录组功能基因; 文献传递

疫霉侵染辣椒基因差异表达的cDNA-AFLP分析被引量：5: 2015年; 采用cDNA-AFLP(complementary DNA-amplified fragment length polymorphism)技术,以高抗疫霉病辣椒品种‘L11’接种疫霉菌的叶片为材料,对6叶期辣椒幼苗灌根接种疫霉菌侵染后6个时间点的叶片基因表达谱进行了差异分析。利用86对引物组合,共筛选出了363条差异表达的cDNA片段,对其中100个表达差异显著的片段进行测序,最终得到73个差异片段的核苷酸序列。经Blastx比对和功能分类分析,其中45个序列与已报道的功能基因具较高同源性,其功能涉及蛋白质代谢、信号转导、防御反应、碳水化合物代谢和光合作用等。在差异片段序列基础上设计特异引物,采用基于PCR技术的96孔文库筛选方法,从文库中分离得到2个差异基因的全长cDNA,荧光定量PCR分析结果显示其表达模式符合cDNA-AFLP表达谱。本研究利用c DNA-AFLP技术筛选到的一批与抗疫霉病相关的基因片段,可进一步用于功能鉴定和分子育种。; 贺俐徐波黄子君何水林吴杨; 关键词：疫霉 CDNA-AFLP

辣椒应答疫霉差异表达基因cDNA分离技术平台建立与应用被引量：1: 2010年; 植物在逆境胁迫下大量基因的表达往往会发生改变,最终导致对逆境的诱导抗性。剖析逆境作用下差异表达基因的功能是阐明植物抗逆分子机制的重要途径,而获得逆境作用下差异表达基因的全长cDNA是上述研究的基础。建立获得辣椒应答疫霉侵染差异表达基因全长cDNA的技术平台:利用抑制性差减杂交技术构建辣椒叶片在疫霉侵染下的SSH文库,随机挑取150个克隆测序,获得24个功能已知的序列,BLASTN分析发现这些差异表达基因从功能上可分为能量代谢过程、信号传递、光合作用、抗逆反应等几种类型;利用DSN(duplex-specific nuclease)均一化技术与SMARTTM(switching mechanism at 5’end of RNA transcript)建库技术相结合的方法,构建了辣椒全长均一化cDNA文库,该文库含有1.8×106个独立克隆,插入片段平均长度为1.75kb,重组率为97%;基于SSH获得的差异表达基因序列设计特异性引物,从均一化文库中分离获得其相应的cDNA,结果表明:所获得的差异表达基因cDNA片段相对应的cDNA阳性克隆均为全长cDNA,所构建的SSH和均一化cDNA文库可较好地应用于辣椒应答疫霉等逆境差异表达基因全长cDNA的分离,为进一步开展差异表达基因的功能鉴定奠定基础。; 赖燕林明陈桂信徐波贺俐姜翠翠肖翔官德义何水林; 关键词：辣椒抑制差减杂交差异表达基因

紫外线胁迫的花生幼果cDNA文库构建与RS cDNA的分离被引量：3: 2008年; 紫外线胁迫可导致花生产生白藜芦醇的诱导合成防御反应,本研究在利用UV处理花生幼果、激发花生幼果防御反应的基础上提取总RNA,应用SMART-cDNA文库构建试剂盒构建了花生幼果的cDNA文库.该文库含有1.0×106独立克隆,插入片段平均1 kb左右.利用所构建的cDNA文库,采用96孔板PCR筛选方法,分离获得2个白藜芦醇合成酶cDNA.; 林明徐波王育娜曹蕾夏信明何水林; 关键词：花生 CDNA文库

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