魏子涵
- 作品数：6 被引量：7H指数：2
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- 基于核糖体18SrDNA和28SrDNA基因序列的天牛部分种类系统发育研究
- 随着线粒体DNA(motochondrial DNA,mtDNA)结构与遗传特性的研究工作迅速展开,至80年代末90年代初,人们对mtDNA的研究较对同等长度的核基因研究更为深入,mtDNA分析方法迅速渗入传统的分类、系...
- 魏子涵安世恒尹新明
- 文献传递
- 基于核糖体18SrDNA和28SrDNA基因序列的天牛部分种类系统发育研究
- 2012年
- 随着线粒体DNA(motochondrial DNA,mtDNA)结构与遗传特性的研究工作迅速展开,至80年代末90年代初,人们对mtDNA的研究较对同等长度的核基因研究更为深入,mt DNA分析方法迅速渗入传统的分类、系统进化、群体遗传及人类学等研究领域,并逐步取代了以往以分析蛋白质特性为基础的同工酶和免疫学实验方法,成为目前这些学科重要的研究工具(牛屹东等,2001)。分子系统发育采用的数据通常是DNA序列,mtDNA序列是目前研究昆虫系统发育、种群遗传变异和分化,以及难以用外部形态特征来区别的近缘种、种下分类单元鉴定等中应用最为广泛的遗传物质之一。
- 魏子涵安世恒尹新明
- 关键词：基因
- 天牛核糖体基因18S rDNA和28S rDNA的分子特征研究
- 天牛科高阶元的研究主要以形态学，古地理古生物学为主，然而不同学者对天牛高阶元的研究仍存在一定的争议。目前为止关于天牛科高阶元的分子系统学研究报道较少，因此本研究以核糖体18S rDNA和28S rDNA作为分子标记，利用...
- 魏子涵
- 关键词：天牛科进化关系核糖体DNA
- 文献传递
- 利用分子标记18S rDNA对天牛高阶元进化关系的研究被引量：4
- 2014年
- 【目的】构建天牛总科高阶元的进化关系,为解决天牛各亚科之间进化关系和归属提供依据。【方法】本研究采用18S rDNA(V4、V7区)分子标记,分析和测定了49种天牛基因序列,并结合GenBank数据库中3科2亚科21种天牛的18S rDNA基因序列,采用邻近法(Neighbor Jointing,NJ)、贝叶斯推论法(Bayesian Inference,BI)和最大似然法(Maximum Likelihood),对天牛总科3科6亚科的70种天牛基因序列构建进化树,探讨天牛高阶元类群的进化关系。【结果】研究表明:序列分析比对后得到序列为703 bp,碱基A、T、C、G的含量分别为21.1%、26.3%、23.6%和28.9%;变异位点(Variable sites)98个占全部位点的13.9%,简约信息位点(Parsimony informative sites)45个占全部位点的6.4%;转换(Transition)/颠换(Transversion)的平均值R值为2.79,转换大于颠换。进化树结果显示沟胫天牛亚科Lamiinae、天牛亚科Cerambycinae、锯天牛亚科Prioninae和瘦天牛科Disteniidae为单系性进化群,这与传统形态学分类结果相似。【结论】本研究成功构建了天牛总科高阶元的系统发育树,研究证明18S rDNA(V4、V7区)是探讨天牛高级阶元分类有效的分子标记。
- 魏子涵尹新明安世恒李京张鸿飞
- 关键词：天牛RDNA分子标记进化关系
- 基于核糖体DNA联合序列的天牛总科高阶元分子系统学研究被引量：2
- 2014年
- 【目的】利用核糖体DNA联合序列探讨天牛总科高阶元分子系统发育。【方法】本研究采用分子标记技术,分析测定了63种天牛核糖体28S rDNA D2和D3区以及18S rDNA V4和V7区的DNA序列,并采用邻接法、最大似然法和贝叶斯推论法分别构建了天牛总科2科6亚科63种的分子进化系统。【结果】序列联合比对分析,最终得到1 404 bp的联合数据组,其中可变位点446个(32.0%),保守位点958(68.0%),转换/颠换的平均值(R值)为1.73。28S rDNA和18S rDNA以及联合序列的饱和度分析显示碱基突变未达到饱和,说明这些序列适合于分子进化树的构建。利用不同系统发育重建方法得到进化树具有相似拓扑结构,结果支持沟胫天牛亚科、花天牛亚科和天牛亚科为单系群,这与形态学分类结果相似;狭胸天牛独立成为亚科得到了支持。【结论】利用28S rDNA D2和D3区以及18S rDNA V4和V7区联合序列成功构建出了天牛总科高阶元的系统发育树。研究表明联合序列分析是探讨天牛高阶元分类的有效的方法。
- 魏子涵尹新明安世恒苏丽娟李京张鸿飞
- 关键词：天牛总科核糖体DNARDNA分子系统发育
- 沟胫天牛亚科部分种类线粒体COⅡ基因特征及其系统发育研究被引量：2
- 2013年
- 为了丰富沟胫天牛亚科线粒体COⅡ序列数据库及探讨沟胫天牛亚科各类群的系统发育关系，通过PCR技术扩增了16种（亚种）天牛的COⅡ序列，利用Mega5．05软件分析比较了这些序列与GenBank中登录的28条沟胫天牛亚科COⅡ序列组成特点，以天牛亚科为外群，采用邻近法、最大似然法和贝叶斯法构建系统进化树．序列组成结果表明，在得到的626个位点中，有361个位点发生变异，占序列全长的57．7％，并在COⅡ密码子第3位点达到最高95．4％；序列中A＋T的含量为71．7％，具有明显的偏向性，密码子第3住点最高（88．7％）；支持光肩星天牛和黄斑星天牛为同物异名，COⅡ序列一致性可以在93．2％～98．9％之间变动．系统进化树结果表明，长角天牛族、污天牛族、多节天牛族和骇天牛族分化较早，是沟胫天牛亚科中较原始的类群；楔天牛族为单系群，其中的小筒天牛属分化最早，其次是筒天牛属和瘤筒天牛属，竖毛天牛属、双脊天牛属和并脊天牛属比较进化；骇天牛族是多节天牛族的姊妹群，且进化地位高于多节天牛族；坡天牛族和瓜天牛族互为姊妹群，长角天牛族与蓑天牛族、棒角天牛族聚在一起；沟胫天牛族和白条天牛族、粉天牛族亲缘关系较近．
- 李京安世恒张鸿飞魏子涵尹新明
- 关键词：沟胫天牛亚科天牛科系统发育
