公共文化服务平台

王慧华: 作品数：26 被引量：133H指数：7; 供职机构：中国农业科学院北京畜牧兽医研究所更多>>; 发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划国家肉羊产业技术体系建设项目更多>>; 相关领域：农业科学生物学自动化与计算机技术更多>>

合作作者

乌珠穆沁绵羊RIPK2基因多态性与生长性状的关联被引量：6: 2016年; 【目的】基于前期绵羊肉用性状GWAS研究结果,旨在探讨RIPK2基因对乌珠穆沁绵羊生长性状的影响,找到该基因中与绵羊生长性状相关的分子标记,同时对GWAS结果进行验证。【方法】在343只乌珠穆沁绵羊试验群体中,选取其中30个个体的血液DNA样本,以相同浓度组成池DNA,设计引物对RIPK2基因外显子及其上下游1 000bp的调控区进行PCR扩增,PCR产物检测为目的条带后测序。使用DNAMAN和Chromas2软件对测序峰图进行分析,采用飞行质谱方法对检测到的SNP位点及前期GWAS得到的SNP位点进行基因型分型。使用Haploview软件对多态位点构建单倍型及连锁不平衡分析。使用SPSS（22.0）软件进行RIPK2基因SNP位点与生长性状间的关联分析。【结果】共发现了4个多态位点,A5536G的同义突变rs01位于第四外显子内,在该位点检测到三种基因型,AA基因型频率为0.42,AG基因型频率为0.45,GG基因型频率为0.13,优势等位基因为A,其频率为0.65;在第七外显子上检测到T8952C错义突变rs02,在该突变位点检测到3种基因型,其中TT基因型频率为0.82,TC基因型频率为0.16,CC基因型频率为0.02,T为优势等位基因,基因频率为0.9;在第十外显子检测到T2836C的突变rs05,在该位点检测到两种基因型TT和CC,没有检测到杂合子基因型,TT基因型频率为0.25,CC基因型频率为0.75;上游调控区发现一个G5181C的突变rs30,有3种基因型,其中GC基因型频率为0.50,CC基因型频率为0.18,GG基因型频率为0.32,G为优势等位基因,其频率为0.58;GWAS得到的SNP位点是T4456C,在本研究中被命名为rs34,在该位点有3种基因型,其中TT基因型频率为0.49,TC基因型频率为0.37,CC基因型频率为0.14,优势等位基因T的频率为0.68。χ^2适合性检验发现,除rs34位点外,其余位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态（P〉0.05）。rs02位点处于低度多态（PIC〈0.25）,; 马晓萌轩俊丽王慧华袁泽湖吴明明朱才业刘瑞凿魏彩虹赵福平杜立新张莉; 关键词：生长性状多态性

利用微卫星标记鉴定北京油鸡的方法: 本发明提供了一种利用微卫星标记鉴定北京油鸡的方法，该方法是以待测鸡的基因组为模板，以5’-TGCGGAGAGCAATTAGTCTGC-3’和5’-GGAAAACAATCACTGCCTCG-3’为引物，对LEI0070微卫...; 文杰赵桂苹刘冉冉崔焕先郑麦青陈继兰王慧华李鹏; 文献传递

