方宣钧
- 作品数：107 被引量：1,409H指数：22
- 供职机构：海南省热带农业资源开发利用研究所更多>>
- 发文基金：国家高技术研究发展计划福建省自然科学基金国家科技重大专项更多>>
- 相关领域：农业科学生物学环境科学与工程轻工技术与工程更多>>
- 蛋白质基因组学:进展、策略及问题被引量：11
- 2014年
- 蛋白质基因组学(proteogenomics)是一种用来确定新肽的更综合的方法,不仅能在蛋白质水平上验证基因表达和基因精细模式,还能改进蛋白质序列数据库。本文首先总结了现有基因组注释方法,结合质谱技术的发展,详细介绍了基于质谱的蛋白质组学的研究进展;其次,我们还重点呈现和探讨了蛋白质基因组学研究中的蛋白质片段化问题,及质谱数据比对库的构建和肽与蛋白质的鉴定及验证;最后,进一步探讨了基于蛋白质基因组学的基因组注释方法的优缺点。
- 巩鹏涛徐润生方宣钧
- 关键词：质谱基因组注释
- 大豆重组自交系Jinf的构建及主要农艺性状和SSR基因型分析被引量：14
- 2003年
- 本研究以晋豆 2 3为母本 ,灰布支黑豆为父本 ,用“单粒混传”法构建了一个含有 4 74个家系的F10代的大豆重组自交系Jinf。 2 0 0 2年本研究组对F8代RIL群体Jinf进行生育期、形态性状、产量构成及抗逆性等 2 9个性状进行了观察记载和统计分析研究。所有观察性状在RIL群体Jinf中均表现有较大的变异范围 ,绝大部分性状呈连续变异、正态分布 ,且存在双向超亲分离现象 ,表明这些观察性状大都为数量性状由多基因控制。从表型分析初步认为各家系内部趋于纯合。本研究进一步选取了能覆盖大豆基因组的 35 5对SSR引物对RIL群体Jinf进行SSR分析 ,2 12对SSR在亲本中表现有多态性 ,多态率为5 9 72 %。 2 12对引物获得 2 13个座位用来评估大豆群体的遗传结构 ,各座位在群体中的多态性指数趋向于 0 5 ,在 0 375 - 0 5 0 0范围内波动。 16 0个SSR座位 (75 12 % )在群体中呈 1∶1的分离比 ,5 3个SSR座位 (2 4 88% )在群体中偏分离 ,SSR座位的杂异率在 0 - 9 32 %之间。分析还表明 111个家系(94 0 7% )趋于纯合 ,其中 31个家系 (2 6 2 7% )完全纯合 ,而有 7个家系的杂合率在 15 31- 42 72 %之间。分析表明大豆RIL群体Jinf的各个家系的基因型组成父本灰布支的贡献率为 5 1% 。
- 刘学义宛煜嵩王珍马俊奎史宏任小俊任冬莲张小虎李有应冯凤鸣徐俊李永起方宣钧
- 关键词：大豆重组自交系农艺性状SSR基因型分析数量性状
- 快速一步法(ROSE法)提取DNA应用于RAPD-PCR扩增被引量：44
- 1997年
- 对ROSE法的操作程序进行了进一步的简化，“一管一步”即可完成DNA提取全过程，系统地与CTAB和SDS法进行了比较，其提取过程明显比CTAB法、SDS法简单，提取效率分别比CTAB、SDS提高4倍和9倍，无污染物产生；与CTAB和SDs法相比分别节省费用200％和700％。提取的DNA能满足RAPD－PCR研究的需要。因此，改良后的ROSE法可能是一种适合于DNA提取自动化的方法，同时可能成为植物分子育种实验室提取DNA的常规方法。
- 方宣钧孔巍金芜军
- 关键词：DNA抽提ROSE
- 氯代芳香族污染物生物降解菌株的分离及其降解质粒的初步研究被引量：9
- 2000年
- 从工业废水污染的水体和污泥中,分离并筛选到6株对氯苯和苯酚类有机污染物高浓度耐受力的细菌菌株。6株降解细菌能在氯代苯和氯代酚作为唯一碳源的培养介质中生长,具有不同程度降解这类有机污染物的代谢能力。除2号和5号菌外,所筛选的其它4株降解细菌均含有一个或多个质粒。采用2,4D单加氧酶基因tfdA的保守引物和PCR扩增技术,证明在2号和6号菌的染色体和3号菌的大质粒上含有tfdA基因的同源序列。
- 陈明张维徐玉泉方宣钧林敏
- 关键词：污染物降解细菌工业废水生物降解
- 大豆孢囊线虫抗性相关基因的比较作图(英文)
- Soybean cyst nematode (SCN, Heterodera glycines Ichinohe) is the most dangerous disease to cause significant y...
- 方宣钧
- 文献传递
- 水稻成熟胚盾片诱导愈伤组织再生体系的建立被引量：20
- 2002年
- 采用水稻成熟胚盾片诱导愈伤组织作为分化再生的外植体,通过优化激素组合和调节培养基渗透压,建立了适合水稻遗传转化的高效再生体系.将水稻成熟胚诱导愈伤组织分化再生的过程划分为3个不同时期,即成熟胚盾片愈伤组织诱导,胚性细胞诱导保持,胚性愈伤组织分化再生.以Culture I(LS+2,4-D 2.0 mg/L)诱导成熟胚盾片愈伤组织,愈伤组织剥离后接种于CultureⅡ-3(LS+2,4-D 2.5 mg/L+山梨醇3g/L)上诱导胚性愈伤组织,继代后接种于CultureⅢ-2(MS+NAA 0.5 mg/L+6-BA1.0 mg/t+Kinetin 2.0 mg/L+山梨醇8g/L)上分化成苗.培养结果表明,该再生体系所获得的胚性愈伤组织分化再生率均在60%～80%之间.利用本研究建立的高效再生体系建立水稻外源基因遗传转化系统,使转化过程中所得转化愈伤组织高效再生成苗,从而顺利获得转化植株,可以提高水稻外源基因转化的效率,为水稻品种的定向遗传改良提供优良的遗传转化技术体系.
