李靖宇 作品数:37 被引量:156 H指数:8 供职机构: 北方民族大学生命科学与工程学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 宁夏回族自治区自然科学基金 国家重点基础研究发展计划 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 环境科学与工程 文化科学 更多>>
甲烷氧化与氨氧化微生物及其耦合功能 被引量:4 2012年 甲烷氧化与氨氧化过程分别对控制温室气体甲烷和氧化亚氮方面有着特殊作用,土壤及湿地等环境中的甲烷氧化菌和氨氧化菌在生态系统碳、氮生物循环中扮演着重要的角色。论述了甲烷氧化与氨氧化过程的微生物学机制,甲烷氧化菌和氨氧化菌的群落结构变化,分析了甲烷氧化菌和氨氧化菌在碳、氮循环以及它们在控制重要温室气体排放中的环境功能,阐述了甲烷氧化菌和氨氧化菌的关联作用机制。以期深入揭示甲烷氧化菌与氨氧化菌的空间分异与耦合机制,为深入探讨这类微生物的生态机制和环境功能提供科学线索。 赵吉 李靖宇 周玉 白玉涛 于景丽关键词:甲烷氧化菌 氨氧化菌 温室气体 草原湿地土壤总DNA提取方法及其在氨氧化微生物研究中的应用 DNA分子生物学技术的广泛应用,为全面了解微生物群落提供了有力的工具。本文新建立了两种从湿地土壤中提取微生物总DNA的方法,即氯化钙-SDS-酶法(新方法1)和玻璃珠-氯化钙-SDS法(新方法2)。在直接提取DNA过程中... 李靖宇关键词:天然湿地 氨氧化细菌 氨氧化古菌 文献传递 基于基因编辑技术创制高亚油酸水稻材料 2021年 【目的】亚油酸是一种人体必需的脂肪酸,能加快体内脂肪代谢与分解、减少胆固醇在血管壁上形成积存、有效预防动脉硬化的发生、提高人体免疫力、促进骨骼发育、提高记忆力、预防脑部功能退化等功能。利用基因编辑技术对控制脂肪酸合成途径的关键酶ω-3脂肪酸去饱和酶基因进行精准编辑,关闭下游产物的合成途径,以便提高水稻上游亚油酸的含量,为创制富集亚油酸水稻材料提供依据。【方法】水稻脂肪酸合成途径中的关键酶ω-3脂肪酸去饱和酶基因(OsFAD3)存在2个拷贝,分别分布在第11和第12染色体,且两者cDNA同源性达97.32%。根据基因编辑原理(编辑的特异性取决于引导RNA(gRNA)的特性),在2个同源基因序列高度一致的外显子区域,分别设计合成2个gRNA,并分别构建植物基因编辑载体,利用农杆菌介导法转化本地受体材料(富源4号)。通过对基因编辑植株进行靶位点测序鉴定,分析2个位点的编辑效率和基因型。同时,对OsFAD3双突变体进行粒宽、粒长等主要籽粒农艺性状分析。采用气质联用检测法测量OsFAD3双突变体籽粒的37种脂肪酸含量。【结果】获得2个位点的纯合编辑材料,同时也获得了其他不同基因型组合的编辑材料;与对照材料相比,OsFAD3双突变体的粒宽、粒长等主要籽粒农艺性状均没有发生显著变化,但稻谷中亚油酸的相对含量提高了3.36个百分点。【结论】在不改变籽粒主要农艺性状的前提下,实现了利用基因编辑技术通过转化一个载体同时精准敲除2个ω-3脂肪酸去饱和酶基因,提高了籽粒中亚油酸的相对含量。 陈晓军 吴凯伸 惠建 白海波 马斯霜 李靖宇关键词:水稻 高亚油酸 米糠油 腾格里沙漠沙坡头地区土壤微生物多样性分析 被引量:13 2016年 为了揭示沙坡头沙漠固沙区与流沙区不同植物根际微生物群落结构的组成、丰度和多样性对沙漠极端环境的响应,采用D N A 提取试剂盒提取土壤总DNA,对细菌群落编码16S rR N A 的基因(16S rD N A )的V 4 - V 5 区进行M iSeq测序,分析各样品中细菌群落结构的组成、丰度以及多样性指标,通过非度量多维尺度(NM DS)法和文氏(V e n n )图解释微生物群落结构对环境的响应.