段丽琼 作品数:7 被引量:15 H指数:2 供职机构: 上海交通大学医学院附属第九人民医院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 上海市科学技术委员会科研基金 上海市教育委员会重点学科基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 更多>>
头颈鳞癌生物标志物的研究 目的应用Affymetrix HU95A 基因表达谱芯片完成头颈鳞癌及其对应正常组织标本基因表达谱的检测;通过标本验证和文献分析,寻找和确定头颈癌早期分子分类、转移诊断和预后判断的分子靶点。材料和方法收取22例头颈鳞癌组... 陈万涛 吕晓智 张萍 冯元勇 段丽琼 张陈平 张志愿关键词:鳞癌 分子诊断 基因表达谱 基因芯片 文献传递 口腔颌面鳞癌寡核苷酸功能芯片的点制和验证 目的从前期的头颈鳞状细胞癌基因表达谱筛选的38个候选基因,并结合近五年相关文献报道中筛选并验证与口腔鳞癌特异性表达的靶标基因,合成基因寡核苷酸探针,制作成特异的口腔鳞癌寡核苷酸功能芯片,通过进一步临床研究为口腔颌面鳞癌的... 段丽琼 陈万涛文献传递 口腔鳞状细胞癌转移相关基因实时定量PCR的验证 目的:对应用基因表达谱芯片从高低转移潜能的口腔鳞癌细胞系中筛选出的差异表达基因,进行基因转录水平的定量验证,筛选转移相关的基因。方法:选择基因表达谱芯片检测发现的、在高低转移潜能的口腔鳞癌细胞系中的差异表达基因。应用实时... 严明 陈万涛 李军 张萍 周晓建 段丽琼关键词:鳞状细胞癌 基因芯片 文献传递 口腔颌面鳞状细胞癌相关基因的筛选与定量验证 被引量:9 2006年 目的筛选和验证与口腔颌面鳞状细胞癌密切相关的基因,为口腔鳞癌寡核苷酸功能芯片的制作提供可靠的靶标基因。方法选用近5年口腔鳞癌基因表达谱芯片检测方面的文献资料,按标准筛选可能与口腔鳞癌相关的基因,用22对临床配对肿瘤与正常黏膜组织,采用实时定量PCR技术验证候选基因的表达情况,结合内参照3-磷酸甘油醛脱氢酶(GAPDH)管家基因进行相对定量分析。结果在课题组前期筛选到38个口腔鳞癌密切相关基因的基础上,又筛选出8个相关基因,其中富含半胱氨酸酸性分泌蛋白(SPARC)、血小板源生长因子A(PDGF-A)、丝氨酸蛋白酶抑制剂E(SERPINE1)、转化生长因子Cβ_1(TGF-β_1)、血管内皮生长因子C(VEGF-C)基因分别在16个以上肿瘤组织标本中过表达,细胞角蛋白15(CK15)基因在19个肿瘤标本中低表达,且肿瘤与正常黏膜组织存在差异,具有统计学意义(P<0.01)。细胞周期D1蛋白基因(CCND1)和细胞凋亡相关的抑制蛋白(BIRC3)基因在肿瘤组织中过表达,但与正常组织差异无统计学意义(P>0.05)。结论SPARC、PDGF-A、SERPINE1、TGF-β_1、VEGF-C、CK15是与口腔鳞癌密切相关的基因,可作为口腔颌面鳞癌寡核苷酸功能芯片制作的靶标基因。 段丽琼 陈万涛 张明宾 胡永杰 吕燕 严明关键词:基因 聚合酶链反应 口腔鳞癌与正常黏膜中T细胞分化蛋白mRNA的表达 被引量:1 2009年 目的:研究T细胞分化蛋白(T-cell differentiation protein,MAL)mRNA在口腔鳞状细胞癌(oral squamous cellcarcinoma,OSCC)及配对正常口腔黏膜组织中的表达及意义。