殷华平
- 作品数：53 被引量：123H指数：6
- 供职机构：韶关学院更多>>
- 发文基金：长江学者和创新团队发展计划四川省应用基础研究计划项目广东省高等学校自然科学研究重点项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学医药卫生机械工程更多>>
- 伪狂犬病病毒基因组密码子用法特点分析被引量：6
- 2007年
- 本文根据GenBank收录的伪狂犬病病毒基因组序列,应用CHIPS、CUSP和CodonW在线程序,分别计算了伪狂犬病病毒基因组序列中各编码序列的有效密码子数目(ENc)、编码同一氨基酸的不同密码子的使用频率(Fract)和GC含量及GC3S含量。研究结果证实伪狂犬病病毒对一些密码子的使用存在明显的偏爱性,且主要偏爱于使用以G和C结尾的密码子;GC含量及GC3S含量分析表明,伪狂犬病的编码序列GC含量偏高,平均高达74.9%,特别是密码子的第三位碱基GC含量平均高达93.7%,分析认为GC3S含量可能是促使PRV密码子偏向性形成的原因之一。
- 杨丽郭万柱殷华平徐志文陈蕾
- 关键词：伪狂犬病病毒同义密码子生物信息学
- ORF3基因缺失对猪圆环病毒Ⅱ型感染复制能力的影响被引量：10
- 2008年
- 设计1对特异性引物AF-P1/AF-P2,从疑似PCV2感染的病料中扩增获得1 767 bp的PCV2全基因组(命名为PCV2-CD),克隆至pMD18-T Simple载体构建重组质粒pTS-PCV2-CD。序列分析表明:PCV2-CD与GenBank中公布的12个PCV2毒株间的同源性高达95.0%~100%。用NcoⅠ酶切pTS-PCV2-CD获得4 459 bp线性目的DNA片段,补平CATG 4个碱基、连接环化构建ORF3基因插入缺失重组质粒pTS-PCV2-CD-C并测序。用SacⅡ酶切pTS-PCV2-CD-C,回收1 771 bp线性目的片段,体外连接环化构建了ORF3基因缺失突变毒株mPCV2-C。PCR-RFLP检测表明,在脂质体转染法转染mPCV2-C、培养并盲传4代的IBRS-2细胞中(PCV1阴性),特异性检测到mPCV2-C的DNA;电镜观察发现,在盲传6代的IBRS-2细胞胞核内观察到突变毒株的病毒颗粒。试验结果表明:ORF3基因缺失突变毒株mPCV2-C具有感染性,能够在IBRS-2细胞中复制增殖,证实ORF3基因不是PCV2复制的必需基因。
- 杨晓农郭万柱徐志文王新殷华平王小玉龙虎
- 关键词：ORF3基因基因功能
- 猪呼肠孤病毒SC-A株的分离鉴定及σ2基因的克隆与序列分析被引量：3
- 2008年
- 通过在病毒培养液中添加胰酶的方法,从仔猪腹泻粪样中分离并鉴定了1株能在Vero细胞上稳定产生CPE,并以细胞颗粒增多、肿胀、漂落为特征的猪呼肠孤病毒SC-A株。在感染细胞中,病毒胞浆包涵体及特征性微管样结构明显,病毒粒子多呈典型的晶格状排列,大小约70 nm。S2基因的克隆测序结果表明,SC-A S2全基因(DQ396805)大小为1 331 bp,其开放阅读框编码一个由418个氨基酸组成,相对分子量约为47 140的σ2蛋白;与标准株T1L、T2J、T3D的核苷酸序列和推导氨基酸序列的同源性分别为86.9%、76.7%、85.4%及94.6%、93.3%、98.3%。以σ2氨基酸序列构建的进化树分析显示,标准株及野外分离株可被划分为A(T3)、B(T2)、C(T1)3个群;除T3C31外,其余3型野外分离株及SC-A株和所有血清1型均位于C群中。
- 曾智勇郭万柱徐志文梁海英宋振辉殷华平王新王小玉