固沙区与流沙区不同土壤样品微生物群落在门水平上主要以变形细菌门(Proteobacteria) 、放线菌门( Actinobacteria) 、酸杆菌门( Aciflobacteria) 和蓝细菌门( Cyanobacteria) 为优势类群.在属水平上,不同样品优势类群差异明显.1 1 个样品在NM DS纵轴方向上按照固沙区与流沙区分为2 大组,说明微生物类群对人工固沙做出了环境响应.文氏图分析结果表明,尽管不同样品之间存在一定差异,但存在共有微生物类群,可能在沙坡头沙漠生态系统中发挥着核心作用.蓝细菌以及根瘤菌在沙生植物固沙过程中对于提供营养物质等生物地球化学循环起着重要作用. 李靖宇 张琇 孙敏 张燕灵关键词:微生物群落 极端环境 生物科学史在微生物学教学过程中的育人功能 被引量:4 2019年 教书育人是教学活动的核心要求,如何充分发挥教学过程中的育人功能,是每一位教育工作者必须面对和思考的问题。科学史作为科学教育的重要资源,将其融入教学过程中,合理再现科学知识产生过程及科学家所做出的贡献,已达到培养科学精神与人文情怀兼备的合格人才。 李靖宇 刘雅琴 范瑞娟 张琇 刘建利关键词:科学史 育人功能 乌梁素海湖滨湿地细菌与氨氧化细菌群落结构空间异质性成因分析 乌梁素海成为世界上沼泽化速度最快的湖泊之一,正向芦苇沼泽→碱蓬盐化草甸→白刺荒漠方向演化。本文探究了乌梁素海富营养化湖泊湿地演化过程中,水陆过渡带沉积物以及土壤中氨氧化细菌群落的组成、丰度、亲缘关系以及多样性变化,结合湿... 李靖宇关键词:湿地 高通量测序 空间异质性 基于高通量测序技术对沙湖水体细菌多样性的分析 被引量:4 2017年 为了解沙湖水体中细菌群落结构和多样性,采用E.Z.N.A.~水样DNA提取试剂盒提取水样总DNA,对细菌群落的16S rRNA基因的V4~V5区进行Mi Seq测序,利用Mothur软件和R语言进行细菌群落结构及多样性的分析。共得到427 975条优化序列,在97%的相似水平下对OTU进行统计分析,得到20门,50纲,95目,161科,276属。样点A、B、C、D的OTU分别为497、496、487和511。优势类群为变形菌门(Proteobacteria)、蓝细菌门(Cyanobacteria)、放线菌(Actinobacteria)、拟杆菌(Bacteroidetes)。沙湖水体中细菌群落结构复杂,但不同位点细菌群落结构的组成以及多样性差异不显著。 张燕灵 李靖宇 刘建利 刘雅琴 张翼飞 赵吉 邓蔚关键词:细菌群落 水体 腾格里沙漠东南缘藓结皮植物–土壤连续体不同粒径土壤微生物群落多样性 2023年 藓结皮作为干旱半干旱地区生物土壤结皮发育演替的稳定阶段,参与了荒漠生态系统的物质循环和能量流动,为微生物多样性的维持提供了微生境。了解藓结皮植物–土壤连续体不同粒径土壤微生物群落多样性对认识藓结皮的生态过程具有重要意义。本研究采用Illumina MiSeq技术对藓结皮植物–土壤连续体以及结皮下层不同粒径土壤微生物多样性和群落结构进行了分析。测序结果得到10,730个细菌变异序列(ASVs)和3,035个真菌ASVs。藓结皮附着土细菌群落α多样性指数低于结皮下层,而藓结皮附着土真菌群落α多样性指数显著高于结皮下层和结皮抖落土。