李慧娟
- 作品数:2 被引量:5H指数:2
- 供职机构:中国科学院海洋研究所更多>>
- 发文基金:公益性行业(农业)科研专项国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域:生物学农业科学更多>>
- 长牡蛎基因组微卫星引物的开发和特性描述被引量:2
- 2011年
- 长牡蛎于20世纪80年代从日本引进中国。在我国,长牡蛎已经成为重要的贝类养殖产业之一。本实验从全基因组上筛查微卫星序列,在微卫星筛查的范围、数目和类型上是传统的富集文库法开发微卫星所无法比拟的。利用基因组微卫星序列总共设计了104对引物,54对引物能扩增出目的片段,其中有34对引物显示多态性扩增,占32.7%,20对引物显示单态性扩增,占19.2%。在自然群体48个个体样本中分析了这些位点的多态性,结果表明:等位基因数目在2~8之间,观测杂合度和期望杂合度分别在0.065 2~0.795 5和0.063 8~0.853 4之间。34对微卫星分子标记中有7对符合哈迪-温伯格平衡,27对或多或少的偏离平衡。微卫星分子标记可以用作分子遗传育种、遗传连锁图谱的构建、种群遗传结构的分析、亲缘关系分析等方面。
- 韩斐斐亓海刚李莉张国范闫喜武李慧娟杨霏王琳楠
- 关键词:长牡蛎微卫星基因组
- 长牡蛎17个fosmid-SSR标记的开发与分析被引量:3
- 2011年
- 研究所用序列由长牡蛎fosmid文库末端测序获得。首先用TRF程序扫描序列获得一批重复单元为2碱基的候选SSR位点,然后在部分SSR序列两侧的保守区设计50对引物,对取自山东青岛的一个长牡蛎野生群体进行基因型分析。结果显示,共有17个SSR位点显示多态性,等位基因数(Na)平均为4,有效等位基因数(Ne)平均为2.82,平均杂合度观测值(Ho)和期望值(He)分别为0.395 9和0.628 8。其中,11个位点的多态信息含量(PIC)值均大于0.5,共有49个等位基因,适合对长牡蛎群体遗传结构的分析;6个位点0.25
- 李慧娟亓海刚李莉闫喜武张国范
- 关键词:长牡蛎简单重复序列基因组