陈燕飞
- 作品数:6 被引量:9H指数:2
- 供职机构:浙江理工大学生命科学学院生物工程研究所更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国际科技合作与交流专项项目国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域:农业科学更多>>
- 一株黄瓜花叶病毒种内假重组体的基因组全序列及侵染性克隆研究
- 黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)是雀麦花叶病毒科(Bromoviridae)黄瓜花叶病毒属(Cucumovirus)的典型成员。CMV寄主范围极为广泛,可以侵染85个科的1000多种植物...
- 陈燕飞
- 关键词:黄瓜花叶病毒全序列分析侵染性克隆
- 文献传递
- 侵染上海番茄的黄瓜花叶病毒及其卫星RNA的^(32)P分子标记杂交检测及分子鉴定被引量:4
- 2006年
- 2004和2005年夏季,在上海郊区露天栽培的番茄地出现典型的病毒病危害,并造成严重的产量损失。分别以32P标记的CMV基因组RNA3部分序列和卫星RNA的cDNA探针对自然感病的番茄叶组织和提纯的病毒粒子中提取的总RNA进行杂交检测,确定以上植物组织和病毒粒子中均具有CMV及卫星RNA。dsRNA分析确定自然感病叶组织中具有典型黄瓜花叶病毒(CMV)基因及其卫星RNA条带。以常规引物对感病植物的总RNA进行RT-PCR扩增,获得CMV RNA3全长克隆,经测序显示该RNA3序列属于CMV亚组Ⅱ;通过在卫星dsRNA两端分别加上15nt的单链DNA接头,以接头互补序列为引物进行扩增获得一个383nt的卫星RNA的全长序列。同源性分析结果显示其与已报道的CMV卫星RNA同源性为72.6%~99.5%,但其3′末端存在多个碱基的突变。根据同位素杂交检测及分子鉴定,CMV及其卫星RNA变异类型在上海自然感病番茄上发生和普遍存在,可能对病害流行和新的症状出现产生影响。
- 张华荣陈集双郭江峰杜志游廖乾生陈燕飞朱为明陈绍宁张姮
- 关键词:番茄病毒病黄瓜花叶病毒卫星RNA
- 黄瓜花叶病毒2b蛋白介导病毒在寄主体内的适应性选择
- 病毒适应性是直接评价病毒在寄主体内的繁殖或复制能力的指标,是病毒与寄主相互作用的复杂过程。文献报道 HIV 的适应能力与其致病性存在一定的相关性。病毒的致病性很大程度上由病毒编码的致病因子决定。黄瓜花叶病毒(Cucumb...
- 陈斐斐杜志游曾蓉陈燕飞陈集双
- 关键词:黄瓜花叶病毒适应性
- 文献传递
- 侵染白菜的黄瓜花叶病毒分离物基因组的全序列分析被引量:5
- 2008年
- 对浙江省杭州地区白菜(Brassica campestris L.ssp.chinensis var.commuis Tsenet Lee.)上获得的CMV分离物(CMV-CTL)进行了全长克隆和基因组序列分析。结果显示:CMV-CTL的RNA1(Gen-Bank序列号:EF213023)全长为3357个核苷酸(nt),编码993个氨基酸(aa)的1a蛋白;RNA2(Gen-Bank序列号:EF213024)全长为3047nt,编码858aa的2a蛋白和111aa的2b蛋白;RNA3(GenBank序列号:EF213025)全长为2217nt,编码278aa的MP蛋白和218aa的CP蛋白。序列相似性分析表明,CMV-CTL与CMV亚组B中株系IA相似性最高,RNA1、RNA2和RNA3与该株系的相似性分别为91·3%、91·3%和93·6%。CP基因和RNA3的5′NTR核酸序列系统发生树分析表明,CMV-CTL与中国大多数CMV分离物一样,属于CMV亚组IB。
- 曾蓉陈燕飞严师节黎定军陈集双
- 关键词:黄瓜花叶病毒白菜基因组序列
- 黄瓜花叶病毒番茄分离株的核酸全序列测定
- 黄瓜花叶病毒是雀麦花叶病毒科黄瓜花叶病毒属的典型成员,是典型的三分体病毒,其基因组包括三条单链正义RNA,分别命名为:RNA1、RNA2和RNA3。 RNA1长度约为3357nt,编码1a蛋白。RNA2长度约为3050n...
- 陈燕飞陈集双张华荣唐香山
- 关键词:黄瓜花叶病毒番茄全序列
- 文献传递
- 一株CMV种内假重组体的分子鉴定和生物学表型研究
- 本研究在2005年采样自上海郊区自然感病的番茄样品中获得一株 CMV,命名该分离物为 Tsh-CMV。对 Tsh-CMV 基因组全序列分析结果表明:Tsh-CMV RNA1全长为3394nt,RNA2 为3047nt,R...
- 严师节陈燕飞陈集双
- 关键词:侵染性克隆
- 文献传递