李宏俊
- 作品数:32 被引量:138H指数:6
- 供职机构:国家海洋环境监测中心更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家海洋局近岸海域生态环境重点实验室开放基金辽宁省科学技术计划项目更多>>
- 相关领域:生物学农业科学环境科学与工程自动化与计算机技术更多>>
- 一种海洋浮游动物通用宏条形码扩增引物
- 本发明提供一种海洋浮游动物通用宏条形码扩增引物,属于分子生物学技术领域,包括正向引物组和反向引物组,正向引物组由以下引物中的一条或多条组成:引物F1,引物F2,引物F3,引物F4,引物F5,引物F6,引物F7、引物F8,...
- 李宏俊孙艺王孝程李冬梅王睿睿叶金清李飞刘玉安明红霞苏洁
- 辽河口邻近海域小型底栖生物的空间分布及季节变化被引量:4
- 2017年
- 本文研究了辽河口邻近海域2013年8月、10月和2014年5月3个航次小型底栖生物的种类及其空间分布,分析了小型底栖生物丰度和生物量的季节变化。结果表明,3个航次(夏季、秋季和春季)小型底栖生物的平均丰度分别为(264±83)ind/(10cm^2)、(216±85)ind/(10cm^2)和(227±67)ind/(10cm^2),平均生物量分别为(272±125)μg/(10cm^2)、(207±89)μg/(10cm^2)和(244±103)μg/(10cm^2)。与其他研究海域相比,辽河口小型底栖的丰度和生物量处于较低水平。共鉴定出了14个小型生物类群,按照丰度排序,线虫是最优势的类群,夏季、秋季和春季3个航次占总丰度的比例分别为94.0%、92.5%和90.8%;其他优势类群为多毛类、桡足类和双壳类。小型底栖生物量的优势类群则为多毛类(41.1%~44.0%),高于线虫(33.8%~36.5%),其次是双壳类(2.6%~6.7%)。水平分布的研究表明,调查海域近岸入海口小型底栖生物的丰度和生物量普遍低于近海海域,但是秋季时近岸分布与近海差距不大。垂直分布的研究表明,95.9%的小型底栖生物分布于0~5cm的表层沉积物中。小型底栖生物的丰度和生物量在夏季时都达到高峰值。与环境因子的相关分析表明,小型底栖生物的数量分布与盐度和水深呈极显著正相关(P<0.01),与叶绿素a呈显著正相关(P<0.05)。
- 叶晟孔飞李宏俊李宏俊刘敏邵魁双李洪波邵魁双
- 关键词:小型底栖生物群落结构丰度生物量环境变量
- 海洋生物单核苷酸多态性基因分型技术的研究进展被引量:1
- 2012年
- 单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)是一类广泛分布于基因组中由单个碱基差异引起的DNA序列变异,SNP标记是第三代分子标记的代表。随着大规模测序技术的快速发展,大量的候选SNP位点被发现,候选SNP位点的发掘需要合适的分型技术。从等位基因分型机制、反应方式和检测等位基因方法等方面介绍当前海洋生物SNP分型技术的研究进展,以期为不同试验目的的研究选择合适的SNP分型技术提供参考。
- 李宏俊高小玉裴爱君
- 关键词:单核苷酸多态性SNP基因分型海洋生物分子遗传学
- 基于宏条形码技术的海洋浮游动物多样性的评价方法
- 本发明提供一种基于宏条形码技术的海洋浮游动物多样性的评价方法,属于海洋生物多样性研究领域,包括样品宏基因组的DNA提取,PCR扩增18S rDNA的V4高变区片段以构建文库,高通量测序,生信分析,其中文库构建所用PCR引...
- 王睿睿孙艺邵魁双王孝程林勇李冬梅张金勇李飞李宏俊
- 文献传递
- 中国海洋生物多样性保护进展被引量:2
- 2019年
- 一、中国海洋生物多样性现状(一)生态系统多样性中国海域包括渤海、黄海、东海、南海和台湾以东部分海域,呈北东-南西向的弧形,环绕着大陆,具有丰富的海洋和海岸生态系,拥有4个大海洋生态系统,即黄海、东海、南海和黑潮生态系统。
- 李宏俊
- 关键词:海洋生物多样性海洋生态系统
- 大亚湾大型底栖动物群落特征与生态质量评价研究
- 2023年
- 开展近岸海域大型底栖动物多样性调查和生态质量评价对于指导海洋生态环境保护修复具有重要意义。本研究以广东省大亚湾为研究区域,于2022年8月进行大型底栖动物和环境因子调查,利用生物指数AMBI和M-AMBI对大亚湾底栖动物群落健康状况和生态质量状况进行评价。本研究共采集到大型底栖动物69种,环节动物为优势类群,主要优势种为多鳃齿吻沙蚕(Nephtys polybranchia)、细丝鳃虫(Cirratulus filiformis)和奇异稚齿虫(Paraprionospio pinnata),与历史资料对比研究表明,近40年来,大亚湾大型底栖动物物种组成已经发生显著变化。典范对应分析表明,亚硝酸-氮(NO2-N)和硝酸-氮(NO3-N)是影响大型底栖动物群落丰度的主要环境因子,表明含氮营养盐已经对大亚湾大型底栖动物群落产生负面影响。生物指数评价结果表明,大亚湾底栖生境处于“未扰动”或“轻度扰动”状态,生态质量处于“好”或“一般”状态。
- 高鑫李勇王长发王立俊张维悦李宏俊
