刘赟
- 作品数:5 被引量:7H指数:2
- 供职机构:北京工业大学生命科学与生物工程学院更多>>
- 发文基金:北京市自然科学基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:生物学理学更多>>
- 基于相对熵的蛋白质设计方法的普遍近似被引量:1
- 2004年
- 发展了最近提出的一种基于相对熵原理的蛋白质设计方法.将该方法从必须满足特定的条件才能适用,推广到普遍适用.研究表明,扩展前的方法可被看作扩展后方法的特例,扩展后的采用普遍近似的蛋白质设计方法更利于蛋白质设计的研究,使基于相对熵的蛋白质设计方法更具有普遍性,同时还提高了对蛋白质序列的预测精度.
- 王屹华王宝翰刘赟陈慰祖王存新
- 关键词:相对熵蛋白质设计分子生物学
- 基于格子模型的蛋白质设计方法被引量:5
- 2004年
- 提出一个简单有效的蛋白质设计方法 ,这一方法完全基于物理学原理 .与同类工作相比 ,该方法在很大程度上可节省对序列空间进行的搜索 ,是对同类工作的简化与发展 .对三个平面格子模型进行的检验表明该方法是成功的 .
- 刘赟王存新王宝翰陈慰祖
- 关键词:蛋白质设计方法
- 四种结构类型的蛋白质设计方法被引量:2
- 2004年
- 给出了以疏水-亲水模型为基础的蛋白质设计方法,该方法以物理学原理为基础,以相对熵作为优化的目标函数。对四种不同结构类型的天然结构的真实蛋白质进行了检测,分析了影响检测成功率的主要因素,结果表明,该方法是普适的,可用于对不同结构类型的蛋白质设计序列。
- 刘赟王屹华王宝翰王存新陈慰祖
- 关键词:蛋白质设计结构类型
- 非格子模型的蛋白质设计方法
- 2004年
- 为了克服双重蒙特卡罗方法用于较大分子体系及非格子模型的困难,提出了一个基于相对熵的蛋白质设计的简单方法.利用非格子模型,以16个处于天然稳定态的真实蛋白质为目标结构进行测试,成功率可达75.9%.与其他利用Monte Carlo方法搜索序列空间的方法相比,该方法更为快速有效,在很大程度上节省了对序列空间的搜索.
- 刘赟王存新王宝翰陈慰祖
- 关键词:蛋白质设计相对熵
- 位形空间非定域Ward恒等式被引量:1
- 2004年
- 从 Faddeev- Popov( FP)方法对规范理论给出的位形空间生成泛函出发 ,导出了位形空间非定域变换下的 Ward恒等式 .应用于非 Abel Chern- Simons( CS)理论 ,得到了 CS规范场 -鬼场正规顶角间的 Ward恒等 ,并把此结果与文献 [1 ]做了对比 。
- 刘赟李瑞洁李子平
- 关键词:WARD恒等式