秦德辉 作品数:29 被引量:150 H指数:9 供职机构: 浙江省农业科学院 更多>> 发文基金: 浙江省自然科学基金 浙江省科技计划项目 国家自然科学基金 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 文化科学 经济管理 更多>>
兰属微卫星标记的建立方法、核心指纹标记库与试剂盒 本发明公开了一种兰属微卫星标记的建立方法、核心指纹标记库与试剂盒。基于建兰转录组信息开发SSR引物,对这些标记进行了通用性和多态性分析,得到了49个兰属多态性标记,这些标记多态性高、重复性好,非常适用于兰属植物的遗传学研... 李小白 金亮 向林 秦德辉 金凤 孙崇波文献传递 蕙兰B类MADS-box基因的克隆及表达分析 被引量:15 2011年 采用RT-PCR结合RACE技术从蕙兰(Cymbidium faberi)中分离到3个B类MADS-box基因CfGLO、CfDEF1和CfDEF2,分别编码210、222和227个氨基酸。系统进化树分析显示,CfGLO属于PI/GLO类基因,CfDEF1和CfDEF2分别属于PaleoAP3组基因的PeMADS2类基因和PeMADS3类基因。RT-PCR和实时荧光定量表达分析表明,CfDEF1在2、3轮花器官侧瓣、唇瓣和蕊柱中强烈表达,在萼片中不表达;CfDEF2在1、2、3轮花器官中都表达,在营养组织中不表达;而CfGLO在所有组织中都表达,说明3个基因在蕙兰花器官的形成过程中可能扮演着不同的角色。此外,3个基因都在蕙兰幼嫩子房中有表达,显示其可能在蕙兰子房的形成过程中起一定作用。 向林 秦德辉 李小白 李伯钧 郭方其 吴超 孙崇波关键词:蕙兰 发育 蕙兰AGL6基因的克隆和序列分析 本文采用同源序列法从蕙兰(Cymbidium faberi)中分离到一个MADS-box基因,命名为CfAGL6。CfAGL6基因全长1253bp,含有729bp长的开放阅读框,共编码242个氨基酸,具有典型的植物MAD... 向林 孙崇波 郭方其 李伯钧 秦德辉关键词:蕙兰 花发育 MADS-BOX基因 文献传递 蕙兰Flowering locus T基因的克隆及其对开花的影响 被引量:15 2013年 【目的】探讨CfFT基因在蕙兰成花中的作用。【方法】采用RT-PCR结合RACE技术从蕙兰(Cymbidiumfaberi)中克隆Flowering locus T(FT)同源基因CfFT。采用实时定量RT-PCR对不同组织及不同花发育时期CfFT进行表达分析。将该基因克隆到PBI121载体上导入烟草中,并对不同转基因烟草株系中的CfFT、NFL、NtFUL和NAP1基因进行实时定量RT-PCR分析。【结果】对蕙兰花芽分化不同时期的CfFT的表达分析表明,CfFT在花芽分化初期的表达量最高,之后随着花芽的成熟表达量逐渐降低。将CfFT导入烟草进行异源表达,转基因株系表现出明显的早花表型。对开花时间不一的转基因株系中的CfFT表达分析表明,其表达量与转基因烟草开花时间早晚成正比。进一步对这些株系内源的NFL、NAP1和NtFUL表达分析表明,NFL、NAP1和NtFUL基因的表达量与CfFT表达成正比,说明NFL、NAP1和NtFUL的表达受FT基因的上游调控。【结论】在烟草中异源表达蕙兰中的CfFT基因能促进烟草提前开花。 孙崇波 向林 李小白 秦德辉 李伯钧 郭方其 吴超关键词:蕙兰 成花诱导 烟草 利用酵母双杂交系统筛选春兰开花调控蛋白DEF3的互作蛋白 被引量:4 2016年 为了探究春兰DEF3蛋白与其它花发育蛋白之间的相互作用,本研究以春兰为实验材料,克隆了18种花发育相关基因:AP1-2、AP1-3、AP2-1、AP2-2、AG1、AG2、AG3、DEF1、DEF2、DEF3、DEF4、GLO、SEP1、SEP2、SEP3、SEP4、AGL6-1、AGL6-3。利用酵母双杂交体系,构建了诱饵质粒p GBKT7-DEF3及18种猎物质粒,并通过实验验证诱饵质粒没有自激活现象。进行酵母双杂交实验,最终获得六个蛋白与DEF3互作,分别是:AP1-2、GLO、AG1、SEP2、SEP4、AGL6-3。 胡月苗 陈跃 秦德辉 胡凤荣 孙崇波关键词:春兰 一种适宜蕙兰种子无菌萌发培养基组合物及其方法 本发明主要涉及一种适宜蕙兰种子无菌萌发培养基组合物及其方法,基本培养基和种子萌发培养基的各组分及每升所含重量为:基本培养基:选用自行改良MS,即在原来MS培养基的基础上,将MS基本培养基中的氯化钙440mg/L替换为硝酸... 