刘静
- 作品数：39 被引量：33H指数：3
- 供职机构：江苏省农业科学院更多>>
- 发文基金：江苏省农业科技自主创新基金国家自然科学基金国家重点实验室开放基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学自动化与计算机技术更多>>
- GrTEdb: a database of the transposable elements in the cotton genome
- Background: Transposable elements (TE), the most abundant DNA components in all characterized genomes of highe...
- 徐珍珍刘静杜建厂
- 关键词：GOSSYPIUMTRANSPOSABLEELEMENTS
- 一种批量计算LTR-反转座子插入时间的方法
- 本发明公开了一种批量计算LTR?反转座子插入时间的方法，具体步骤包括：将待测LTR?反转座子的LTRs序列放到一个文本文件中，命名为INPUT，INPUT文件需为fasta格式，并且LTR?反转座子两侧LTRs序列的ID...
- 刘静徐珍珍杜建厂
- 文献传递
- 一种批量计算近缘物种间基因组编码区SNP位点的方法
- 本发明公开了一种批量计算近缘物种间基因组编码区SNP位点的方法。本发明所提供的计算近缘物种间基因组编码区SNP位点(coding SNP，cSNP)的方法综合运用了基于Blast成对比对结果后进行聚类搜索直系同源基因的I...
- 郭月刘静杜建厂胡茂龙浦惠明张洁夫龙卫华张维周晓婴
- 植物LTR-反转座子中Orf1基因的分子进化被引量：1
- 2013年
- LTR-反转座子是植物基因组的主要组成部分。它们在结构上非常保守,通常含有gag和pol两个基因,是完成其转座过程所必需的。在前期研究中,本项目组对大豆基因组SARE转座子家族进行了详细的分析。结果表明,该家族的拷贝中还存在第3个基因——Orf1。文章借助生物信息学的研究方法,对33个已测序的基因组进行了全基因组注释。结果发现,在7个植物基因组（桉树、杨树、棉花、大豆、百脉根、亚麻和苜蓿）中,部分LTR-反转座子元件在gag基因的上游存在约1~2kb未知的Orf1基因或基因片段。这类转座子多数在0~3百万年内插入到其所在的寄主基因组中,但它们在不同物种中的分子结构、发生的频率、扩增的强度和活跃的时期等方面差异较大。系统进化树分析表明,这类具有特殊结构的转座子较整齐的聚类到双子叶植物的一个进化分支上,表明它们可能是部分双子叶植物在进化过程中所产生的。不同物种间的相对保守性、大量拷贝的转录活性以及可能存在的多个功能结构域,提示Orf1基因可能具有一定的生物学功能。
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- 关键词：ORF1基因植物基因组进化
- 一种与不结球白菜VC含量相关的KASP标记及其应用
- 本发明公开了一种与不结球白菜VC含量相关的KASP分子标记及其应用。该分子标记位于不结球白菜基因组A03号染色体上的527509位，在527509位发生C向T的点突变；其中，用于扩增所述分子标记的KASP引物组包括正向引...
- 徐海刘静刘之洋陈龙正宁宇
- 一种非组培方式的不结球白菜再生方法
- 本发明公开了一种非组培方式的不结球白菜再生方法，该方法包括以下步骤：将经过催芽处理的不结球白菜种子置于穴盘内生长；在幼苗长至子叶展开期或两叶一心期时，将幼苗顶端分生组织用新刀片切去，确保子叶一并切去，仅留有下胚轴，将农杆...
- 刘之洋刘静宁宇徐海陈龙正晋晨夏彭飞袁希汉
- 一种批量提取基因组基因信息并翻译比对分析序列的方法
- 本发明公开了一种批量提取基因组基因信息并翻译比对分析序列的方法。本发明所提供的批量提取基因组基因信息并翻译比对分析序列的方法综合运用了基于多序列比对分析的MUSCLE程序，并结合多个Perl脚本语言编程的方法。实验证明，...
- 郭月刘静胡茂龙浦惠明张洁夫龙卫华张维周晓婴孙程明
- 一种苦瓜白粉病菌单孢的分离方法
- 本发明公开了一种苦瓜白粉病菌单孢的分离方法，该方法包括以下步骤：将经过消毒处理的新鲜苦瓜叶片置于甘露醇培养基上，通过病叶上的白粉病菌病斑对新鲜苦瓜叶片进行侵染并培养；收集培养的白粉病菌分生孢子于无菌水中得到孢子悬浮液；将...
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- 文献传递
- 一种批量计算基因组直系同源基因进化速率的方法
- 本发明公开了一种批量计算基因组直系同源基因进化速率的方法。本发明所提供的计算基因组直系同源基因进化速率的方法综合运用了基于Blast成对比对结果后进行聚类搜索直系同源基因的InParanoid程序，基于多序列比对分析的M...
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- 文献传递
- 长江中下游地区夏季芹菜轻简化高效栽培技术被引量：2
- 2020年
- 为了发挥芹菜营养丰富,维生素、矿物质含量均衡,兼具降压镇静、健胃利尿功效的优势,克服酷热、高温对芹菜产量和品质的严重影响,满足人们夏季对优质芹菜的旺盛需求,江苏省农业科学院蔬菜研究所经试验探索,总结出1套适合长江中下游地区的夏季芹菜栽培技术。经反复试验得出:遮阳网+地膜覆盖是实现夏季芹菜轻简化栽培的核心关键技术,同时对品种选择、育苗、定植、田间管理、病虫害防治等环节进行相应改进,成功实现了夏季芹菜的轻简化高效栽培,取得了可观效果,可为芹菜的夏季生产提供一定的借鉴和技术支撑。
- 宁宇刘静刘之洋熊爱生陈龙正
- 关键词：芹菜夏季栽培