- 关键词:大型底栖动物多样性群落结构生态质量
- 口虾蛄高血糖激素基因全长cDNA的克隆及表达分析被引量:1
- 2016年
- 本文首次采用RACE技术获得口虾蛄(Oratosquilla oratoria)眼柄部高血糖激素(crustacean hyperglycemic hormone,CHH)基因cDNA全长序列,共2 421bp,5′UTR长度为180bp,3′UTR为1 821bp,开放阅读框(ORF)长420bp,编码139个氨基酸。预测蛋白二级结构α-螺旋23.74%,延伸链占23.02%,无规则卷曲占53.24%,预测分子量为15.47kD,等电点(pI)为7.049。CHH成熟肽包含6个CHH家族中位置保守的Cys残基,C端为GK,推断为ES型CHH基因。聚类分析表明:口虾蛄CHH和十足目CHH聚为同一个分支的两亚群,具有较近的亲缘关系。荧光定量PCR分析结果表明,CHH基因在肠中表达量最高,在眼柄、触角中有较高的表达量,在肌肉中表达量相对较低,在卵巢中表达最低,而在精巢中不表达。
- 刘海映张秀芹隋宥珍李宏俊邢坤姜玉声杨贵福陈雷张娜
- 关键词:口虾蛄分子克隆荧光定量PCR
- 文蛤C型凝集素基因(Mm-Lec1)的克隆与表达分析被引量:4
- 2016年
- 文蛤(Meretrix meretrix)是我国重要的滩涂养殖贝类,病害严重影响文蛤增养殖业,研究文蛤的免疫机制有助于解决文蛤的病害问题。C型凝集素(C-type lectin)参与先天免疫,在识别病原相关分子模式和激活体液免疫因子等方面发挥重要作用。本研究检索已构建的文蛤全长cDNA文库,经过Blast比对得到了文蛤C型凝集素1(Mm-Lec1)基因的全长cDNA序列。Mm-Lec1序列全长586bp,5和3非翻译区(UTR)的长度分别为21bp和79bp,开放阅读框长度为486bp,编码161个氨基酸,分子量为18.65kD,理论等电点为4.98。预测的氨基酸序列中含有信号肽(Met1-Ser19)、糖识别结构域(CRD)和糖结合位点(QPN)。Mm-Lec1的三级结构是紧凑型,含有β片层结构。同源性分析结果表明,Mm-Lec1与其他物种C型凝集素相似度在20%~32%;邻接法(Neighbor-Joining,NJ)进化树分析结果表明,Mm-Lec1与紫贻贝CTL 6和栉孔扇贝CTL A聚为一支。实时荧光定量分析结果显示,Mm-Lec1在文蛤鳃、肝胰腺、闭壳肌、外套膜、性腺和血细胞中均表达,其中鳃表达量最高,血细胞次之,性腺中表达量最少;在鳗弧菌(Vibrio anguillarum)刺激实验中,6h时Mm-Lec1在血细胞中的表达量最低,48h表达量最高,暗示Mm-Lec1参与文蛤抵御细菌入侵的免疫过程。
- 张晶晶李宏俊秦艳杰刘敏叶晟
- 关键词:文蛤C型凝集素表达序列标签实时荧光定量PCR
- 北黄海秋、冬季浮游动物多样性及年间变化被引量:24
- 2012年
- 2009年秋、冬季在北黄海全海域121°30'—124°00'E、37°30'—40°00'N范围开展了浮游动物多样性监测及年间变化研究,探讨浮游动物多样性对海流及全球变化的指示。共鉴定出浮游动物8大类28种(不含6大类浮游幼虫和鱼卵仔鱼),类群组成以暖温性近岸种和广温广盐种为主,兼有少量冷温性和暖水性外海种。聚类分析将浮游动物群落划分为:北黄海高盐水团群落、北黄海混合水团群落、北黄海沿岸低盐水团群落。2009年秋、冬季在北黄海均监测到暖水种小齿海樽和肥胖箭虫,前者形成秋季浮游动物优势种,但1959年调查显示它们向北分布不能抵达北黄海,这些暖水种的向北扩布可能预示着黄海暖流的增强。2009年秋、冬季北黄海主要暖温种中华哲水蚤和强壮箭虫丰度也较1959年同期有所升高。研究表明全球变化影响下温带海域北黄海浮游动物暖水种种类增加、分布北移,暖温种丰度升高,这与亚热带海域东海浮游动物对气候变暖的响应模式不同,能够为浮游动物对全球变暖的区域响应机制研究提供参考资料。
- 杨青王真良樊景凤邵魁双李宏俊
- 关键词:浮游动物物种多样性全球变化北黄海
- 文蛤C1q基因的克隆与表达及其重组蛋白活性的研究被引量:6
- 2012年
- 利用构建的文蛤cDNA文库,克隆得到了文蛤C1q基因全长cDNA序列,该序列全长1213bp,5′UTR为316bp,3′UTR为372bp,开放阅读框长度为525bp,编码174个氨基酸。在文蛤C1q(MmC1q)蛋白中,C1q结构域与软体动物、两栖类动物和脊椎动物中的C1q结构域均具有较高的同源性。通过荧光实时定量PCR,MmC1q mRNA在所检测的各个组织中均有表达,在肝胰脏中表达量最高。在细菌感染试验中,文蛤受鳗弧菌感染后,C1q相对表达水平有明显的上升调节,注射2h,MmC1qmRNA表达量最高,为对照组的2.19倍。包含成熟肽的MmC1q cDNA片段被重组,并在大肠杆菌BL21(DE3)中表达,采用牛津杯法对MmC1q重组蛋白进行体外抑菌试验,但并未检测到明显的抑菌活性。
- 隋立军刘卫东李云峰高祥刚李宏俊赫崇波
- 关键词:荧光定量PCR重组蛋白