徐海明
- 作品数：70 被引量：455H指数：14
- 供职机构：浙江大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学文化科学医药卫生更多>>
- 猪肉安全质量控制关键技术研究与示范
- 刘媛宋厚辉帅江冰张明洲张晓军张晓峰徐海明方维焕李森李丽萍李肖梁王旻子程昌勇许明曙陈健舜
- 该项目以“食品冷链流通质量安全控制与溯源技术研究及产业化示范”和“食品主要致病微生物控制技术研究与开发”国家科技支撑计划(子课题)、单核细胞增多性李斯特菌应激相关转录组学研究(国家自然科学基金)等课题为依托，以猪肉品质安...
- 关键词：
- 关键词：猪肉试剂盒
- 应用混合遗传距离和基因型值遗传距离构建植物遗传资源核心子集(英文)
- 2011年
- 将连续性的基因型值数据和间断性的分子标记数据整合建立混合遗传距离,对比了应用混合遗传距离和单纯应用基因型遗传距离构建植物遗传资源核心子集的效果.应用混合线性模型中的调整无偏预测法(AUP)预测基因型值,结合不加权类平均法(UPGMA)逐步聚类构建遗传资源群体的核心子集,并检测一系列核心子集的代表性评价参数.采用包含8个农艺性状和60个SSR标记信息的水稻群体数据验证混合遗传距离的有效性.结果表明,采用混合数据构建的核心子集比单纯的基因型值数据构建的核心子集更有代表性.主成分分析结果验证了该结论的可靠性.
- 王建成胡晋徐海明
- 关键词：混合线性模型基因型值
- 拟南芥在盐胁迫环境下SOS转录调控网络的构建及分析被引量：14
- 2010年
- 研究拟南芥在高浓度盐处理环境下的基因调控网络,有助于了解其在盐胁迫环境下保持正常生长的防御机制。针对目前广泛研究的SOS(Salt Overly Sensitive)耐盐机制,文章整合公共数据库中盐胁迫相关的拟南芥基因组表达谱芯片,通过反向工程方法构建了拟南芥在盐胁迫状态下的SOS转录调控网络。所获得的调控网络包含70个盐胁迫相关且高度互作的互作基因,其中27个转录因子为主要调控节点。进而根据SOS核心基因的表达特性,所得调控网络内的不同表达模式得到了鉴别。
- 谢崇波金谷雷徐海明朱军
- 关键词：拟南芥盐胁迫转录调控网络转录因子基因表达
- 基于环境互作的加性-显性-加加上位性模型的多环境指数选择(英文)被引量：1
- 2010年
- 适应性和稳定性是优良品种所必须具备的基本条件。在多个环境下对多个性状进行选择一直是一个悬而未决的难题。基于加性-显性-加加互作以及它们和环境互作的遗传模型,本文提出了两类选择指数:普通选择指数和考虑基因型与环境互作的选择指数(环境互作选择指数)。其中普通选择指数可用于具有广泛适应性品种的选择,环境互作选择指数则可用于具有特定环境适应性的基因型的选择。对于自花授粉作物,本文提出了两类育种值,即普通育种值和基因型与环境互作育种值。其中,普通育种值包括上位性效应和加加上位性效应,基因型与环境互作育种值包括加性、加加上位性与环境的互作效应。应用混合线性模型估算选择指数构建中涉及的方差-协方差分量。以一组陆地棉双列杂交设计试验作为实例,演示了所提出的选择指数的构建过程。本文提出的指数选择方法可望为多环境下多个性状同步选择提供一条有效的途径。
- 张文英徐海明朱军
- 关键词：棉花基因型与环境互作混合线性模型
- 建立在基因型值和分子标记信息上的水稻核心种质评价参数被引量：19
- 2007年
- 采用蒙特卡洛模拟结合混合线性模型的方法,直接从基因型值和分子标记水平上研究了水稻核心种质的11个评价参数,排除了环境因素的干扰,对各个评价参数做出了准确的评价。研究表明,极差符合率(CR)可以作为评价核心种质代表性的首选参数。平均Simpson指数(MD)、平均Shannon-Weaver多样性指数(MI)和平均多态信息含量(MPIC)是评价核心种质代表性的重要参数。变异系数变化率(VR)可以作为评价核心种质变异程度的重要参考参数。多态位点百分率(p)可以作为判断核心种质取样规模的判定参数。均值差异百分率(MD)可作为判断核心种质是否具有代表性的判定参数。本研究筛选出的核心种质评价参数,适用于不同的种质资源群体,可以用作确定核心种质取样比例的判定依据,进而解决了确定核心种质合理取样比例的问题。
- 王建成胡晋张彩芳徐海明张胜
- 关键词：核心种质基因型值蒙特卡洛模拟混合线性模型水稻
- 复杂数量性状基因定位方法的研究
- 朱军吴为人楼向阳徐海明
- 该项目根据生物学的实际规律，提出了一系列针对不同试验群体的数量性状基因位点的分析模型及相应的统计分析方法；发展了基于混合线性模型分析方法的QTL定位和效应估算的统计分析方法；发展了数量性状基因座的动态定位的理论和分析方法...