孙崇波 郭方其 黎侠 林森洪 秦德辉 张姗姗文献传递 建兰转录本的微卫星序列和单核苷酸多态性信息分析 被引量:8 2014年 利用建兰转录组数据对其微卫星序列又称简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)和单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)进行搜索,并对其所在序列进行注释,从而为建兰分子标记的开发提供有效信息.利用High-Seq技术对建兰转录组进行深度测序,采取从头拼接策略进行拼接,最后得到了101 423个转录产物,其中含139 385 689bp,平均长度为1 374bp.在这个转录组数据库中一共检测到17 793个SSR和16 676个SNP位点,它们的平均密度分别是1.28个SSRs/10kb和1.20个SNPs/10kb.在这些SSR中,除了单核苷酸重复外,二核苷酸和三核苷酸重复是最主流的类型,分别占了所有SSR的20.46%和21.98%.在SNP中,C和T之间以及A和G之间的替换是最主要的形式,分别占了所有SNP的30.80%和28.81%.另外,对含有SSR和SNP序列注释发现:分别有1 748个SSR和1 932个SNP序列具有直系同源基因簇(Clusters of Orthologous Groups,COG)注释;4 994个SSR和4 819个SNP序列具有基因本体论(Gene Ontology,GO)注释;2 107个SSR和2 188个SNP序列具有京都基因与基因组百科(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)注释.这些序列涉及了许多重要的生物功能和代谢途径,预示着这些潜在的标记可能与重要的生物功能有关.这些信息为建兰分子标记的开发和应用奠定了基础. 李小白 向林 罗洁 秦德辉 孙崇波关键词:建兰 功能注释 基于表型性状的切花多头菊种质资源遗传多样性分析 被引量:12 2020年 为了解引进多头菊品种资源在浙江的适应性以及品种资源的开发利用,以引种的56份多头菊资源为研究对象,对其28个表型性状进行了综合多样性分析。结果表明,多头菊品种的表型性状存在丰富的变异,其中13个数量性状的遗传多样性指数变化范围为1.530~2.251,其中叶宽(2.251)、舌瓣宽度(2.184)和分枝数(2.062)遗传多样性指数较高,舌瓣数(1.530)遗传多样性指数最低;15个质量性状中,舌状小花花色(2.004)、舌状小花花瓣最宽处横切面形状(1.629)和花心颜色(1.457)遗传多样性指数较高,花序一级侧枝与茎的夹角(0.428)和茎颜色(0.52)遗传多样性指数最低。数量性状的变异系数范围为17.85%~93.61%。相关性分析表明,性状间大部分呈现显著性相关,其中极显著正相关占大部分比例。聚类分析表明,供试的56份多头菊资源可被分成4个组群:第一组为重瓣多头菊品种群;第二组为重瓣绿菊品种群;第三组为非重瓣多头菊品种群;第四组为大花型多头菊品种群。主成分分析表明,前9个主成分的特征值均大于1,累计贡献率为75.55%。 郭方其 吕萍 吴超 彭娟 秦德辉 黎侠 丁晓瑜关键词:聚类分析 表型性状 兰属微卫星标记的建立方法、核心指纹标记库与试剂盒 本发明公开了一种兰属微卫星标记的建立方法、核心指纹标记库与试剂盒。基于建兰转录组信息开发SSR引物,对这些标记进行了通用性和多态性分析,得到了49个兰属多态性标记,这些标记多态性高、重复性好,非常适用于兰属植物的遗传学研... 李小白 金亮 向林 秦德辉 金凤 孙崇波文献传递 春兰AGL6基因的克隆及实时定量表达分析 被引量:21 2010年 本研究采用RT-PCR结合RACE技术从春兰(Cymbidium goeringii)中分离到一个AGL6基因。序列分析表明,该基因含有一个729bp长的开放阅读框(ORF),共编码242个氨基酸。系统进化树分析显示,该基因属于MADS-box基因家族AP1/AGL9组的AGL6同源基因,其编码的蛋白与其它植物AGL6类蛋白具有较高的同源性,命名为CgAGL6(基因登录号为HM208533)。实时荧光定量表达分析表明,CgAGL6基因春兰不同组织中均有表达,其中在唇瓣、花芽和子房中的表达量较高,在花瓣和萼片中的表达量次之,在根、叶和蕊柱中的表达量最低,显示了CgAGL6基因可能在春兰成花转变和花器官的形成过程中起着重要作用。 孙崇波 向林 施季森 胡凤荣 郭方其 秦德辉关键词:春兰 花发育