Dof(DNA-binding with one finger)蛋白是一类在植物中起着关键作用的转录因子。本研究对萝卜Dof转录因子基因家族进行了系统进化关系、保守模体、染色体位置分布及不同组织表达模式分析。研究发现,萝卜基因组中鉴定出的63个Dof基因,分布于9条染色体上,可以分为9个亚族。十字花科(Brassicaceae)四种作物系统进化树的分析表明,该家族基因在植物中具有高度同源性。对其在不同组织和发育时期的表达模式研究发现,该基因家族具有一定的时空表达特异性。基因RsaDof03和RsaDof25在各个组织中表达量均相对较高,预测其参与萝卜不同的发育过程。本研究为进一步研究萝卜Dof基因家族的功能提供科学依据。
脂氧合酶(lipoxygenase,LOX)是一类重要的含非血红素铁的蛋白,在植物生长发育、响应生物和非生物胁迫时起重要作用。为进一步明确茄子中LOX基因及其进化关系,对茄子全基因组进行分析筛选,共鉴定出12个SmeLOX基因。它们分布在茄子1、3、8和9号染色体上。系统发育树分析表明,茄子LOX家族基因可分为9-LOX、type I 13-LOX和type II 13-LOX 3类。此外,利用实时荧光定量PCR对鉴定出的12个茄子SmeLOX基因进行组织表达分析,结果表明,SmeLOX1、SmeLOX4、SmeLOX6和SmeLOX8基因在茄子5种组织(根、茎秆、叶片、花、果实)中均有表达。研究结果为进一步研究SmeLOX基因在茄子生长发育过程中的功能提供了科学依据。
