丰继华
- 作品数:35 被引量:17H指数:2
- 供职机构:云南民族大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金云南省应用基础研究基金云南省教育厅科学研究基金更多>>
- 相关领域:生物学电子电信自动化与计算机技术文化科学更多>>
- ISW2缺失下基因功能对核小体定位影响的研究
- 2015年
- 为研究染色质重塑因子对核小体定位的影响以及ISW2缺失情况下基因功能对核小体形成的作用,本文分别对ISW2敲除、野生型(WT)及富营养培养条件下(YPD)三种酵母核小体占位率数据进行聚类、比较、分析后发现,在ISW2缺失情况下核小体的位置远离TSS,同时发现11种基因功能对核小体的定位产生了显著影响。
- 胡焕丰继华魏恨恨周晓雯李泽华
- 关键词:核小体定位野生型
- RFID物流供应链标签识别理论和方法研究
- 吴海锋曾玉高飞丰继华
- 该成果完成的主要研究内容为:在物流供应链中定义无源RFID运动标签集合,面向运动标签集合实现识别系统的非随机多址接入;采用训练序列对多标签识别进行设计以避免标签数估计;在捕获效应中,采用训练序列的嵌入式二进制树策略对被捕...
- 关键词:
- 关键词:物流供应链
- 基于希尔伯特-黄变换的核小体定位特征提取
- 2019年
- 核小体是染色体折叠的整体结构,它们的空间分布与基因组活动的调节密切相关,是基因工程和表观遗传的重要研究领域。为进一步研究核小体定位特征的物种间差异性,将希尔伯特-黄变换(HHT)引入到酵母和果蝇两个不同物种的定位信号中,从多个角度客观分析核小体定位信号特征在两个物种间的差异性。在此基础上,对酵母和果蝇核小体分布的周期特征和进化印记进行尺度和频域分析,结果表明酵母和果蝇染色体在组织结构上存在显著差异。本文研究思路为准确提取信号瞬时频率提供了前提条件。
- 刘珂丰继华黄月月郭亚茹牟锦
- 关键词:核小体
- 基于SCD文件聚类分析自动生成接线图的方法被引量:1
- 2022年
- 智能变电站配置描述(SCD)文件通常缺少对电气接线拓扑关系的配置,且信息十分抽象,无法直观可视地查看主接线图,给工作人员理解造成困难。提出了一种采用图团体聚类算法自动生成接线图的方法,通过分析SCD文件中所有智能电子设备(IED)之间的连接关系,设置连接权重,通过图聚类算法得到按间隔划分的IED配置分组,解决了已有的主接线自动生成方法不能在配置描述信息命名不规范情况下使用的问题。最后,通过软件对实际SCD文件进行分析,验证了所提方法的准确性和有效性。
- 范力栋丰继华王星宇
- 关键词:智能电子设备接线图自动生成
- 不同转录率下真核模式生物核小体位置研究
- 2016年
- 真核生物中核小体的位置在不同转录率基因上是不同的.我们通过对热冲击前后酵母核小体位置实验数据、酵母转录率数据进行统计分析和比较后,发现在压力环境下,敏感上表达基因中的高转录水平基因与敏感下表达基因中低转录水平基因上的核小体位置趋于平衡位置,而非敏感基因中的高转录基因通常处于趋向远离平衡位置状态.
- 魏恨恨丰继华胡焕周晓雯李泽华
- 关键词:热冲击转录水平
- 基于绝缘密度HiCID算法的染色质接触域边界检测被引量:1
- 2021年
- 针对现有基于Hi-C数据的接触域边界检测算法进行改进,提出用绝缘密度统计量来表征接触域边界强度变化的绝缘密度算法(Hi-C insulation density,HiCID)。HiCID算法将网络增强技术嵌入预处理过程对原始Hi-C数据进行降噪,根据绝缘子结合蛋白(CTCF)与组蛋白修饰的富集丰度确定域边界筛选阈值,同时为不同分辨率Hi-C数据优化选择滑动窗口的大小和数量。实验结果表明,提出的接触域边界检测算法在一致性和准确性上均优于HiCDB算法,具有不依赖于特定物种的可移植性特点,且算法随Hi-C数据分辨率提高表现出更好的性能。
- 黄月月丰继华刘珂范力栋
- 关键词:定向分化
- 一种在移动场景下基于认知无线电网络的模仿主用户攻击方案
- 本发明涉及认知无线电频谱检测、网络安全以及无线通信技术领域,公开了一种在移动场景下基于认知无线电网络的模仿主用户攻击策略,包括了1)机理假设、2)提出PUEA攻击方案、3)验证提出的PUEA的攻击效果、4)调整参数四个步...
- 陈跃斌刘开元金云霞丰继华赵明玺陈建培施鸿珍
- 文献传递
- 基于染色体三维结构共调控域基因功的分析
- 2020年
- 真核生物的染色质在细胞核中高度折叠且有序排列,这种三维结构对基因的转录、调控和表达等细胞进程具有重要的生物学意义。本研究基于酵母染色体三维结构模型,用3σ准则筛选高分辨率Hi-C(highthroughput chromosome conformation capture,Hi-C)数据,对潜在的共调控区域进行搜索定位,并用简单的统计学方法分析了核小体占位率、组蛋白修饰、蛋白质置换水平、基因富集等影响因子在共调控区域TSS附近的分布特征,进而对共调控域基因功能与染色体结构之间的关系进行研究。结果发现,以上影响因子在28个共调控区域中具有相似的分布特征和基因功能信息。由此推测,这些"共性"基因可能协同参与了基因调控,并驱动形成了染色体特定空间折叠结构。
- 黄月月丰继华刘珂牟锦郭亚茹
- 关键词:基因功能
- 基于距离转换参数优化的HiC数据增强分析
- 2021年
- 高通量染色质构象捕获(HiC)技术可反映染色体各位点之间的接触情况,为研究染色体三维空间结构和基因共调控机制提供依据。但目前受到测序技术和实验成本的制约,生物实验通常只能获得大量中低分辨率HiC数据,造成染色质远距离接触信息的缺失,为此,本研究将最短路径原理应用于增强低分辨率的HiC数据。首先将染色体接触数据转换为距离矩阵,利用Floyd算法对其进行最短路径更新后,再将其逆变换为增强的HiC数据,从而实现对远距离接触信息的恢复。在距离转换过程中,以Spearman相关系数作为评估指标,利用自适应权值粒子群算法(APSO)对转换参数进行全局寻优。本研究对人类不同组织细胞(人B淋巴细胞系(GM12878),人胚肺成纤维细胞系(IMR90)和人类白血病细胞系(K562)) HiC数据进行了增强,结果表明该算法能够对不同下采样的HiC数据显著增强。本研究的研究思路可为HiC数据增强提供有益借鉴。
- 刘珂丰继华黄月月范力栋
- 关键词:FLOYD算法自适应粒子群算法
- 基于Hi-C数据的染色体三维分析计算方法
- 2020年
- 真核生物的染色质在细胞核中高度折叠且有序排列,这种三维结构对基因转录和DNA复制等细胞功能发挥至关重要。近年来Hi-C数据的涌现,使得研究染色质三维交互作用及其空间结构成为了可能。自2009年Hi-C被开发以来,已经出现了许多用于处理Hi-C数据的生物信息学工具,从原始序列比对到接触矩阵的可视化,均提供了系统的Hi-C数据处理过程或解决某一个特定问题的方法。本研究全面介绍了传统的Hi-C数据处理工作流程,以及近十年来新兴的Hi-C数据处理工具以及其未来发展方向。
- 黄月月丰继华刘珂牟锦郭亚茹