- 关键词：呼肠孤病毒
- 一起雏鹅发生大肠杆菌病的诊治
- 2008年
- 大肠杆菌病是由致病性大肠埃希氏杆菌的某些血清型所引起的传染病的总称，是目前危害养禽业健康发展的重要细菌性传染病之一。家禽中大肠杆菌的感染很常见，不同品种不同日龄的鸡、鸭、鹅等均有感染。因不同血清型的致病性大肠杆菌对药物的敏感性也不同，造成治疗收效不好，所以给养禽业造成一定经济损失。2007年5月9日，本镇某养殖户饲养的23日龄的雏鹅发生一种以拉稀、
- 黄健强殷华平娄高明翁文飞冯顺胜
- 关键词：大肠杆菌病雏鹅致病性大肠杆菌细菌性传染病大肠埃希氏杆菌诊治
- 仔猪腹泻粪样中猪呼肠孤病毒的分离鉴定
- 通过在病毒培养液中添加胰酶的方法,首次从仔猪腹泻粪样中分离并鉴定了一株能在 Vero 细胞上稳定产生 CPE,即以细胞颗粒增多、肿胀、漂落为特征的猪
- 曾智勇郭万柱徐志文宋振辉殷华平王新王小玉
- 文献传递
- 猪传染性胃肠炎病毒SC-Y株编码复制酶聚蛋白ORF1的克隆及结构特征分析被引量：1
- 2007年
- 应用RT-PCR方法扩增了猪传染性胃肠炎病毒SC-Y株编码复制酶聚蛋白的ORF1序列,将其进行克隆、序列测定和分析。确认SC-Y株ORF1全长20 053 nt(GenBank收录号DQ390461)。该序列包含2个ORF,其中ORF1a由12 053个核苷酸构成,可编码由4 018个氨基酸组成的多肽,ORF1b由8 036个核苷酸构成,可编码由2 678个氨基酸组成的多肽。对SC-Y与TGEV参考毒株及不同冠状病毒对应区进行序列比较,结果显示,SC-Y株与PUR46-MAD株的同源性最高,ORF1a的核苷酸同源性为99.5%,推导氨基酸同源性为99.2%,ORF1b的核苷酸及推导氨基酸同源性均为99.8%;不同冠状病毒之间ORF1b比ORF1a具有更高的保守性。
- 宋振辉郭万柱殷华平曾智勇朱玲骆爱芳张鹦俊
- 关键词：猪传染性胃肠炎病毒
- 猪传染性胃肠炎病毒全基因组克隆与序列分析
- 猪传染性胃肠炎是由猪传染性胃肠炎病毒引起的一种急性、高度接触性传染病,以呕吐、水样腹泻、脱水和对2周龄以内仔猪高度致死率为特征,病毒基因组为单股正链RNA,具有感染性。全长约28.5kb,包括8个功能基因,可编码4个结构...
- 宋振辉郭万柱殷华平骆爱芳韩国权朱玲王小玉
- 关键词：猪传染性胃肠炎病毒全基因组基因克隆
- 文献传递
- PCR检测猪输血传播病毒Ⅱ型方法的建立及其应用
- 根据GenBank中登录的猪源输血传播病毒Ⅱ型(Swine TorqueTeno Virus genogroup Ⅱ，TTV Ⅱ)基因序列，设计并合成了一对特异性引物，建立了检测猪TTV Ⅱ型的PCR方法。将PCR扩增产...
- 娄高明冯顺胜殷华平黄健强
- 关键词：TTV感染PCR检测流行病学分析
- 文献传递
- PCR检测猪输血传播病毒Ⅰ型方法的建立及其初步应用
- 参照GenBank已公布的猪源输血传播病毒Ⅰ型(Swine Torque Teno Virus genogroupⅠ,TTVⅠ)全基因序列,设计并合成一对特异性引物,建立了快速、特异检测猪TTVⅠ型的PCR方法.用所建立...
- 娄高明殷华平冯顺胜黄健强
- 关键词：PCR
- 文献传递
- 猪圆环病毒Ⅱ型四川株的全基因克隆及序列分析
- 本试验通过从可疑病料中直接提取DNA为模板,参照Genbank中参考序列设计一对特异性引物,一次反应扩增获得长约1800bp的目的片段,克隆入pMD18-T获得阳性重组质粒,经酶切鉴定和序列测定结果表明该质粒含有长176...
- 朱玲郭万柱徐志文王新殷华平王小玉
- 文献传递
