徐国云 作品数:13 被引量:48 H指数:4 供职机构: 中国科学院亚热带农业生态研究所 更多>> 发文基金: 中国科学院“百人计划” 湖南省重大科技专项 国家自然科学基金 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 更多>>
水稻逆境响应基因OsMsr11的克隆与分析 2012年 为了挖掘新的耐逆基因,本文在应用Affymetrix水稻表达芯片分析超级稻亲本培矮64S在不同逆境(高温、干旱、低温)胁迫下、不同发育时期叶片和穗中全基因组表达模式的基础上,对其中一个多逆境响应基因OsMsr11(Oryza sativa L.multiple stressresponsive gene 11)进行了克隆与分析。OsMsr11是一个受低温、干旱、高温多逆境诱导的基因,在孕穗期低温胁迫下表达水平显著上调。通过PCR扩增获得了包含其完整开放阅读框的cDNA序列。序列分析表明,其ORF为234 bp,编码77个氨基酸,有信号肽序列,无典型的保守基因结构域,预测其为分泌通路信号肽,分泌到细胞周质中,功能未知;OsMsr11基因不含内含子,对其启动子区域进行分析,发现含有多种与逆境响应相关的顺式作用元件。为研究其功能,采用农杆菌侵染法转化超级稻父本9311,初步分析表明:在水稻中过量表达OsMsr11,增强了转基因水稻的耐盐性,降低了对外源ABA的敏感性。 胡叶平 崔延春 徐国云 王曼玲 李落叶 夏新界关键词:水稻 逆境 基因芯片 脱落酸 不同野生稻居群DREB1B启动子的克隆与进化分析 被引量:1 2008年 根据Genbank所公布OsDREB1B的启动子序列设计引物,从12个不同普通野生稻居群和2个主要栽培稻亚种(籼、粳)克隆DREB1B启动子序列。结果表明,该启动子绝大部分区域都非常保守,存在1个AGC重复序列,若含有5个AGC重复,重复序列后第16个碱基为A,若含有6个或7个AGC重复,此位点碱基为T,并且在启动子中发现几个逆境相关的顺式作用元件。进化树分析表明,同一地域分布的居群存在相近的进化关系,但也受海拔等因素的影响。 徐国云 陈荣军 徐孟亮 崔延春关键词:野生稻 抗寒 启动子 进化分析 茶陵野生稻苗期耐冷性研究 被引量:4 2009年 以耐冷性强弱不同的栽培稻为参比,通过自然冷胁迫与(或)人工冷处理,比较了茶陵野生稻与不同类型栽培稻经冷胁迫后的秧苗成活率、净光合速率和光系统Ⅱ光化学量子效率的变化,对茶陵野生稻苗期耐冷性作出评估。结果表明:经冷胁迫后,茶陵野生稻上述指标值的变化小于典型籼稻和爪哇稻,大于典型粳稻。说明茶陵野生稻苗期耐冷性强于籼稻和爪哇稻,但弱于粳稻。 徐孟亮 陈志 肖媛 崔延春 徐国云 夏新界关键词:普通野生稻 水稻 耐冷性 净光合速率 叶绿素荧光参数 一种与植物耐逆相关的蛋白及其编码基因与应用 本发明公开了一种本发明的目的在于提供一种蛋白,命名为OsMSr2,来源于水稻,是如下1)或2)的蛋白:1)序列表中序列2所示的氨基酸序列组成的蛋白质;2)在序列表中序列2的氨基酸序列经过取代和/或缺失和/或添加一个或几个... 夏新界 徐国云文献传递 一个水稻多逆境响应基因OsMsr3克隆与表达分析 2009年 为深入探讨水稻对逆境的反应机理并寻找新的植物耐逆基因,采用Affymetrix水稻表达芯片(含51279个转录本)分析了培矮64S全基因组在不同逆境(高温、干旱、低温)胁迫下、不同生育时期叶片和穗中的表达谱,从中筛选出一个受多种逆境诱导表达的基因OsMsr3(Oryza sativa L.multiple stresses responsive gene3,Gen Bank登陆号为FJ383169)。定量实时PCR分析结果进一步证实了此基因在逆境条件下的诱导表达模式。用RT—PCR方法扩增获得了包含其完整开放阅读框的cDNA克隆,序列分析表明,其ORF大小为480bp,编码一个具有160个氨基酸残基的低分子量热激蛋白,推测分子量约为18.0kD;pI约为6.8。对其编码的蛋白质进行分析,发现其羧基端存在一个HSP20的蛋白保守结构域,与其他植物中的低分子量热激蛋白的相似牲介于33.7%-97.5%。对其可能的启动子序列分析,发现6类与逆境反应有关的顺式作用元件。推测该基因在逆境反应中起着重要的作用,进一步的研究正在进行中。 崔延春 徐孟亮 李落叶 王曼玲 徐国云 夏新界关键词:水稻 逆境 基因芯片 一个新的水稻逆境响应基因OsMsr1的表达与克隆 被引量:18 2008年 为深入了解植物的逆境反应机理和发现新的水稻耐逆基因,采用Affymetrix水稻表达芯片(含51279个转录本)分析了超级稻两优培九母本培矮64S不同生长发育时期、不同组织器官全基因组在低温、干旱、高温逆境胁迫下的表达水平,筛选出众多表达水平显著升高与降低的基因。