藓结皮层常见的细菌门有放线菌门、变形菌门、绿弯菌门、酸杆菌门、蓝细菌门、拟杆菌门,结皮下层土壤常见的细菌门有放线菌门、变形菌门、绿弯菌门、酸杆菌门,藓结皮附着土细菌群落变形菌门和拟杆菌门相对多度高于不同粒径藓结皮抖落土及藓结皮下层土。藓结皮层和藓结皮下层常见的真菌门有子囊菌门和担子菌门。藓结皮附着土与不同粒径抖落土在细菌群落微枝形杆菌属(Microvirga)、红色杆菌属(Rubrobacter)、苔藓杆菌属(Bryobacter)、土壤红杆菌属(Solirubrobacter)、地嗜皮菌属(Geodermatophilus)、鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas)、芽生球菌属(Blastococcus)、诺卡氏菌属(Nocardioides)、Rubellimicrobium、贫养杆菌属(Modestobacter)相对多度存在显著差异,藓结皮附着土与不同粒径抖落土在真菌群落曲霉属(Aspergillus)、Knufia、Darksidea、粉褶蕈属(Entoloma)、Monosporascus、Bhatiellae、亚隔孢壳属(Didymella)、链格孢属(Alternaria)、Cladosporium、镰刀菌属(Fusarium)相对多度上存在显著差异。藓结皮附着土细菌和真菌共现性网络比不同粒径藓结皮抖落土和藓结皮下层土细菌和真菌共现性网络更复杂且连通性更好。这些研究结果有助于在微环境尺度 段晓敏 李佳佳 李靖宇 李艳楠 袁存霞 王英娜 刘建利关键词:土壤粒径 辉腾锡勒草原干涸湖泊中氨氧化微生物群落结构分析 被引量:5 2012年 【目的】以内蒙古辉腾锡勒草原九十九泉湿地为对象,研究湖泊干涸过程中氨氧化微生物的群落结构及其变化。【方法】通过MPN-PCR定量测定氨氧化古菌(AOA)和氨氧化细菌(AOB)的数量;构建amoA基因克隆文库,进行系统发育分析;结合土壤环境因子,探讨湿地退化过程中影响氨氧化微生物的潜在因素。【结果】依湖泊湿地退水梯度的不同样点中,有75%的样点AOB的数量高于AOA,AOB与AOA的数量比率为0.3-18.1。从湖心到湖岸草原带,AOA和AOB的数量有明显增加,但生物多样性呈降低趋势,二者没有呈现正相关。研究发现,AOB的数量与土壤中NH 4+-N的变化存在良好响应。系统发育分析显示,退化湖泊湿地AOA克隆序列均来自于泉古菌门(Crenarchaeota);AOB的amoA基因的克隆序列大部分与亚硝化单胞菌属(Nitrosomonas)有一定同源性,较少部分与亚硝化螺菌属(Nitrosospira)有一定同源性。【结论】湖泊退水过程增加了湿地土壤氨氧化微生物的数量,而氨氧化微生物的种群丰度有所降低。AOA和AOB群落对湖泊湿地的退化过程做出了响应,其中AOB的响应较为明显,氧化条件和土壤铵浓度的改变可能是促成这种响应的重要原因。 惠丽华 赵吉 武琳慧 邵玉琴 李靖宇 朱兵关键词:氨氧化古菌 氨氧化细菌 生物多样性 湿地土壤微生物DNA提取及其脱腐技术 被引量:20 2010年 DNA分子生物学技术的广泛应用,为全面了解微生物群落提供了有力的工具。本文建立了一种新的从湿地土壤中提取微生物总DNA的方法,即氯化钙-SDS-酶法。在直接提取DNA过程中采用氯化钙去除腐殖酸,DNA提取缓冲液中不使用EDTA螯合剂,提取过程用时4h左右。与其他两种方法相比,该方法高效去除湿地土壤腐殖酸,纯度较高,满足PCR扩增,为微生物生态学研究提供了一种高效的湿地土壤微生物总DNA提取和纯化技术。 李靖宇 赵吉 边玉 武琳慧 于景丽关键词:湿地土壤 DNA提取 腐殖酸 PCR扩增