张岩波
- 作品数:200 被引量:932H指数:15
- 供职机构:山西医科大学公共卫生学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金山西省青年科技研究基金山西省科技基础条件平台建设计划项目更多>>
- 相关领域:医药卫生文化科学自动化与计算机技术哲学宗教更多>>
- 基于心力衰竭HMOX2诊断标志物的机器学习模型
- 2023年
- 目的基于生物信息学数据和机器学习技术探索心力衰竭(heart failure,HF)中免疫细胞浸润新型诊断生物标志物,并阐释其潜在作用机制,为HF诊治提供新思路。方法在基因表达综合(gene expression omnibus,GEO)数据库检索获取3个HF免疫细胞浸润组织基因表达数据集,其中GSE5406和GSE84796作为训练数据集,GSE21610作为验证数据集,使用R语言鉴定差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),并进行基因本体论(gene ontology,GO)富集、京都基因和基因组数据库(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析、疾病本体论(disease ontology,DO)富集、基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)、免疫细胞浸润分析。进一步利用最小绝对收缩和选择算子(the least absolute shrinkage and selection operator,LASSO)回归、支持向量机递归特征消除(support vector machine recursive feature elimination,SVM-RFE)和随机森林(random forest,RF)三种高效机器学习算法筛选核心基因,同时进行外部验证和受试者操作特征曲线(receiver operating characteristic curve,ROC曲线)分析。结果使用三种机器学习算法最终确定HMOX2为诊断HF的关键生物标志物,且具有良好的诊断与预测效能,训练组和验证组诊断的ROC曲线下面积分别为94.3%和83.3%。HF组和正常组的样本免疫测定结果显示幼稚B细胞、CD8T淋巴细胞、中性粒细胞与HF相关。结论HMOX2可能是HF发生、发展的潜在分子靶点,并与HF组织的免疫浸润密切相关。
- 武淑琴王远涵曹红艳曹红艳
- 关键词:心力衰竭生物信息学
- 线性混合效应模型在医师职业紧张评价中的应用被引量:1
- 2005年
- 目的介绍线性混合效应模型的基本理论,探讨线性混合效应模型在职业紧张研究中的应用。方法利用线性混合效应模型对某医院医务人员职业紧张的影响因素进行分析。结果线性混合效应模型很好地解决了系统结构数据的统计分析问题,并得到了合理的结果。结论线性混合效应模型是分析具有系统结构特征的职业紧张资料的有效方法。
- 张岩波刘桂芬余红梅郑建中卢莉
- 关键词:线性混合效应模型医师
- 高密度脂蛋白胆固醇水平对冠心病合并心力衰竭患者预后的影响被引量:6
- 2021年
- 目的研究高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)水平对冠状动脉粥样硬化性心脏病(冠心病,CHD)合并心力衰竭(心衰)患者预后的影响。方法选择山西医科大学第一医院和山西省心血管病医院于2014年1月至2018年12月诊断为CHD合并心衰的患者1257例,根据HDL-C水平三分位数将患者分为三组:低水平组(HDL-C<0.89 mmol/L)426例;中水平组(0.89≤HDL-C≤1.11 mmol/L)428例;高水平组(HDL-C>1.11 mmol/L)403例。采用Spearman相关性分析HDL-C水平与CHD合并心衰患者心衰严重程度的相关性,Cox回归方法分析HDL-C水平对患者预后的影响。结果Spearman分析显示,HDL-C与左室射血分数(LVEF)、白蛋白(ALB)呈正相关(P<0.01),HDL-C与年龄、NYHA分级、丙氨酸氨基转移酶(ALT)呈负相关(P<0.01)。多因素Cox回归显示,高水平的HDL-C、体质指数(BMI)>23.9 kg/m^(2)及应用他汀类药物可降低患者的死亡风险,而年龄>65岁、BMI<18.5 kg/m^(2)及LVEF<50%可增加患者的死亡风险(P<0.05)。结论HDL-C水平越低,CHD合并心衰患者其心衰程度越重,高水平的HDL-C可降低死亡风险。
- 李姣蕾田晶田晶张岩波韩清华
- 关键词:冠心病心力衰竭高密度脂蛋白胆固醇
- 网络增强核融合方法的改进及其在乳头状肾细胞癌多组学数据整合分子分型中的应用
- 2024年
