张同作 作品数:114 被引量:557 H指数:15 供职机构: 中国科学院西北高原生物研究所 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 中国科学院知识创新工程领域前沿项目 中国科学院西部之光基金 更多>> 相关领域: 生物学 农业科学 文化科学 环境科学与工程 更多>>
青海高原人体棘球蚴病病原基因型及空间分布研究 马俊英 王虎 林恭华 蔡辉霞 刘培运 张同作 韩秀敏 马霄 张永国 赵芳 侯志斌 李永寿 王永顺 李亚楠 该项目采用DNA测序法,对青海33个县(市)的128个人体棘球蚴样品进行了线粒体COX1基因的测序。通过构建系统发育树、构建单倍型网络图、地区遗传结构分析、遗传多样性分析及地理信息技术等方法对测序结果进行分析研究,发现了...关键词:关键词:棘球蚴病 疾病诊断 一种提取动物基因组总DNA的野外样品保存方法 被引量:24 2006年 为了确定一种方便的野外动物样品保存方法,以新鲜材料作对照,从-20℃冰箱、70%乙醇、含50mmol/L EDTA的70%乙醇、95%乙醇、液氮处理的高原鼠肌肉和肝脏组织中提取基因组总DNA。通过琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度计对提取的基因组总DNA质量进行检测。结果显示:相同处理的肝脏DNA产量大,肌肉组织提取的DNA质量好;各种保存方法提取的DNA降解程度依次为,-20℃冰箱、70%乙醇>含50mmol/L EDTA的70%乙醇、95%乙醇>液氮>新鲜。选择新鲜肌肉和95%酒精处理的肌肉样品提取的总DNA作模板,进行微卫星PCR扩增,均可获得清晰的电泳带。将该方法用于高原鼢鼠,进行线粒体12S rRNA、Cytb和D-loop区测序,结果显示该方法保存的样品与新鲜样品没有差别。因此,在野外用95%乙醇固定肌肉样品是一种可行的样品保存方法。 蔡振媛 张同作 连新明 慈海鑫 苏建平关键词:高原鼠兔 高原鼢鼠 总DNA提取 高原鼢鼠内脏器官与海拔的相关性研究 被引量:2 2015年 小型哺乳动物内脏器官的质量和消化道长度具有高度可塑性,是其对环境适应的重要指标。本研究通过对高原鼢鼠内脏器官随海拔梯度变化的比较研究,旨在从形态结构方面来探讨高原鼢鼠对环境和低氧的适应机制。结果显示,雄性高原鼢鼠心脏湿重和干重、脾脏干重、肺干重、胃湿重和干重、盲肠湿重与海拔呈显著或极显著正相关,而肾湿重、大肠长度与海拔呈负相关;雌性高原鼢鼠心脏湿重和干重、肺脏湿重和干重、胃湿重、盲肠湿重、盲肠长度与海拔呈显著或极显著正相关,肝脏湿重和干重、脾脏干重、肾脏湿重和干重、大肠干重、大肠长度与海拔呈显著或极显著负相关;其他与海拔无显著相关性。研究结果表明,内脏器官与海拔的相关性体现出高原鼢鼠面对不同的生存环境、能量需求、氧气含量、外界病原体等因素做出的代偿性适应。 张守栋 杨传华 李邦 张同作 苏建平 林恭华关键词:高原鼢鼠 内脏器官 海拔 两种鼢鼠内脏器官形态差异及其分类学意义 被引量:9 2012年 分子生物学研究表明,甘肃鼢鼠(Eospalaxcansus)和高原鼢鼠(Eospalax baileyi)是啮齿目(Rodentia),鼹形鼠科(Spalacidae),鼢鼠亚科(Myospalactinae),中华鼢鼠属(Eospalax)的两个近缘种(Norris et al.,2004;Zhouand Zhou,2008)。这两种鼠是我国西部常见的农、林、牧业害鼠(邴积才等,2001;张三亮等,2001;杨学军等,2006;周雪荣等,2010;马治德和马维海,2011)。它们均为典型的地下鼠,终身生活于封闭的地下洞道中(Nevo,1999),通过挖掘活动获取食物(中国科学院西北高原生物研究所,1989;Norris et al.,2004)和寻找配偶,除短暂的交配期和雌性育幼过程外,雌雄鼠均独居生活。 杨传华 都玉蓉 谢久祥 崔雪峰 苏建平 张同作关键词:甘肃鼢鼠 高原鼢鼠 内脏器官 青藏高原地区塞隆骨资源的分子鉴定和地理分布 被引量:4 2015年 为了提供塞隆骨药材资源地理分布的准确资料,研究对青藏高原地区的鼢鼠物种进行了分子鉴定。基于线粒体细胞色素B(cytb)基因测序结果,提取单倍型序列,并利用最大似然法(ML)和贝叶斯法(BI)构建系统发育树,以此判定每个个体的物种类型。共对35个种群的503个样品进行了测序,得到了1 140 bp长度的cytb基因全序列,从中检测到150个单倍型。其中有20个单倍型属于甘肃鼢鼠,有4个单倍型属于斯氏鼢鼠构成单系群,其余126个单倍型属于高原鼢鼠。