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中枢神经系统血管母细胞瘤的蛋白质组学研究: 蛋白质组学作为当今生命科学热点与前沿,近年来得到了蓬勃的发展。蛋白质组学技术具有分析多基因事件引起的多蛋白质组分整体变化的独特优势,其研究更接近生命现象的本质,目前已被广泛用于研究各种疾病的发生、发展规律,并取得了重大成...; 刘杭; 关键词：中枢神经系统血管母细胞瘤蛋白质组学后颅窝肿瘤发病机制

中枢神经系统血管母细胞瘤细胞与人脑神经元细胞差异蛋白质分析被引量：2: 2009年; 以人工培养的中枢神经系统血管母细胞瘤(Central nervous system hem angioblastoma,HB)细胞为研究对象,发展了蛋白质组学分析方法,鉴定了HB细胞与人脑神经元细胞的差异蛋白质。采用在线HPLC串联LTQ-Orbitrap质谱鉴定样品的可溶性蛋白质,得到了HB细胞的蛋白质组表达谱。HB细胞鉴定得到674个蛋白质,神经元细胞鉴定获得531个蛋白质。根据基于肽段鉴定的蛋白质组半定量分析方法对质谱数据进行蛋白质的差异比较分析,发现了波形蛋白(Vimentin),14-3-3epsilon蛋白和碳酸酐酶Ⅱ(Carbonic anhydraseⅡ,CAⅡ)等在HB细胞中表达量发生明显变化的蛋白质,并对其进行了免疫组织化学染色分析。结果显示,波形蛋白(Vimentin)、14-3-3epsilon蛋白以及碳酸酐酶Ⅱ(CAⅡ)等蛋白质表达量的改变与HB的发病密切相关,对探索HB的起源有重要意义。; 刘杭谢嵘姚鋆樊惠芝朱剑虹杨芃原; 关键词：中枢神经系统血管母细胞瘤蛋白质组学高效液相色谱-质谱半定量分析

糖蛋白质组学的信息学资源和方法被引量：2: 2016年; 糖基化修饰是生物体内最常见、最重要的蛋白质翻译后修饰之一.哺乳动物体内超过50%的蛋白质都会发生糖基化修饰.糖蛋白广泛分布于各种组织的细胞膜表面,执行着重要的生物学功能.随着高通量、高灵敏度和高分辨率的蛋白质组学时代的来临,许多基于串级质谱技术解析糖链结构的生物数据库和分析软件也亦应运而生.本文综述了目前文献中最常用的糖类生物信息学资源,包括各种糖蛋白的数据库以及质谱解析糖类的相关工具和新技术、新方法.; 刘杭姚鋆杨芃原张扬; 关键词：质谱数据库

中枢神经系统血管母细胞瘤的蛋白质组学分析被引量：2: 2006年; 背景与目的:中枢神经系统血管母细胞(centralnervoussystemhemangioblastoma,CNSHB)的治疗较难,至今病因不明。本研究应用蛋白质组学方法分析HB与正常脑组织的蛋白质表达谱的差异,分离鉴定与HB发病的蛋白质,为研究HB的组织学起源与发病机制提供依据。方法:收集5例血管母细胞瘤与5例正常脑组织标本。提取标本的总蛋白质。通过双向凝胶电泳(2-DE)分离蛋白,确定血管母细胞瘤与正常脑组织的差异表达蛋白质点。应用基质辅助激光解离-飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)鉴定并对鉴定蛋白质进行生物信息学分析。结果:通过双向凝胶电泳,建立了约含600个蛋白质点的血管母细胞瘤及正常脑组织的高分辨率蛋白质表达图谱。两者相比具有较高的同源性。应用ImageMaster2D图像分析软件共发现115个差异蛋白质点。经MALDI-TOF-MS分析后成功鉴定了87个蛋白质点共计47种蛋白质。其中HB组较正常对照组表达上调46个蛋白质点,下调41个蛋白质点。鉴定蛋白质的功能涉及转运、蛋白质折叠与代谢、三羧酸循环、细胞分化、干细胞相关蛋白质等数个方面。对鉴定所得蛋白质Vimentin、14-3-3蛋白进行免疫组化染色可重复本研究的结果。结论:中枢神经系统血管母细胞瘤可能是一种起源于间叶脑组织的肿瘤。其发生是一个多因子参与、多步骤的复杂过程。多种蛋白质如Vimentin及14-3-3蛋白参与了血管母细胞瘤的发病并起到重要的作用。; 谢嵘朱剑虹刘杭樊惠芝吴惺姚鋆陈露萍沈亦雯杨芃原; 关键词：血管母细胞瘤蛋白质组学分析双向凝胶电泳

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刘杭

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