- 关键词：
- 关键词：数量性状基因定位
- 一种基于混合线性模型的种子数量性状位点定位方法
- 本发明公开了一种基于混合线性模型的种子数量性状位点定位方法，包括：建立统计遗传模型；在全基因组范围内搜索所有可能存在QTL的候选标记区间：将所述的候选标记区间作为协变量，在全基因组范围内搜索显著的QTL位点和二互作标记区...
- 徐海明祁婷曹玉杰祝水金楼向阳
- 文献传递
- 不同遗传距离聚类和抽样方法构建作物核心种质的比较被引量：66
- 2004年
- 以棉花种质资源 16 8个基因型 ,5个纤维性状 [2 5 %跨长 (mm)、整齐度 (% )、强度 (gf/tex)、伸长度 (% )、麦克隆值 ]数据为例 ,用混合线性模型分析方法无偏地预测基因型值 ,利用得到的基因型值 ,分别采用 2种遗传距离 (马氏距离和欧氏距离 )和 7种系统聚类方法 (最短距离法、最长距离法、中间距离法、重心法、类平均法、加权配对算术平均法、离差平方和法 ) ,3种抽样方法 (随机取样法、优先取样法、偏离度取样法 ) ,30 %的抽样比率构建作物种质资源核心种质。用均值、方差、极差和变异系数 4个指标评价不同遗传距离、聚类方法、抽样方法构建核心种质的优劣。结果表明 ,马氏距离优于欧氏距离 ,优先取样法和偏离度取样法都能显著地提高核心种质的方差和变异系数 ,前者略优于后者。最短距离法构建的核心种质能极显著地增加性状的方差和变异系数 ,使核心种质的方差和变异系数最大化 ,是构建核心种质较好的系统聚类方法 ,其次分别是中间距离法、重心法、类平均法。
- 徐海明邱英雄胡晋王建成
- 关键词：种质资源核心种质聚类方法抽样方法
- 利用分子标记和数量性状基因型值构建作物核心种质库的研究被引量：22
- 2005年
- 提出了一种基于分子标记数据及数量性状基因型值构建作物种质资源核心种质库的方法.采用包括基因型与环境互作的遗传模型及相应的混合线性模型统计分析方法,无偏预测各材料的基因型值,分别用基因型值和分子标记数据计算个体间的相似系数,加权得到最终的相似距离.采用不加权类平均法(UPGMA)进行系统聚类,用多次聚类随机取样法构建核心种质库.以水稻DH 群体111个基因型8个农艺性状、175个分子标记位点的数据为实例,按四种抽样比率(25%,20%,15%,10%)构建了四个核心种质库,比较了核心种质库与整个群体的分子标记多样性及数量性状的遗传变异,评价了所用方法的有效性.
- 徐海明胡晋邱英雄
- 关键词：数量性状分子标记核心种质聚类
- 转基因抗虫棉种子品质性状的遗传效应及相关性分析被引量：4
- 2009年
- 采用二倍体种子数量性状遗传模型和统计分析方法,分析了陆地棉9个亲本和30个杂交组合的子指、种仁率、仁壳比、蛋白质含量、油分含量和棉酚含量等种子物理性状和营养品质性状的遗传效应、遗传率和遗传相关性。结果表明,所有棉子品质性状均受种子直接遗传效应和母体遗传效应的共同控制,种仁率还受到细胞质效应的影响。子指和仁壳比以母体显性效应为主,蛋白质含量以显性效应为主,油分含量和棉酚含量以母体加性效应为主。遗传相关性分析表明,棉子物理性状和营养品质性状间的显性遗传相关均达到极显著水平,其中子指与蛋白质含量呈极显著显性正相关,子指与油分含量和棉酚含量呈显性负相关。种仁率和仁壳比与3个棉子营养品质性状间的母体遗传相关均达到了极显著水平。
- 秦利沈晓佳陈进红徐海明祝水金
- 关键词：陆地棉遗传率
