栾福磊
- 作品数：3 被引量：8H指数：2
- 供职机构：中国农业大学更多>>
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- 相关领域：生物学农业科学轻工技术与工程更多>>
- 生物信息学方法发掘番茄和葡萄中新的microRNA及其靶基因
- 栾福磊
- 关键词：番茄葡萄
- 高效提取富含多糖多酚的果实组织中总RNA的方法被引量：3
- 2009年
- 果实组织中往往富含多糖和多酚,由此导致了果实组织比其他植物组织总RNA的提取要困难的多。本研究以番茄为模式材料,探索自制TRIZOL试剂法从富含多糖的果实组织中提取总RNA。以葡萄为模式材料探索PVP改进法提取富含多酚的果实组织的总RNA的方法。经过纯度、得率检测证明所研究的两种新方法能够保证从富含多糖和多酚的果实组织中获得高得率和高质量的总RNA。
- 栾福磊韩友生邵毅卢丞文陈安钧李玲田慧琴罗云波朱本忠
- 关键词：果实组织总RNATRIZOLPVP
- 生物信息学方法挖掘小麦中的microRNAs及其靶基因被引量：5
- 2009年
- microRNAs(miRNAs)是最近发现的一种内源、非编码、长度约为21nt的小分子RNA,在转录后水平起调控基因表达的作用.先前的研究发现,植物中的miRNAs具有高度的保守性,这为在其他植物物种中通过同源比对发现保守的miRNAs提供了思路.本文利用EST和GSS分析法在小麦中预测miRNA及其靶基因.简单过程是,将其他植物物种中已经发现的miRNA与小麦的EST和GSS数据库比对,经过一系列的标准筛选、预测小麦miRNA.通过这一策略,本文共得到属于18个家族的37条小麦miRNA,其中有10条保守的miRNA是第一次被发现.发现miR395是一个非常特殊的家族,因为它的3个成员成簇的存在形式与动物miRNAs非常相似.本文还利用新发现的小麦miRNAs通过在线软件miRU与编码蛋白的数据库比对,总共预测到361个靶基因,其中一些靶基因参与到了小麦的生长发育、新陈代谢及抗逆过程.
- 韩友生栾福磊朱洪亮邵毅陈安均卢承文罗云波朱本忠
- 关键词：SEQUENCEMICRORNAS靶基因小麦
