胥炜
- 作品数:17 被引量:205H指数:7
- 供职机构:中国科学院海洋研究所更多>>
- 发文基金:国家重点基础研究发展计划国家自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域:生物学农业科学医药卫生更多>>
- AFLP和RAPD标记技术在栉孔扇贝遗传多样性研究中的应用比较被引量:18
- 2003年
- AFLP和RAPD标记技术是近年来发展最快的基于PCR基础上的两种DNA标记技术 ,本文比较了两种标记技术在我国栉孔扇贝群体遗传多样性研究中的应用。共筛选 2 0个RAPD引物和 7个AFLP引物组合 ,检测到AFLP标记的有效等位基因数和平均多态信息量稍低于RAPD标记 ,但AFLP标记在每单位分析中扩增到的野生和养殖群体的多态性条带数 ( 2 3 8,2 4 8)分别高于RAPD标记 ( 5 6,5 6) ,AFLP多态性检测效率显著高于RAPD标记。AFLP和RAPD两种标记技术所揭示的野生种群与养殖群体间的近交系数、遗传距离两项指标均表明 ,我国栉孔扇贝养殖群体和野生种群之间尚未出现明显的遗传分化。研究结果表明 :RAPD和AFLP这两种标记技术均可用于栉孔扇贝遗传多样性的分析 ,其分析结果是一致的。
- 王玲玲宋林生李红蕾胥炜李俊强常亚青
- 关键词:栉孔扇贝AFLPRAPD
- AFLP和RAPD标记技术在栉孔扇贝遗传多样性研究中的应用比较
- AFLP 和 RAPD 标记技术是近年来发展最快的基于 PCR 基础上的两种 DNA 标记技术,本文比较了两种标记技术在我国栉孔扇贝群体遗传多样性研究中的应用。共筛选20个 RAPD 引物和7个 AFLP 引物组合,检测...
- 王玲玲宋林生李红蕾胥炜李俊强常亚青
- 关键词:栉孔扇贝AFLPRAPD
- 文献传递
- 海湾扇贝(Argopecten irradians)金属硫蛋白基因的克隆与分析被引量:19
- 2006年
- 金属硫蛋白是一种普遍存在于生物体内的低分子量、半胱氨酸含量丰富、易于被外界刺激诱导的金属结合蛋白。采用表达序列标签法,结合cDNA末端快速扩增技术,首次获得了海湾扇贝金属硫蛋白(AiMT)的全长cDNA序列。该序列全长787bp,5′UTR(UntranslatedRegion)为79bp,3′UTR为270bp,开放阅读框(OpenReadingFrame,ORF)长度为438bp,可编码145个氨基酸。在其编码的氨基酸序列中半胱氨酸含量丰富,甘氨酸含量也较高,芳香族氨基酸含量低,不含组氨酸,存在有无脊椎动物和软体动物金属硫蛋白的特征序列CKCXXX-CXCX,C-末端的氨基酸序列也符合软体动物金属硫蛋白标签序列C-x-C-x(3)-C-T-G-x(3)-C-x-C-x(3)-C-x-C-K。序列特征分析表明,该序列具备金属硫蛋白的典型特征,是金属硫蛋白家族的成员。
- 刘维青倪多娇宋林生吴龙涛胥炜孔晓瑜
- 关键词:海湾扇贝金属硫蛋白基因ESTCDNA文库
- 海湾扇贝G型溶菌酶基因和编码蛋白及其克隆方法
- 本发明涉及G型溶菌酶,特别是海湾扇贝G型溶菌酶基因和编码蛋白及其克隆方法,海湾扇贝G型溶菌酶基因,具有SEQ ID NO.1所示的碱基序列,其编码蛋白具有SEQ ID NO.2所示的氨基酸序列。本发明克隆到的海湾扇贝G型...
- 宋林生邹慧斌胥炜相建海
- 文献传递
- 海湾扇贝和栉孔扇贝EST分析及C型凝集素基因的克隆与分析
- 扇贝养殖业是我国海水养殖的支柱性产业,海湾扇贝和栉孔扇贝是扇贝养殖业中 的两个重要的养殖品种。近年来,养殖扇贝病害不断爆发流行,造成大规模死亡, 经济损失十分惨重。引起扇贝大规模死亡的原因是多方面的,其根本原因则是养 殖...
