刘东祥
- 作品数:6 被引量:8H指数:1
- 供职机构:华东理工大学药学院更多>>
- 相关领域:医药卫生生物学理学更多>>
- 化学库及分子差异性设计研究进展被引量:6
- 1998年
- 组合化学是近年来发展起来的一种快速合成和平行筛选群体化合物的新方法。它可以用来设计先导化合物,也可以对药物分子进行结构改造。本文主要综述了化学库的合成以及计算机辅助组合化学的研究进展。
- 刘东祥蒋华良陈凯先嵇汝运
- 关键词:组合化学计算机药物设计
- Establishment of kappa opioid receptor agonists pharmacophore with molecular modeling method被引量:1
- 1998年
- 目的:建立非肽类κ阿片受体激动剂的药效基团.方法:从MDLMDDR数据库中选出五个高活性非肽类κ阿片受体激动剂,以四氢吡咯环N原子和乙酰胺基团为叠加点,用分子模构法建立非肽类κ阿片受体激动剂的药效基团.结果:四氢吡咯环、乙酰胺的羰基和与乙酰胺相连的疏水基团为非肽类κ阿片受体激动剂共同结构特征.推测受体Asp138与四氢吡咯环的N原子构成氢键,Ser187可能与激动剂的乙酰胺羰基以氢键形式相作用.与乙酰胺相连接的疏水性基团可能与受体有疏水作用.
- 刘东祥蒋华良陈凯先嵇汝运
- 关键词:分子力学
- SIRT1与乙酰化底物、NAD^+或烟酰胺的相互作用
- 2013年
- 沉默信息调节因子2相关酶1(SIRT1)是一类腺嘌呤二核苷酸(NAD+)依赖性去乙酰化酶。烟酰胺是SIRT1催化的去乙酰化反应的产物,也是SIRT1的一种非竞争性抑制剂。利用蛋白同源模建和分子对接方法构建了"SIRT1/NAD+/p53乙酰化多肽"和"SIRT1/ADPR(二磷酸腺苷核糖)/烟酰胺"的两种复合物结构模型。根据"SIRT1/NAD+/p53乙酰化多肽"的复合物模型,发现SIRT1的265位丝氨酸(S265)和346位天冬酰胺(N346)与NAD+有相互作用,275位丝氨酸(S275)位于NAD+结合口袋的入口处。通过酶动力学实验证明:将S265、N346和S275突变之后会降低甚至消除NAD+与SIRT1的相互作用。另外,根据"SIRT1/ADPR/烟酰胺"的复合物模型,烟酰胺的酰胺基团与347位异亮氨酸(I347)、348位天冬氨酸(D348)形成了氢键,同时其嘧啶环埋在由262位丙氨酸(A262)、270位异亮氨酸(I270)、273位苯丙氨酸(F273)、316位异亮氨酸(I316)和347位异亮氨酸(I347)所包围的疏水环境中。将I316突变成丙氨酸,提高了酶与烟酰胺的结合能力,也显著提高了烟酰胺的抑制活性,这一现象表明烟酰胺结合在SIRT1的C口袋处。
- 秦禹韬肖文冯钰刘东祥唐赟
- 关键词:SIRT1烟酰胺
- Molecular modeling on kappa opioid receptor and its interaction with nonpeptide kappa opioid agonists
- 1999年
- 目的:研究κ阿片受体及其与非肽类激动剂的作用机制.方法:以细菌视紫红质为模板,模建κ阿片受体七个跨膜区的三维结构;将五个高活性非肽类激动剂对接到螺旋区内,研究作用机制.结果:(1)四氢吡咯环氮原子与Asp138羧基成氢键;(2)乙酰胺羰基氧与受体Ser187间存在氢键作用;(3)与乙酰胺相连的疏水基团处于由Val239、Val236、Phe235、Val232、Leu186和Trp183构成的疏水区域内;(4)激动剂的四氢吡咯环为Ile290、Asp138、Ile194、Ile135和Cys131残基包围.结论:模型将有助于设计新型高效安全的κ阿片受体激动剂.
- 刘东祥蒋华良沈敬山朱维良赵磊陈凯先嵇汝运
- 关键词:分子模型Κ阿片受体配位体
- 阿尔茨海默氏症致病蛋白-Aβ_((12-28))肽段的NMR研究
- 2009年
- Aβ肽的多聚化和纤维化在阿尔茨海默氏症(Alzhei mer's diseas)的发生中起关键作用,其中以Aβ(1-42)的致病作用为最强,因此阻断其聚集成为阿尔茨海默氏症一种潜在的治疗方式.作者在研究中发现某些化合物可以结合于Aβ(12-28)肽段.该文采用1H-1HCOSY、TOC-SY、ROESY和15N-HSQC多种核磁分析方法,对此肽段的1H和15N NMR谱信号进行了归属和详细分析,为进一步研究其与小分子抑制剂的相互作用提供了基础.
- 施燕红姜春懿徐松林刘东祥宋国强
- 非肽类阿片Kappa受体激动剂的研究现状被引量:1
- 1998年
- 对非肽类阿片kappa受体激动剂的研究现状进行了概述。并对其构效关系、类型、作用机制及临床研究近况进行了介绍。提出:深入研究kappa受体及其激动剂将有助于设计新的。
- 沈敬山刘东祥蒋华良嵇汝运
- 关键词:阿片受体KAPPA受体激动剂镇痛剂