不同尾型绵羊全基因组选择信号检测被引量：16: 2015年; 为研究不同尾型绵羊群体遗传分化程度,检测全基因组选择信号,以挖掘不同尾型绵羊重要性状相关的候选基因。本研究基于蒙古羊(短脂尾)和藏羊(瘦尾)群体的Illumina Ovine SNP 50K芯片分型数据,借助遗传分化系数FST法进行群体间选择信号检测,寻找选择信号区域内的重要基因,并对其中与脂肪代谢相关的基因PPARG、PDGFD在呼伦贝尔羊(大尾和小尾品系;肥尾)与藏羊(瘦尾)尾脂进行mRNA相对表达量研究。结果,(1)465个SNPs被选择,基因注释找到448个候选基因,筛选到50个与脂类代谢相关的基因,GO功能富集分析发现,主要富集在脂类生物合成过程、磷脂代谢、脂质结合等条目,此外发现4个基因(PPARG、RXRG、SLC27A2和ACSL6)富集到PPAR信号通路。(2)肥瘦尾之间,呼伦贝尔羊(大尾和小尾品系)PPARG和PDGFD基因表达量均显著高于藏羊(P<0.01),而大小肥尾之间,呼伦贝尔羊大尾品系PPARG基因表达量显著高于小尾品系(P<0.05),PDGFD基因表达量则无明显差异。通过FST法有效检测到受选择的基因,部分与绵羊重要性状相关,相对定量试验证明PPARG和PDGFD基因与尾部脂肪沉积密切相关,可以作为尾型选育的候选基因,为绵羊育种及改良提供重要参考。; 刘真王慧华刘瑞凿吴明明张淑珍张莉赵福平杜立新魏彩虹; 关键词：全基因组候选基因脂肪沉积

Hox基因家族及其对动物脊椎形成的影响被引量：2: 2022年; Hox基因编码保守的转录因子,它们控制发育过程中胚胎的骨骼模式。它们在受限的区域表达,并调节特定椎骨的形态。从最初在果蝇中发现该基因家族至今已有四十多年的历史。不断更新的研究使人们对Hox基因在脊椎动物中轴骨骼模式化中的作用有了新见解。本文综述了Hox基因在建立轴向形态中的遗传学和胚胎学发现,以及这些综合结果如何影响目前对脊椎动物Hox调控的理解。便于今后对动物的脊椎形态及数量变异进行研究。; 李桃桃金美林费晓娟王慧华陆健狄冉魏彩虹; 关键词：HOX基因胚胎

亲缘矩阵(Kinship)对绵羊初生重GWAS结果的影响: 王慧华魏彩虹赵福平张莉杜立新; 关键词：KINSHIP GWAS

利用微卫星标记鉴定北京油鸡的方法: 本发明提供了一种利用微卫星标记鉴定北京油鸡的方法，该方法是以待测鸡的基因组为模板，以5’-TGCGGAGAGCAATTAGTCTGC-3’和5’-GGAAAACAATCACTGCCTCG-3’为引物，对LEI0070微卫...; 文杰赵桂苹刘冉冉崔焕先郑麦青陈继兰王慧华李鹏; 文献传递

绵羊体重性状全基因组关联分析被引量：10: 2014年; 本研究旨在利用全基因组关联分析方法(genome-wide association studies,GWAS)挖掘影响绵羊体重性状的遗传标记和功能基因。采用Illumina OvineSNP50BeadChip中密度商业化羊芯片,对3个品种(苏尼特羊、德国肉用美利奴羊和杜泊羊)共计329只绵羊的体重性状(初生重、断奶重、6月龄重、断奶前日增重、断奶后日增重、日增重)进行GWAS分析。统计分析和基因注释基于TASSEL软件、混合线性模型和2012年10月公布的最新版绵羊基因组Ovis_aries_v3.1序列信息。结果表明,有10个SNPs位点在全基因组显著水平上与断奶后日增重相关,部分位点分布在羊注释基因内(MEF2B、RFXANK等);除此之外还检测到22个SNPs在染色体显著水平上与其他体重性状存在相关性,获得一批重要的候选基因。这些基因对绵羊体重性状功能基因的挖掘具有重要的理论意义和参考价值。; 张莉刘佳森徐凌洋赵福平陆健张世芳王慧华张晓宁魏彩虹陆国彬郑友民杜立新; 关键词：绵羊体重性状全基因组关联分析

