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姜春芽

作品数:7 被引量:55H指数:5
供职机构:江西农业大学农学院更多>>
发文基金:国家自然科学基金更多>>
相关领域:农业科学生物学更多>>

文献类型

  • 6篇期刊文章
  • 1篇会议论文

领域

  • 6篇农业科学
  • 1篇生物学

主题

  • 5篇猕猴桃
  • 3篇猕猴
  • 3篇SSR
  • 3篇EST
  • 3篇EST序列
  • 2篇序列标签
  • 2篇植物
  • 2篇中华猕猴桃
  • 2篇SSR标记
  • 2篇EST-SS...
  • 2篇表达序列标签
  • 1篇野生果树
  • 1篇野生猕猴
  • 1篇营养成分分析
  • 1篇栽培
  • 1篇桃果
  • 1篇桃果实
  • 1篇桃属
  • 1篇桃属植物
  • 1篇人工栽培

机构

  • 7篇江西农业大学
  • 1篇中国科学院

作者

  • 7篇廖娇
  • 7篇徐小彪
  • 7篇姜春芽
  • 4篇辜青青
  • 4篇陈金印
  • 4篇刘善军
  • 2篇李晶
  • 2篇倪志华
  • 1篇姚小洪
  • 1篇曲雪艳

传媒

  • 1篇果树学报
  • 1篇中国南方果树
  • 1篇园艺学报
  • 1篇中国农学通报
  • 1篇分子植物育种
  • 1篇Agricu...