方法:采用RT-PCR方法检测30例OSCC患者肿瘤组织及其配对的正常口腔黏膜中MAL mRNA的表达,所得数据采用SAS6.12软件包进行χ2检验和t检验。结果:RT-PCR检测表明,MAL mRNA在30例OSCC和配对正常黏膜的阳性率分别为36.7%(11/30)和86.7%(26/30)(P<0.001);总表达水平分别为1.20±0.18和2.96±0.36,OSCC中表达水平较正常黏膜中表达下调2.47倍(P<0.001);MALmRNA在OSCC中表达下调与患者的性别、肿瘤的临床分期、有无颈淋巴结转移等临床参数无关,但与病理分化程度显著相关。结论:在OSCC的癌变过程中,MAL mRNA表达下调,表明MAL基因可能是OSCC的一个靶基因;MAL在OSCC诊断中具有潜在的应用价值。 吕晓智 殷学民 冯元勇 段丽琼 陈万涛 张陈平关键词:口腔鳞状细胞癌 RT-PCR 骨桥蛋白mRNA在口腔鳞癌与正常黏膜中的表达及临床意义 被引量:4 2008年 目的探讨骨桥蛋白(OPN)mRNA在口腔鳞状细胞癌(OSCC)及配对正常口腔黏膜组织中的表达及临床意义。方法用SYBR Green I荧光定量RT-PCR方法检测30例OSCC患者肿瘤组织及其配对的正常口腔粘膜中OPN mRNA的表达。结果Real time RT-PCR检测结果表明,OPN mRNA在OSCC和配对正常粘膜的表达水平分别为4.17±0.51和0.97±0.12,上调4.3倍(P<0.001)。在30例OSCC标本中,OPN mRNA在高分化鳞癌中的表达为2.16±0.17,中/低分化鳞状细胞癌中的表达为6.80±0.72,下调3.1倍,P<0.05;在颈淋巴结阳性组表达为6.38±0.56,颈淋巴结阴性组为2.89±0.32,上调2.2倍,P<0.05;在临床早期表达为2.34±0.17,临床晚期表达为4.73±0.35,下调2.0倍,P<0.05。结论在OSCC的癌变过程中OPN基因的表达水平显著上调,可能是OSCC诊断、治疗及预后判断的一个靶点基因;OPN在OSCC分类诊断中有应用价值。 吕晓智 殷学民 冯元勇 段丽琼 陈万涛 张陈平关键词:口腔鳞状细胞癌 骨桥蛋白 实时荧光定量 口腔鳞状细胞癌转移相关基因实时定量PCR的验证 被引量:1 2007年 目的对应用基因表达谱芯片从高低转移潜能的口腔鳞癌细胞系中筛选出的差异表达基因,进行基因转录水平的定量验证,筛选转移相关的基因。方法选择基因表达谱芯片检测发现的、在高低转移潜能的口腔鳞癌细胞系中的差异表达基因,应用实时定量PCR定量检测方法,在口腔鳞癌低转移细胞系Tca8113及其配对的高转移亚细胞系Tb细胞中,进行基因转录水平的检测。将两种检测结果进行对比分析,筛选出可能与口腔鳞癌转移有关的基因或信号转导通路。结果选择9个基因进行研究。其中有6个基因在高转移的Tb细胞中高表达,1个基因表达下调,2个基因在Tb和Tca8113细胞中表达无明显差异。实时定量PCR检测结果与基因芯片结果的符合率为66.7%。NF-κB信号转导通路中的主要基因A20、IκBα、TANK和p65在Tb细胞中表达明显上调。结论NF-κB信号通路和其它一些基因,如IER3、CD44和GPMNB可能在口腔鳞状细胞癌侵袭和转移过程中发挥重要作用,这些基因和信号通路为深入研究口腔鳞癌转移的分子机理和治疗靶点奠定了基础。 严明 陈万涛 李军 张萍 周晓建 段丽琼关键词:鳞状细胞癌 基因芯片 NF-KAPPA