盛中华
- 作品数:5 被引量:12H指数:2
- 供职机构:扬州大学动物科学与技术学院更多>>
- 发文基金:上海市闵行区自然科学基金上海市科技兴农重点攻关项目更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 浦东白猪毛色的遗传基础研究——KIT基因变异的检测被引量:2
- 2008年
- 浦东白猪是国内唯一一个毛色全白的地方猪种。但是对其毛色全白的分子遗传基础,迄今一直无人研究。为此,本研究通过聚合酶链式反应-单链构象多态性分析(PCR-SSCP)以及对KIT基因内含子17和内含子18的测序探讨了浦东白猪白毛色的遗传控制体系与长白猪和大白猪白毛色控制体系的异同。结果证明,浦东白猪与长白猪和大白猪一样,其白毛色均为KIT基因内含子17发生了G→A的突变,内含子18的序列中存在AGTT的缺失造成的。
- 盛中华白春艳王起山俞沛初潘玉春储野根马永明沈大德
- 关键词:KIT基因
- 上海白猪(上系)基因组遗传变异检测与功能注释分析被引量:1
- 2018年
- 拟通过全基因组范围内遗传变异的检测和注释分析,深入了解上海白猪(上系)群体的遗传现状,以便更好地进行提纯复壮与开发利用。本研究应用基因组简化测序平台—GGRS,对上海白猪(上系)群体(99头)进行基因组测序,并综合实验室前期太湖地方猪种和西方引进品种共计447头测序数据进行SNP和InDel等遗传变异检测和功能注释分析。结果显示,上海白猪基因组测序平均覆盖度为2.87%,平均测序深度为3.9倍,共检测到328 586个SNPs、693 220个InDels。进一步分析表明,SNP和Indel在染色体上的分布相对均一,但在不同染色体上数量和密度的分布存在一定差异。结构注释显示,SNP和InDel对应基因的数量分别为11 496个和13 216个,按照基因的结构区域分类,SNP和InDel在各类功能基因区间的分布特点一致,绝大多数的SNP和InDel变异都分布在基因间区,分别为74.61%和83.38%。内含子中次之,分别为22.76%和14.98%。基因富集分析结果表明,SNP主要与蛋白代谢过程和高分子代谢过程等相关,InDel多在组织、器官发育和疾病相关的通路中发生富集。此外还发现,含有高密度SNP和InDel等遗传变异的QTL主要集中在肉质与胴体性状和健康性状。本研究利用先进的简化基因组测序技术对上海白猪(上系)全基因组范围内的遗传变异进行了普查,并通过对太湖流域地方猪种和西方引进品种的合并比较分析,阐释了这些遗传变异的染色体分布特征,基因区间分布规律和功能注释信息,为后续的开发利用奠定了坚实的基础。
- 盛中华陈国宏陈国宏潘玉春王起山
- 关键词:猪基因组SNPINDEL
- 基于基因组遗传标记的上海白猪(上系)杂交优势预测分析被引量:5
- 2018年
- 通过基于基因组遗传标记的杂交优势预测分析,筛选上海白猪(上系)最优杂交配套组合,以期促进上海白猪(上系)的保种工作,为优质猪肉的生产奠定基础。基于99头上海白猪(上系)与156头国内主要的引进品种(杜洛克、长白猪、大白猪、皮特兰、巴克夏猪)全基因组简化测序得到的100 120个SNP遗传标记,结合性状特异的杂种优势预测方法,利用二元杂交,三元杂交和四元杂交方式,进行了上海白猪(上系)的杂种优势预测。结果显示:二元杂交杜上(DS)、长上(LS)的杂种优势较高,三元杂交的三元杂种肉猪上长大(SLY)最好,双杂交的四元杂种肉猪杜长大上(DLYS)最优、杜上长大(DSLY)次之。针对繁殖、育肥、胴体与肉质性能等多个指标,综合考虑经营管理、成本及当前市场对优质猪肉的需求,确定上海白猪(上系)与长大二元杂种母猪的杂交组合(S×LY)为最宜的杂交配套系组合。
- 盛中华陈国宏陈国宏潘玉春王起山
- 关键词:猪基因组SNP杂交优势
- 浦东白猪毛色遗传及与其它猪种间的关系研究
- 浦东白猪不仅繁殖力高、肉质好、适应性强,而且属于我国唯一一个毛色全白的地方猪种,因而已被农业部列为重点保护品种。然而,多年以来人们对该品种白毛色的分子遗传基础及与其它猪种间的进化关系一直存有疑问,从而严重影响了该品种的保...
- 盛中华
- 关键词:毛色遗传分子遗传品种选育
- 文献传递