- 目的针对网络增强的相似网络融合(network enhancement fusion,ne-SNF)方法先融合不同组学网络,再对融合后的网络降噪,忽略了不同组学相似网络噪声对融合网络影响的问题,本文提出了改进的网络增强融合(improved network enhancement fusion,improved ne-SNF)方法,并探讨其在乳头状肾细胞癌(papillary renal cell carcinoma,PRCC)分子分型中的应用,识别PRCC高危患者,筛选重要通路及免疫浸润细胞。方法通过模拟研究评估improved ne-SNF分型性能,并将其用于PRCC多组学数据的整合分型,利用Cox回归模型分析不同分型患者的预后风险;筛选不同分型的差异表达mRNA(DEmRNAs)、miRNA(DEmiRNAs)及差异甲基化基因(DMGs),并对其重合基因进行KEGG通路分析;最后对不同分型患者进行免疫细胞浸润分析。结果模拟研究结果表明improved ne-SNF在不同信号比例和噪声强度下的分型准确性均优于SNF和ne-SNF。improved ne-SNF方法将PRCC患者分为高危组和低危组,高危组患者的死亡风险是低危组的7.727倍;筛选出3511个DEmRNAs,96个DEmiRNAs及3426个DMGs,其联合分析的649个重合基因得到42条有统计学差异的KEGG通路。此外,筛选出3种在不同分型中存在统计学差异的免疫浸润细胞。结论improved ne-SNF分型性能优于SNF和ne-SNF,且能够有效识别PRCC预后高风险患者,并筛选出PRCC重要通路及相关免疫浸润细胞,为PRCC的治疗及预后提供新的思路和参考依据。
- 师国京李灵梅魏亿芳赵鑫房瑞玲杨海涛余红梅张岩波张岩波
- 关键词:乳头状肾细胞癌分子亚型
- 多分类反应变量的多水平多项式模型及其应用被引量:16
- 2000年
- 目的 具有多层次结构特征的多分类离散数据不宜用常规方法分析 ,本文探讨了多水平多项式模型原理应用。方法 分别从无序和有序分类两种情形 ,研究多水平多项式模型的构造及估计的实现。结果 实例验证多水平模型能给予准确而详尽的结果。结论 对多层次结构的多分类离散数据应使用多水平多项式模型分析 ,在实际应用时 。
- 张岩波何大卫梁执群
- 基于贝叶斯网潜类模型的高维SNPs分析
- 【目的】采用贝叶斯(Bayesian)网的潜类模型对GAW17高维SNPs数据进行分析,为复杂性状疾病遗传以及基因定位等方面的研究提供新的方法支持。【方法】本研究从GAW17提供的包含697个个体22条常染色体的上万个S...
- 张岩波张韶凯马靖
- 关键词:贝叶斯网单核苷酸多态性
- 文献传递
- 验证性因子分析在考试有效性研究中的应用被引量:1
- 2011年
- 考试试题中的不同题型分别反映了学生学习知识的判断能力、鉴别能力、记忆能力、综合分析能力等。依此,文章以题型作为能力特质构建潜变量,以小题为观测变量,采用验证性因子分析进行考试有效性研究。研究表明,验证性因子分析既可以通过模型的整体评价,反映问卷的整体有效性,也可以通过因子载荷评价每个试题的区分度和贡献,该方法可为试卷标准化建设提供依据。
- 薛江平马瑞张岩波
- 关键词:考试有效性验证性因子分析
- Mplus软件简介被引量:3
- 2013年
- Mplus是目前最流行、也是功能最强大的潜变量分析软件。在处理分类潜变量和连续潜变量模型时具有独特的优势。Mplus由LindaMuthen和BengtMuthen于1998年合作研发,目前已经发展到版本6。它具有程序语言简单、统计模型和估计算法多的特点,受到了越来越多的统计工作者的青睐。
- 裴磊磊任琳张岩波颜虹
- 关键词:统计模型
- 青海省非防机构网络直报肺结核病人转诊追踪情况分析被引量:8
- 2012年
- 目的分析青海省非结防机构网络直报肺结核病人追踪情况分析,评价综合医疗机构利用传染病网络进行疑似肺结核病人转诊对肺结核病人发现工作的作用,为提高结核病人发现率提供参考依据。方法收集青海省2009-2010年非结核病机构网络报告情况工作报表,统计分析非结防机构网络直报肺结核病人的转诊、追踪及到位情况。结果 2009-2010年青海省非结防机构网络直报疑似肺结核病人7 716例,经转诊后主动到位2332例,转诊主动到位率30.2%;经结防机构追踪后到结防机构就诊病人共数4 396例,总体到位率55.68%,明显高于转诊主动到位率。结论加强国家对结核病免费治疗政策的宣传,将有效提高非结防机构网络直报中病人的转诊到位工作;加强对医院结核病报病的管理,及时认真地进行网络报病,将有利于结防机构对病人核查追踪工作。
- 王蓉张岩波马斌忠周毅马永成
- 关键词:肺结核病网络直报
- 线性测量误差模型及其在医师职业紧张研究中的应用
- 2007年
- 目的介绍线性测量误差模型的基本理论,探讨它在医学研究领域中的应用。方法利用线性测量误差模型对某医院医务人员职业紧张的影响因素进行分析。结果线性测量误差模型能够在很大程度上解决由测量误差带来的问题,针对具体问题拟合恰当的线性测量误差模型,可以得到合理的结果。结论线性测量误差模型是分析带有测量误差数据的有效方法。
- 董丽芳张岩波刘桂芬余红梅徐秀娟