- 胥炜
- 关键词:海湾扇贝栉孔扇贝微卫星
- 文献传递
- 栉孔扇贝脂多糖葡聚糖结合蛋白(LGBP)基因的克隆及其特征分析被引量:2
- 2004年
- 作为模式识别蛋白的脂多糖葡聚糖结合蛋白(Lipopolysaccharide and beta-1,3-glucan binding protein,LGBP)在无脊椎动物的免疫系统中发挥着重要作用。本研究以鳗弧菌作为病原感染栉孔扇贝,构建全个体cDNA的质粒文库,用T3引物对文库进行随机测序得到一个667bp的cDNA片段(编号:c1305ct320cn336),它与普通蚯蚓的体腔裂解因子前体基因、海胆的β-1,3-葡聚糖酶、非洲疟蚊的革兰氏阴性细菌结合蛋白等有同源性。用T7引物对该克隆测序得到其3’末端。通过SMART-RACE技术克隆得到该克隆的全长cDNA序列。栉孔扇贝LGBP基因由1850个核苷酸组成,它有一个poly A尾巴,编码一条440个氨基酸的多肽。该多肽的分子量估计为47159.076Da,等电点为5.095。推导的氨基酸序列与蓝虾、斑节对虾、海胆、非洲疟蚊、淡水螫虾、普通蚯蚓及普通红蚯蚓等无脊椎动物模式识别蛋白具有高度的同源性。经用Garnier法预测,栉孔扇贝LGBL的二级结构包含螺旋构象10%,折叠片构象17%,转角构象21%,无规则卷曲53%,各种构象所占比例与普通红蚯蚓的体腔裂解因子前体相近。
- 苏建国宋林生胥炜李红蕾吴龙涛蔡中华
- 关键词:栉孔扇贝基因克隆养殖业免疫防御
- 海湾扇贝防御素基因和编码蛋白及其克隆方法
- 本发明涉及防御素,特别是海湾扇贝防御素基因和编码蛋白及其克隆方法,海湾扇贝防御素基因,具有SEQ ID NO.1所示的碱基序列,其编码蛋白具有SEQ ID NO.2所示的氨基酸序列。本发明克隆到的海湾扇贝防御素基因有多聚...
- 宋林生赵建民吴龙涛胥炜相建海
- 文献传递
- 栉孔扇贝热休克蛋白70基因cDNA的克隆与分析
- 克蛋白70Heat shock protein 70,HSP70是热休克蛋白超家族中最重要的成员之一,它在机体抗逆,细胞保护以及新生肽链折叠中起着十分重要的作用。本研究应用表达序列标签法,获得了栉孔扇贝HSP70基因cD...
- 吴龙涛宋林生胥炜邱丽华李红蕾苏建国相建海
- 关键词:栉孔扇贝CDNA文库热休克蛋白基因克隆
- 栉孔扇贝G型溶菌酶基因和编码蛋白及其克隆方法
- 本发明涉及G型溶菌酶,特别是栉孔扇贝G型溶菌酶基因和编码蛋白及其克隆方法;栉孔扇贝G型溶菌酶基因,具有SEQ ID NO.1所示的碱基序列,其编码蛋白具有SEQ ID NO.2所示的氨基酸序列。本发明克隆到的栉孔扇贝G型...
- 宋林生邹慧斌胥炜相建海
- 文献传递
- 栉孔扇贝EST中微卫星标记的筛选被引量:60
- 2003年
- 使用RepeatMasker软件在栉孔扇贝的 6 935条ESTs中发现了 4 2条微卫星序列。选取其中的 7个序列 ,根据微卫星位点的旁侧序列设计引物 ,并对设计出的引物在中国、日本、韩国野生群体中进行多态性检测 ,发现有 6对引物能产生扩增产物 ,其中有 3对引物可望在以后的群体分析及连锁图谱的构建中加以应用。该结果初步证实了在栉孔扇贝的ESTs序列中存在微卫星位点 ,从而为扇贝生物中微卫星标记的筛选开辟了新的途径。
- 李红蕾宋林生王玲玲胥炜相建海
- 关键词:栉孔扇贝微卫星标记生物多样性环境保护