曹翠辉
- 作品数:5 被引量:1H指数:1
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- 系统性红斑狼疮患者外周血单个核细胞超保守区域转录表达水平分析
- 2014年
- 目的:探讨超保守区域转录因子与系统性红斑狼疮的相关性。方法:采用T-UCR芯片技术分析了15名系统性红斑狼疮患者和15名健康人群的外周血单个核细胞的超保守区域转录表达水平。结果:比较系统性红斑狼疮组与健康对照组,发现8个T-UCRs(uc.285+,uc.234+,uc.102+,uc.341+,uc.267+,uc.221-,uc.290-and uc.90+)表达水平上调,29个T-UCRs表达水平下调,在表达上调和下调的T-UCRs中,对应的超保守区域uc.186-表达水平最显著(P=3.29,FC=-38.648 61),其相关基因为HNRNPH1。结论:通过GO分析后,发现uc.186-可能是系统性红斑狼疮潜在的诊断和预后的生物标志物,HNRNPH1可能是系统性红斑狼疮潜在的关键基因。
- 邱劲军眭维国曹翠辉何慧燕张扬戴勇
- 关键词:单个核细胞生物标志物
- 尿毒症患者外周血单个核细胞超保守区域转录表达水平的分析
- 2014年
- 目的 尿毒症是由于肾衰竭致使代谢产物和其他有毒物质在体内蓄积而引起的一种自身中毒综合征,超保守区域转录子(transcribed ultra-conserved regions,T-UCRs)是lncRNA重要组成部分,转录自人类基因组中481个极度保守区域,希望分析尿毒症外周血单个核细胞的超保守区域转录表达水平,从而发现尿毒症潜在的诊断和预后的生物标志物.方法 本研究采用T-UCRs芯片技术分析了15例尿毒症患者和15例健康对照组的外周血单个核细胞的超保守区域转录表达水平,并且用实时荧光定量PCR技术验证了尿毒症患者与健康对照组表达差异最显著的基因的表达水平.结果 对比尿毒症患者与健康对照组,通过芯片筛选出T UCRs发现21个T-UCRs表达水平上调,49个T-UCRs表达水平下调,在表达上调和下调的T-UCRs中,对应的超保守区域uc.458-表达水平最显著(P-2.47524E-24;FC=3118.5361),其相关基因为RBFOX2.结论 通过GO分析以及验证后发现uc.458-可能是尿毒症潜在的生物标志物,RBFOX2可能是尿毒症潜在的关键基因.
- 眭维国曹翠辉车文体陈洁晶薛雯戴勇
- 关键词:尿毒症基因生物标志物
- ChIP-seq比较分析人体心脏和脾脏的H3K9三甲基化差异
- 2014年
- 目的分析人体器官心脏和脾脏的H3K9me3的全基因图谱,以期发现H3K9三甲基化的修饰与组织特异性的表达、功能和发育具有相关性。方法通过染色质免疫共沉淀的方法获取各标本DNA,通过q PCR验证ChIP结果,然后构建ChIP Sequencing文库,与目的基因组序列比对,获取比对Reads,接着进行全基因组的Peak分析,GO功能富集分析peak相关基因的生物学功能。结果心脏和脾脏间有169个基因有显著地H3K9me3差异,其中心脏中H3K9me3的基因中有64个特殊基因,脾脏中H3K9me3的基因中有87个特殊基因。从这些基因中,挑选出8个表现H3K9me3明显的基因,然后再从这8个基因中挑选出两个心脏和脾脏间表现H3K9me3差异最明显的基因,分别是PTPN3和RBMS。结论 H3K9me3差异可作为一个潜在的生物标志物或是表观遗传疾病的治疗靶点。
- 薛雯曹翠辉眭维国车文体陈洁晶郭丽戴勇
- 关键词:CHIP-SEQ表观遗传学
- 蛋白质芯片技术及其在全基因组翻译后修饰分析中的应用被引量:1
- 2013年
- 蛋白质芯片技术可用于研究蛋白质-DNA、蛋白质-配基和蛋白质与蛋白质之间的相互作用,是当前生物科学研究中的重要内容。近年来,运用蛋白质芯片技术对全基因组进行生物化学分析的应用取得令人瞩目的成就。现着重总结蛋白质芯片技术及其在全基因组翻译后修饰分析中的应用。
- 眭维国王惠曹翠辉薛雯陈洁晶邹贵勉戴勇
- 关键词:蛋白质芯片全基因组翻译后修饰
- 尿毒症患者外周血单个核细胞超保守区域转录表达水平
- 目的 尿毒症(Uremia)是由于肾功能衰竭致使代谢产物和其他有毒物质在体内蓄积而起的一种自身中毒综合症,外周血单个核细胞保守区域(T-UCR)是lncRNA 重要组成部分,转录自人类基因组中481 个极度保守区域,希望...
- 眭维国曹翠辉车文体欧明林陈洁晶薛雯刘平郭丽谭秋培孙玉峰崔甄甄戴勇