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海底热液口甲壳类线粒体基因组及罗氏沼虾生物钟基因的分子解析与进化分析: 本研究成功测定和分析了两种海底热液口甲壳类的线粒体基因组.动物线粒体基因组通常包含37个基因,常用于系统进化和基因组演变研究。迄今已有1000多种动物线粒体全基因组被测定,然而,由于取样的困难至今尚未涉及热液口物种。柯氏...; 杨劲树; 关键词：罗氏沼虾生物钟基因线粒体基因组; 文献传递

卤虫的生殖方式及其调控机制研究进展: 2024年; 生物的生殖方式及其调控机制是生命科学最基础和最重要的研究内容之一。卤虫是一类具有优良经济价值和科研价值的小型甲壳动物,依据生殖方式可分为八个两性物种和众多地理孤雌种群,是理想的生殖机制研究模型动物。对于卤虫生殖机制的早期研究主要集中于两性物种/孤雌种群鉴定、染色体核型分析、种间杂交实验、生物地理学、群体遗传学等方面,也存在着不少争议性的结果。近年来,随着相关研究数据的积累和卤虫完整基因组序列的解析,对于卤虫性别决定机制以及孤雌发生机制的研究已逐渐聚焦于基因组水平的基因表达调控等方面。在这一背景下,本文总结了卤虫生殖机制的研究历史和前沿,并结合本团队的研究和思考,分别对两性卤虫和孤雌卤虫的性别调控机制相关信息进行了整理,并对今后相关领域的研究方向和有待解决的问题进行了展望。; 杨劲树毕宁杨卫军; 关键词：卤虫两性生殖孤雌生殖生殖调控

深海大型生物共生资源的研究与利用: 共生是深海环境特别是还原性环境(如深海热液口、冷泉口、鲸落等)普遍存在的一种生命形式。不同于地表和浅海生物的光合共生微生物，或以肠道微生物为代表的异养共生微生物，由于深海还原环境远离太阳光、富含来自地壳内部的还原性物质，...; 杨劲树刘晓丽杨卫军; 关键词：深海共生微生物

一种快速简便富集微量动物组织线粒体DNA的方法: 本发明提供了一种快速简便富集微量动物组织线粒体DNA的方法，所述方法针对微量动物样品（最低10mg），通过碱性裂解法选择性沉淀核基因组DNA，经几步纯化后，达到快速简便富集线粒体DNA的目的。本发明的优势在于简便易行，实...; 杨劲树俞炎琴杨卫军; 文献传递

基于通识教育理念的合成生物学课程设计与实践被引量：2: 2022年; 合成生物学作为生物学中新的分支学科,发展迅速,理论研究和应用潜力巨大,在带来了很多新的研究理念和研究方法的同时,给高校教学也带来了新的挑战。目前就合成生物学课程而言,国内可供参考的教学经验不多。文中以浙江大学“博雅技艺”类通识课程—“合成生物学”为例,从课程背景、课程设计、课程实施情况、课程成果与存在问题等方面,全方位地阐述和讨论了基于通识教育理念的合成生物学课程的构建和实施。希望在为课程自身进一步地优化做好分析总结的同时,抛砖引玉,为国内其他高校的类似课程提供有益的借鉴和参考。; 杨帆杨帆; 关键词：通识课程合成生物学

肺成体干细胞体外培养模型的研究进展被引量：3: 2022年; 目前,肺体外培养模型有肺类器官和肺芯片两种主要手段。肺类器官是离体的肺上皮干细胞在体外特定的三维培养环境中生长,自发形成具有自我更新能力的干细胞簇并成功分化出功能细胞。肺芯片是利用人工活性膜为细胞提供组织分层结构,模拟微环境和机械力的仿生微流体芯片。由于原有二维培养模式缺乏精确的微结构和功能,组织体外培养模型作为模拟肺部发育、稳态、损伤和再生机制的研究工具,为肺部纤维化、癌症等疾病的探索提供了新的手段和可能。本文就肺成体干细胞两种体外培养模型的分类、研发历史、建立方法、实际应用、优缺点等方面进行综述,期望为器官移植和再生、药物筛选等应用提供参考。; 李童杨劲树杨卫军; 关键词：自我更新分化

不同肝脏损伤模型下新生肝细胞来源研究进展被引量：1: 2022年; 肝脏是执行很多重要生理功能的器官,它具有强大的再生能力,在损伤后可以迅速恢复到原本的体积。它的再生特性得益于肝细胞和胆管上皮细胞在损伤后的快速增殖;然而,在极端急性损伤或长期慢性损伤的情况下,肝脏可能无法再生或再生不佳。有众多研究表明,不同的肝损伤模型会动员不同的细胞亚群促进肝再生。该文主要介绍了五种不同的肝脏损伤模型,并对在不同损伤情况下新生肝细胞的来源、胆管上皮细胞与肝细胞的互相转换等方面进行了总结,为肝脏后续相关研究和疾病治疗提供了借鉴。; 李婷杨劲树杨卫军

罗氏沼虾MSG蛋白对精子明胶水解活性影响的功能被引量：1: 2013年; 雄性生殖系统中的蛋白酶被认为在生殖过程中起着十分关键的作用.不同于哺乳动物生殖系统的蛋白酶,甲壳类精子酶类的研究相对较少.在先前的研究中,我们鉴定了一种新型的罗氏沼虾精子明胶酶(MSG),发现它可以特意地被MRPINK抑制.然而,MSG参与到生殖过程的功能仍未阐明.本研究Western blotting的结果显示,MSG蛋白分布在雄性生殖系统的输精管和壶腹中,在精巢中没有分布;免疫组化和免疫荧光技术结果表明,MSG只分布在输精管和壶腹的内壁表皮细胞核精子的基部.为进一步研究MSG在罗氏沼虾体内的生理功能,采用RNA干涉的方法使MSG基因沉默,通过半定量PCR和Western blotting检测发现,干涉后个体内MSG核酸水平和蛋白水平与对照组相比均下降了80%以上.利用明胶SDS-PAGE和明胶薄层分析方法发现,干涉后精子的蛋白水解活力明显降低.以上结果表明,MSG在罗氏沼虾精子的水解蛋白活性方面起着重要作用.; 杨帆钱叶青马文明李晔杨劲树杨卫军; 关键词：受精雄性生殖系统

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杨劲树