年份

  • 2篇2010
  • 4篇2009
  • 1篇2008
7 条 记 录,以下是 1-7
排序方式:
江西几种野生猕猴桃果实主要营养成分分析被引量:6
2008年
徐小彪王义林姜春芽廖娇姚小洪
关键词:营养成分分析野生猕猴猕猴桃属植物桃果实野生果树人工栽培
植物EST-SSR技术及其应用被引量:23
2009年
EST是指从EST cDNA文库中随机挑取克隆进行单轮自动测序所获得的短的、常常是未加编译的cDNA序列。目前,大约有200种植物共超过1500多万条的EST的序列,研究表明对EST进行大规模研究已成为功能基因组学研究的最佳途经之一。分析和比较EST序列就可以得到关于基因的表达、功能及进化信息,利用大量的EST序列已经成为发现新基因及了解植物新陈代谢一种简便有效的方法。通过介绍基于植物表达序列标签(EST)的微卫星(SSR)标记的研究现状,并对一些植物中利用EST-SSR标记在遗传图谱构建、遗传多样性、通用性等方面的应用进行了综合评述。同时也提出利用EST存在的一些不足及发展趋势。
姜春芽廖娇徐小彪辜青青刘善军陈金印
关键词:EST-SSR
与中华猕猴桃矮型性状连锁的一个共显性标记
有效筛选与中华猕猴桃矮型性状连锁的EST-SSR标记,不仅可以用于分子标记辅助选择育种,而且可为中华猕猴桃矮型基因的定位及克隆奠定基础。以中华猕猴桃(Actinidia chinensis Planch.)矮型种质‘赣猕...
徐小彪姜春芽辜青青廖娇刘善军曲雪艳陈金印
关键词:中华猕猴桃EST-SSR标记
文献传递
猕猴桃EST序列的SSR信息分析被引量:11
2009年
【研究目的】通过筛查猕猴桃EST数据库中的SSR重复序列,可为开发出新型的猕猴桃EST-SSR标记和分子生物学研究奠定理论基础;【方法】从NCBI公共数据库中最新公布的猕猴桃表达序列标签(Expressed Sequence Tag,EST)中随机抽取56400条序列,应用SSRHunter软件查找微卫星(Microsatellite,SSR)重复序列;【结果】研究结果表明,从猕猴桃EST序列中获得了7939条SSR,其中包括二核苷酸重复5131条(64.63%),三核苷酸重复1237条(15.58%),四核苷酸重复284条(3.58%),五核苷酸重复397条(5.00%),六核苷酸重复890条(11.21%)。在二核苷酸重复序列中,AG/CT共分布4654条(90.70%)。大约每2.48kb长度的单一基因序列中即存在1个SSR,即平均7个单一基因中存在1个SSR;【结论】在猕猴桃EST序列中,二核苷酸重复序列是最丰富的重复单元,其次为三核苷酸重复和六核苷酸重复。在所获得的SSR重复单元中,AG/CT为优势重复。
姜春芽徐小彪廖娇倪志华李晶
关键词:猕猴桃表达序列标签微卫星
Analysis on SSR Information of EST Resources of Kiwifruit(Actinidia ssp.)
2009年
Objctive The aim was to make better use of the EST-SSR resources of kiwifruit for further molecular biological studies and new EST-SSR marker development by screening and mining the SSR repeats in the EST database of kiwifruit (Actinidia spp. ) [ Method] 56 400 of EST sequences were randomly selected from EST( Expressed Sequence Tag)sequences of kiwifruit in the database of NCBI. EST sequences were analyzed and the SSR(Microsatellite) was screened by using the SSRHunter software. [ Result] 7 939 SSRs were identified from the ran- domly selected kiwifruit EST resources, among which there were 5 131 (64.63%) dinucleotide, 1 237 ( 15.58% ) trinucleotide, 284 ( 3.58% ) tetra nucleotide, 397 (5.00%) pentanucleotide and 890 ( 11.21% ) hexanucleotide SSRs. Among the dinucleotide sequences, AG/CT repeat motif was accounted for 4 654(90.70% ). The frequency of SSRs was approximately 1/2.48 kb, which could exist to 1 SSR in 7 unigenes. [ Conclusion] The dinucleotide repeats appeared to be the most abundant SSRs, followed by the trinucleotide and hexanucleotide repeats. Among them the repeat motif such as AG/CT was predominant in each type of SSRs.
姜春芽徐小彪廖娇倪志华李晶
关键词:KIWIFRUITESTSSR
中华猕猴桃矮型性状EST-SSR连锁标记的筛选被引量:9
2010年
以中华猕猴桃(Actinidia chinensis Planch)矮型种质‘赣猕5号’为母本,普通型中华猕猴桃‘奉雄2号’为父本构建F1群体,采用优越而高效的基于表达序列标签(Expressed Sequence Tags,EST)的简单序列重复(Simple Sequence Repeats,SSR)标记技术,结合群体分离分析法(Bulked Segregant Analysis,BSA)在荧光DNA测序仪(ABI3130)上进行了‘赣猕5号’矮型性状连锁的EST-SSR分子标记研究。结果表明,通过本实验室开发并设计的85对EST-SSR荧光引物的扩增筛选,其中引物EST-Ad042在亲本及其矮型与普通型DNA池之间扩增出一条285bp的多态性片段,经对其F1代分离群体部分矮型与普通型单株的随机验证,该片段稳定出现,在矮型植株中表现为有带,在普通型植株中表现为无带。遗传连锁分析表明,该标记与矮型基因之间的连锁距离为8.8cM。EST-SSR荧光引物能够有效地筛选到中华猕猴桃的特异标记,可以作为鉴别矮型与普通型植株的标记引物。
徐小彪姜春芽廖娇辜青青刘善军陈金印
关键词:猕猴桃EST序列SSR标记
基于EST的猕猴桃SSR标记的建立被引量:8
2010年
利用NCBI公共数据库最新公布的猕猴桃EST(Expressed Sequence Tag)序列,开发猕猴桃的SSR(Simple Se-quence Repeats)标记。对来源于猕猴桃(Actinidia spp.)非冗余EST数据库(NCBI dbEST)的56400条基因序列使用SSRHunter1.3软件进行了SSR筛查,从中共获得了7939条SSR。应用Primer5.0软件设计合成了85对猕猴桃EST-SSR引物,从中筛选出可进行荧光标记的6对引物:Ad01、Ad02、Ad03、Ad09、Ad42、Ad72。利用该6对EST-SSR荧光标记引物在DNA测序仪上对猕猴桃种质的多态性进行了PCR检测,结果表明均能清晰地产生多态性分离。研究结果表明,通过猕猴桃EST数据库的发掘能够有效地筛选到基因水平的SSR标记。
姜春芽徐小彪廖娇辜青青刘善军陈金印
关键词:猕猴桃EST序列SSR标记
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