- 伍成祥宛煜嵩徐俊苏金方宣钧
- 关键词：水稻成熟胚愈伤组织
- 大豆异黄酮及其组分含量的遗传分析与QTL检测被引量：6
- 2015年
- 以栽培大豆晋豆23为母本,以山西农家品种大豆灰布支黑豆为父本杂交衍生的447个RIL作为供试群体构建遗传图谱,利用高效液相色谱法定性、定量测定样品中的异黄酮及其组分含量。采用主基因＋多基因混合遗传分离分析法和Win QTLCart 2.5复合区间作图法,对大豆异黄酮及其组分含量进行混合遗传分析和QTL定位。结果表明,大豆苷、黄豆苷元、染料木素、染料木苷、大豆苷元和异黄酮总含量分别受4、4、2、3、2和2对主基因控制,并有多基因修饰。检测到44个与大豆异黄酮及其组分含量相关的QTL,与大豆苷、染料木素、黄豆苷元、大豆苷元、染料木苷和异黄酮总含量相关的QTL分别有10、9、4、7、8和6个。连续2年分别检测到与大豆苷、染料木苷、黄豆苷元和异黄酮关联,分别位于标记区间satt430~satt359、satt038~satt570、satt197~sat_128和satt249~satt285的稳定表达QTL,可尝试用于分子标记辅助育种。
- 梁慧珍余永亮杨红旗许兰杰董薇牛永光张海洋刘学义方宣钧
- 关键词：大豆异黄酮含量QTL
- 贵州地方耐冷水稻品种的SSR遗传多样性分析被引量：10
- 2005年
- 用16对SSR引物对11个贵州地方耐冷水稻品种、2个典型的籼稻品种和2个典型的粳稻品种进行遗传多样性分析,在15份材料中共检测到95个等位基因,每一位点的等位基因变幅为4～12个,平均5 9个,其中有效等位基因70个,有效等位基因的百分数为75 8%,多态位点百分率为38%,贵州地方耐冷水稻品种间遗传距离为0 06～0 53。应用NJ法对基于16对SSR标记数据的品种进行聚类分析,结果表明:15份不同材料可分为粳稻组和籼稻组,粳稻组各品种间遗传距离为0 06～0 53,平均遗传距离为0 303,其中贵州地方耐冷水稻品种间的遗传距离为0 21～0 46,籼稻组各品种间遗传距离为0 297～0 377,平均遗传距离为0 329,11个贵州地方耐冷水稻品种除筒恢211外,其他都属粳稻组。用相同SSR标记数据和聚类方法分别对苗期、芽期、孕穗期和开花期耐冷的水稻品种进行聚类分析发现:同一时期耐冷品种在各自聚类图中的排列位置与全部材料聚类时有所不同,但其亲缘关系远近没有变化。结果表明SSR适合贵州地方耐冷水稻品种的遗传多样性研究和籼粳分类。
- 余显权蒋向辉吴海滨赵德刚方宣钧
- 关键词：SSR
- 表型组学的概念及植物表型组学的发展被引量：33
- 2009年
- 表型组(phenome)是指某一生物的全部性状特征;表型组学(phenomics)是一门在基因组水平上系统研究某一生物或细胞在各种不同环境条件下所有表型的学科。1996年,衰老研究中心主任Steven A.Garan在滑铁卢大学的一次应邀演讲上首次提出了Phenomics(表型组学)这一概念。1998年,比利时的CropDesign公司一成立即开始着手研发可大规模开发转基因和植物性状评价的高通量的技术平台。2005年,该公司的Christophe等发表具有里程碑意义的论文,详细阐述了称之为"性状工厂"(TraitMill)的可大规模自动化分析全生育期植物表型的技术设施。2006年,Niculescu及其同事在发表的论文中描述了一种新的用于表型组学分析的实验定量研究方法,并称之为PhenoChipping。2008年,澳洲植物表型组学设施(Australian Plant Phenomics Facility)在澳大利亚阿德雷德大学威特校区建立。2009年4月,第一届国际植物表型组大会在澳大利亚堪培拉成功举办。本文主要就表型组、表型组学相关概念的定义、研究机构、研究设施、相关文献及植物表型组学的进展做了概述。
- 玉光惠方宣钧
- 关键词：表型
- 一张含有227个SSR标记的大豆遗传连锁图被引量：34
- 2005年
- 利用由大豆主栽种晋豆23和农家种灰布支(ZDD2315)杂交培育的F10代大豆重组自交系群体Jinf,共474个家系作为作图群体。依据1999年Cregan等发表的大豆“公共图谱”,选用441对SSR引物,建成了含有227个SSR座位的大豆SSR连锁图,该图覆盖大豆基因组1900cM,两个相邻标记的平均间距为8.3cM,归属于20个大豆连锁群,与Song等2004年发表的公共图谱相比,所有标记都被定位于相同的连锁群,且排列顺序大致相同,具有很好的线性关系。
- 宛煜嵩王珍肖英华吕蓓方宣钧
- 关键词：大豆基因遗传连锁图SSR标记农家种
