肖四方 作品数:8 被引量:3 H指数:1 供职机构: 中南大学湘雅医学院附属海口医院 更多>> 发文基金: 海南省自然科学基金 海南省卫生厅科研基金 国家自然科学基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 农业科学 更多>>
基于转录组测序的候选膀胱尿路上皮癌分子标记的识别 :探讨基于Illumina平台的转录测序筛选出的膀胱癌的候选分子标记物在临床诊断中的可能应用价值. 方法:对中南大学湘雅医学院附属海口医院2011年至2013年31例膀胱尿路上皮癌和对应的正常组织,采用实时荧光定量... 肖四方 张应爱 肖敬川 曹卉 张淑芳关键词:膀胱癌 分子标记物 一罕见巨大前列腺原发胃肠道间质瘤病例分析 张淑芳 肖四方基于高通量测序的膀胱癌转录组的研究进展 2013年 目前,膀胱癌的发病机理、诊断及治疗等研究已涉及到膀胱癌基因组、转录组与蛋白质组学的各个层面。转录组作为连接基因组和蛋白组的桥梁,是研究肿瘤细胞表型和功能的一个重要手段,同时高通量测序能对一个物种的基因组和转录组进行细致全面的分析,从而为临床疾病的早期预防、诊断和治疗提供有益的信息。 肖四方 张淑芳关键词:膀胱癌 转录组 高通量测序 非肌球蛋白重链9相关疾病患者基因突变一例并文献复习 被引量:3 2014年 非肌球蛋白重链9相关疾病(nonmuscle myosin heavy chain 9 related diseases,MYH9-RD)是一种少见的人类常染色体显性遗传性血液疾病,具有典型的巨大血小板、血小板减少和粒细胞包涵体三大特点以及肾脏受累、听力受损和白内障等临床表型.由于此病临床表型不一,具体可以分为May-Hegglin异常、Epstein综合征、Fechtner综合征、Sebastian综合征[1].2003年,Seri等[2]研究认为,以上4种疾病都是由MYH9基因突变产生的.本研究发现1例MYH9-RD散在病例. 张淑芳 肖敬川 王顺兰 张应爱 黄邓高 肖四方关键词:肌球蛋白重链 基因突变 MAY-HEGGLIN异常 文献复习 DISEASES 基于高通量测序技术的膀胱癌转录组分子标记的初步筛选 目的:基于高通量测序技术、RT-qPCR和免疫组化技术,从转录层面和蛋白表达角度探索膀胱尿路上皮癌发生发展的可能机制,筛选出膀胱肿瘤早期诊断和监测的分子标记。 方法:通过高通量测序技术对一膀胱尿路上皮癌的患者进行转录组... 肖四方关键词:膀胱癌 高通量测序技术 分子标记 转录组 文献传递 基于转录组测序的候选膀胱尿路上皮癌分子标记的识别 目的:探讨基于Illumina平台的转录测序筛选出的膀胱癌的候选分子标记物在临床诊断中的可能应用价值。方法:对中南大学湘雅医学院附属海口医院2011年至2013年31例膀胱尿路上皮癌和对应的正常组织,采用实时荧光定量PC... 肖四方 张应爱 肖敬川 曹卉 张淑芳关键词:膀胱癌 转录组测序 分子标记物 实时荧光定量PCR 文献传递 基于转录组测序的候选膀胱尿路上皮癌分子标记的识别 2014年 目的:探讨基于Illumina平台的转录测序筛选出的膀胱癌的候选分子标记物在临床诊断中的可能应用价值。方法:对中南大学湘雅医学院附属海口医院2011-2013年31例膀胱尿路上皮癌和对应的正常组织,采用实时荧光定量PCR对转录组测序筛选出的候选基因进行验证。结果:筛选出的4个候选基因,CDH1、CLDN7、VEGFA和PTPRF在转录组测序患者肿瘤组织相对于正常组织表达上调;实时荧光定量PCR对更多的患者验证发现,CDH1、VEGFA、PTPRF和CLDN7中,VEGFA相对表达水平上调,差异有统计意义(P<0.05),VEGFA和PTPRF表达相对上调,但差异无统计学意义(P>0.05);PTPRF和肿瘤的初发和复发关系比较密切(P=0.002),其预测敏感度和特异度分别为90.0%和83.3%。结论:VEGFA在膀胱尿路上皮癌的发生发展中起重要作用,有望成为膀胱尿路上皮癌的分子标志物,PTPRF有望作为预测膀胱肿瘤复发的分子参考指标。 肖四方 张应爱 肖敬川 曹卉 张淑芳关键词:膀胱肿瘤 转录组测序 分子标记物 实时荧光定量PCR 转录组差异表达初步筛选膀胱尿路上皮癌分子标记 2014年 目的通过转录组测序初步筛选膀胱尿路上皮癌候选基因。方法对复发的膀胱癌尿路上皮癌患者(T2b N0M0)的肿瘤组织和正常组织进行-50倍覆盖度的高通量转录组测序,筛选得到了和肿瘤密切相关的多种差异表达基因,并对差异表达基因进行基因注释(gene ontology,GO)和KEGG pathway(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)的富集分析。结果在肿瘤组织和正常组织中分别检测到14 520和14 199表达的基因,发现了1 879个重要的差异表达基因,GO和KEGG分析这些基因主要富集在22条生物通路。通路大多和免疫反应、细胞连接、细胞生长发育和迁移有关。筛选得到的和膀胱肿瘤密切相关的基因包括VEGFA、CDH1、PTPRF、CLDN7和MMP2。结论提供了膀胱尿路上皮癌和癌旁非肿瘤膀胱组织的转录本信息,获得了膀胱尿路上皮癌发病密切相关的潜在候选基因,为膀胱癌的早期诊断和个性化治疗提供候选的分子标志物提供理论基础。 肖四方 张冲 野丽莉 谈顺 张应爱 郑文雯 张淑芳关键词:膀胱癌 转录组测序 差异表达基因 分子标记