OsMsr1(Oryza sativa L.multiple stresses responsive gene 1,Gen Bank登录号为EU284112)是其中一个受高温、低温与干旱诱导、在各生长发育时期与组织器官均显著上调的基因,用实时定量PCR方法对其表达水平进行了进一步的分析,所得结果与基因芯片结果基本吻合,因此,此基因为一多逆境响应基因。用RT-PCR方法扩增获得了包含其完整ORF(open reading frame)的cDNA克隆。根据其ORF序列进行预测,此基因编码一个包含89个氨基酸残基的小分子蛋白,分子量约为10kD,pI约为5。搜索有关数据库,在水稻、玉米、小麦与拟南芥中找到有高相似性的基因,但功能未知,也未发现相同与类似的已知功能的基因保守结构域。对其可能的启动子序列分析,发现5个与逆境反应有关的顺式作用元件。因此,我们认为该基因为一新的水稻耐逆候选基因,进一步的研究正在进行。 徐孟亮 陈荣军 ROCHA Pedro 李落叶 王曼玲 徐国云 夏新界关键词:水稻 逆境 基因芯片 实时定量PCR 基因克隆 茶陵普通野生稻光合特性研究 被引量:12 2007年 以超高产或高产栽培稻两优培九、汕优63、威优46和93-11为对照,测定了湖南茶陵普通野生稻抽穗开花期1d中不同时间点的净光合速率(Pn)以及Pn对不同光强、不同CO2浓度与不同温度的响应曲线。结果表明,茶陵普通野生稻的Pn在下午极显著高于对照,在高温(40℃,45℃)胁迫下也是如此;光补偿点为22.3μmol photons m^-2 s^-1,与对照差异不显著(20.1~23.7μmol photons m^-2s^-1),光饱和点为1810μmol photons m^-2s^-1,与对照93—11无显著差异,但极显著高于其他对照材料(1530~1628μmol photons m^-2 s^-1),表观量子效率(AQY)与对照无显著差异;CO2补偿点(52.7μmol mol^-1)稍高于对照(42.7~50.1μmol mol^-1),而饱和点(644.5μmol mol^-1)则明显高于对照(521.1~581.3μmol mol^-1),羧化效率(0.1511mol m^-2s^-1)显著高于对照(0.1277~0.1384mol m^-2 s^-1);叶绿素含量极显著高于对照。说明茶陵普通野生稻的光合性能强于超高产或高产对照栽培稻,且在高温下表现更为突出。 康公平 徐国云 陈志 徐孟亮 陈良碧关键词:普通野生稻 净光合速率 气体交换参数 光合色素 同源四倍体拟南芥的耐锌性及其机理 被引量:2 2015年 锌(Zn)是植物生长发育所必需的微量元素,但其过量积累也会对植物产生毒害作用。通过对同源四倍体拟南芥进行高浓度锌处理,发现四倍体拟南芥对锌具有高耐受性和低积累性的特点。在高浓度锌胁迫条件下,同源四倍体的根长和生物量较野生型对照均有明显增加,并且谷胱甘肽(GSH)的含量也明显升高。定量实时PCR(q RT-PCR)分析表明,一些锌胁迫响应基因的表达水平发生了显著改变。以上结果表明,锌胁迫响应基因表达水平的改变以及GSH含量的升高可能在四倍体拟南芥的耐锌过程中发挥重要作用。 任冲 徐国云 李明娟 崔延春 王曼玲 夏新界关键词:基因表达 谷胱甘肽 水稻叶片特异性不表达启动子pOsMTG3的克隆与表达分析 被引量:1 2016年 利用水稻基因芯片筛选到1个在水稻孕穗期和抽穗期穗中的相对表达量明显高于苗期、孕穗期和抽穗期叶片中相对表达量的基因Os MTG3,该基因在孕穗期穗中受低温、干旱诱导上调表达,而在抽穗期穗中受低温诱导下调表达。把该基因ATG密码子上游1.8kb左右的DNA片段预测为启动子区,并将其命名为p Os MTG3。用PCR技术克隆该启动子,并以GUS基因作为报告基因,在水稻中分析了该启动子在不同时期不同组织中的表达特性。GUS组织化学染色分析表明:p Os MTG3启动子能启动GUS基因在水稻根、芽、茎、穗中表达,而不能启动GUS基因在叶片中表达,是一个全新的叶片特异性不表达的启动子。 余艳 Pedro S.C.F.Rocha 任冲 徐国云 王曼玲 崔延春 夏新界关键词:水稻 启动子 基因表达 一种与植物耐逆相关的蛋白及其编码基因与应用 本发明公开了一种本发明的目的在于提供一种蛋白,命名为OsMSr2,来源于水稻,是如下1)或2)的蛋白:1)序列表中序列2所示的氨基酸序列组成的蛋白质;2)在序列表中序列2的氨基酸序列经过取代和/或缺失和/或添加一个或几个... 夏新界 徐国云