在35个种群中,有28个全部为高原鼢鼠,有5个种群全部为甘肃鼢鼠,另有2个种群分别由高原鼢鼠+甘肃鼢鼠(DT2)、高原鼢鼠+斯氏鼢鼠(ZN3)混合而成。结果表明,青海湖周边地区和黄河贵德段上游附近地区可以作为塞隆骨药材的正宗来源地,而利用cytb基因可以准确鉴定鼢鼠物种,从而精确判定塞隆骨正宗药材资源的地理分布。 赵芳 邓小弓 张同作 苏建平 林恭华关键词:塞隆骨 鼢鼠 分子鉴定 资源分布 高原鼢鼠线粒体谱系地理学和遗传多样性 被引量:25 2007年 高原鼢鼠是一类地下独居啮齿动物,为青藏高原特有种之一。为研究该物种的谱系地理学和遗传多样性,本文测定了采自青藏高原东部3个地理种群8个小种群共37个个体的线粒体D-loop区序列变异。在长度为627bp的序列中,共发现50个变异位点,定义了26种单倍型。该物种的单倍型多样性(Haplotype diversity,H)较高和核苷酸多样性(Nucleotide diversity,πn)较低。谱系分析得到3个稳定的分支,分别与采集的地理种群相吻合:同一地理种群内单倍型之间遗传差异小,而不同地理来源的单倍型之间存在较大区别。距离隔离分析表明高原鼢鼠的遗传分化与地理距离呈正相关。AMOVA分析同样表明地理种群之间存在显著差异:地理种群间变异占遗传变异的80.45%。高原鼢鼠的这种遗传结构特点可能主要是由于第四纪气候变迁、该物种稳定的地下生活环境和有限的迁移能力造成的。 蔡振媛 张同作 慈海鑫 唐利洲 连新明 刘建全 苏建平关键词:高原鼢鼠 线粒体控制区 高原鼢鼠越冬食物选择与营养成分的关系 被引量:11 2014年 为了解高原鼢鼠在越冬期的食物选择与营养成分之间的关系,采集了67个高原鼢鼠的冬季粮仓及环境样方,分析高原鼢鼠对每一种植物的选择指数,将其分成3种食物类型:喜食、可变和不喜食。通过测定每一种植物的粗蛋白、粗纤维、水溶性糖和粗灰分的含量,比较分析了营养成分含量在3种食物类型间的差异,及其与各种植物选择指数的相关关系。结果显示,高原鼢鼠储存的食物种类多达67种,本文选取含量较高且样本量大于5的39种植物(占粮仓和样方总生物量的99%以上,其中喜食12种、可变16种、不喜食11种)进行分析。在3种食物类型之间,粗蛋白、粗纤维和水溶性糖含量均有极显著差异(P<0.001),粗灰分含量则无明显差异(P=0.800)。喜食和可变类型的粗蛋白和水溶性糖含量显著高于不喜食类型(P<0.01);喜食和可变类型的粗纤维含量则显著低于不喜食类型(P<0.01);喜食和可变类型之间这3个指标差异都不显著(P>0.05)。Spearman相关分析显示,粗蛋白(R=0.547,P<0.001)和水溶性糖(R=0.617,P<0.001)含量与选择指数显著正相关,粗纤维与选择指数显著负相关(R=-0.707,P<0.001),粗灰分与选择指数则无显著相关关系(R=0.032,P=0.846)。结果表明,高原鼢鼠总体上偏好粗蛋白和水溶性糖含量高、粗纤维含量低的植物,对无机盐的含量则不敏感。 崔雪峰 谢久祥 张守栋 林恭华 张同作 苏建平关键词:高原鼢鼠 营养成分 退耕还林还草地鼠害治理——大林姬鼠种群年龄结构的研究 被引量:11 2006年 对采自青海省退耕还林还草地88只大林姬鼠Apodemus speciosus标本的体重和胴体重等7项生长指标进行了主成分分析,确定了各项指标对鼠体生长的代表性大小。结果表明:体重和胴体重是最具有代表性的生长指标,并根据体重将大林姬鼠划分为5个年龄组,为及时掌握退耕还林还草地鼠类种群动态进而对其进行有效防治提供有力的证据。 张同作 崔庆虎 连新明 苏建平关键词:退耕还林还草 大林姬鼠 年龄结构 主成分分析 藏羚羊季节性迁徙成因猜想 被引量:2 2017年 藏羚羊是青藏高原最具代表性的物种之一。有关藏羚羊的科学研究也在不断拓展,但关于这一物种最受关注的科学问题——迁徙的成因至今仍无解。中国科学院西北高原生物研究所的研究团队,追踪研究藏羚羊多年,对这一问题得出相对成熟的研究成果,同时提出更多需要进一步研究的问题。 苏建平 陈家瑞 连新明 张同作关键词:藏羚羊 资源调查 迁徙 季节性 猜想 青藏高原 普氏原羚SSR分子标记组合、引物组合、试剂盒和应用 本发明提供了普氏原羚SSR分子标记组合、引物组合、试剂盒和应用,涉及分子生物学技术领域。本发明基于普氏原羚全基因组测序数据,进行SSR引物设计和SSR位点的筛选,得到的26对SSR引物能够稳定扩增出目标产物,且具有高度多... 蔡振媛 常宁 张同作 宋鹏飞 张婧捷 刘道鑫