不同鸡种TLR1和TLR2基因SNP检测分析被引量：3: 2014年; 本研究利用DNA直接测序技术对9个地方鸡种(北京油鸡、白耳鸡、溧阳鸡、河南斗鸡、泰和乌骨鸡、大骨鸡、狼山鸡、仙居鸡、茶花鸡)和1个引进品种(白来航蛋鸡)鸡Toll样受体1(chTLR1-1、chTLR1-2)、Toll样受体2(chTLR2-1、chTLR2-2)基因的全部外显子、部分内含子及5′调控区的序列进行单核苷酸多态性(SNPs)检测。结果共发现了27个SNP位点,96%的SNPs位于编码区,其中33%的SNPs为错义突变。chTLR2-1基因在所有品种中均未发现SNP位点,chTLR1-1、chTLR1-2和chTLR2-2基因在9个地方品种中突变位点较为丰富,且不同品种间SNP数量差别较大,但在白来航蛋鸡中均未发现SNPs位点。本试验为进一步开展地方鸡种chTLR1和chTLR2基因多态性与抗病研究提供了理论依据。; 张之宣营凡王慧华李鹏赵桂苹; 关键词：SNP

SPF鸡人工感染肠炎沙门氏菌死亡率与TLR4基因多态性的研究: 本研究对121只21日龄SPF白莱航鸡感染109CFU肠炎沙门氏菌,并记录攻毒后5天内(DPI)鸡群的死亡情况。利用DNA直接测序技术对感染鸡TLR4基因的全部外显子、部分内含子及5’上游调控区共5500bp序列进行单核...; 郑麦青张之宣李鹏刘丽刘冉冉文杰王慧华赵桂苹; 关键词：单倍型死亡率; 文献传递

绵羊胚胎发育中后期骨骼肌BTG2/3的表达动态及其与Myostatin的关系被引量：9: 2015年; 旨在探究绵羊胚胎中后期骨骼肌BTG2/3(B cell translocation gene 2/3)的动态表达情况,探索肌肉生长抑制素(Myostatin,MSTN)基因对其表达的影响。以特克赛尔(Texel)和乌珠穆沁(Ujimqin)绵羊85、100、120和135d4个不同发育阶段的胎儿背最长肌为研究对象,利用Real-time PCR技术分别检测MSTN及BTG2/3的表达差异;选取100d各胚胎半膜肌、背最长肌、半腱肌和股四头肌检测不同组织BTG2/3的表达差异;构建稳定慢病毒干扰载体pFU-GW-myostatin,分别感染处于增殖和分化阶段的绵羊成肌细胞,检测BTG2/3表达水平变化。结果显示,随着胚胎生长,特克赛尔羊胎儿MSTN表达量持续下降,而乌珠穆沁羊胎儿先下降后上升,特克赛尔羊胎儿BTG2表达量呈先升高后降低趋势,而乌珠穆沁羊表现出先降低后升高再降低的趋势;BTG3的表达量在特克赛尔羊与BTG2表达趋势相同,而乌珠穆沁羊则与BTG2相反;100d胎儿4种不同骨骼肌组织中,特克赛尔羊与乌珠穆沁羊相比,背最长肌和半腱肌中BTG2表达量极显著偏高(P<0.01),而半膜肌和背最长肌中BTG3表达量极显著偏低(P<0.01);慢病毒干扰载体对成肌细胞具有较高的感染和干扰效率,增殖和分化阶段的成肌细胞被MSTN干扰后,BTG2和BTG3表达量极显著降低(P<0.01)。综上表明,BTG2和BTG3对绵羊胎儿中后期骨骼肌发育有重要作用,可能参与myostatin调节通路。本研究对绵羊胚胎发育过程的分子机制研究具有重要意义。; 刘瑞凿刘真吴明明王慧华朱才业张莉赵福平魏彩虹杜立新; 关键词：特克赛尔胎儿

王慧华

合作作者

文献类型

领域

主题

机构

作者

传媒

年份

用户反馈

王慧华

合作作者

文献类型

领域

主题

机构

作者

传媒

年份

用户登录

用户反馈