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崔金玉
作品数:
2
被引量:2
H指数:1
供职机构:
青岛农业大学生命科学学院
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发文基金:
教育部重点实验室开放基金
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相关领域:
农业科学
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合作作者
孙效乐
青岛农业大学生命科学学院
杨松
青岛农业大学生命科学学院
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Ⅰ型甲烷氧化菌Methylomicrobium alcaliphilum 20Z利用EMP途径高效同化代谢甲烷
甲烷是重要一碳化工资源和驱动全球气候变暖关键因素.合理而高效地开发甲烷资源不论是从一碳化工和能源战略的发展出发,还是从保护生态环境、合理减排的方面,都具有重大科学和现实意义.目前,探讨利用甲烷氧化菌有效转化甲烷成为国内、...
杨松
崔金玉
孙效乐
甲烷氧化菌20Z利用Embden-Meyerhof-Parnas途径高效同化甲烷
被引量:2
2014年
为了探究γ-变形菌纲(Gammaproteobacteria)甲烷氧化菌Methylomicrobiumalcaliphilum 20Z的甲烷同化代谢过程。文中整合RNA。seq、LC.MS技术并结合13C标记策略对核酮糖单磷酸途径(Ribulosemonophosphatepathway)及下游途径展开系统组学分析。Malcaliphilum 20Z代谢物组定量分析表明Entner-Doudorofr(EDD)途径的中间代谢物6一磷酸葡萄糖的浓度是(150.95±28.75)μmol/L,2-酮-3-脱氧-6-磷酸葡糖酸浓度低于质谱定量分析检测限,而Embden-Meyerhof-Pamas(EMP)途径中果糖1,6-二磷酸、甘油醛-3-磷酸/二羟丙酮磷酸和磷酸烯醇式丙酮酸的浓度分别是(1142.02±302.88)μmol/L、(1866.76±388.55)μmol/L和(3067.57±898.13)±mol/L。通过EDD和EMP途径的代谢物13C同位素动态富集研究,进一步揭示3位标记丙酮酸丰度是l位标记丙酮酸丰度的4-6倍。最后,基因表达比较分析发现EMP途径的关键基因(如:fbaA、tpiA、gap和pykA)的表达水平(RPKM)分别是2479.2、2493.9、2274.6和1846.0,而EDD途径中基因(如:pgi、eda和edd)的RPKM仅是263.8、341.2和225.4。综合上述结果阐明EMP途径才是Malcaliphilum20Z进行甲烷同化的关键通路。EMP途径代谢功能的全新阐述不但改变对Gammaproteobacteria甲炕氧化菌甲烷同化模式的传统认知,而且为甲烷高效生物催化转化提供重要的理论基础。
崔金玉
姚陆
孙效乐
Marina G. Kalyuzhnaya
杨松
关键词:
甲烷氧化菌
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