杨帆 作品数:80 被引量:59 H指数:5 供职机构: 大连工业大学生物工程学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 辽宁省自然科学基金 大连市科技计划项目 更多>> 相关领域: 生物学 轻工技术与工程 化学工程 文化科学 更多>>
基于差异基因表达谱的Microbacterium sp.XT11降解黄原胶潜能挖掘 2023年 为挖掘微杆菌(Microbacterium sp.)XT11在黄原胶降解过程中起关键作用的功能基因,预测黄原胶降解通路,利用转录组测序技术对该菌株在不同碳源培养条件下的转录本进行测序,对差异基因进行功能富集分析。结果表明,菌株XT11以葡萄糖为对照组,以黄原胶为碳源时可获得上调差异基因213个。显著上调的基因主要富集在聚糖降解、淀粉和蔗糖代谢途径、ABC转运、苯丙氨酸代谢、丙酮酸代谢五个KEGG途径。碳水化合物活性酶(Carbohydrate-active enzymes,CAZymes)功能注释表明,位于同一基因簇上的4个CAZymes基因和黄原胶降解直接相关,其余的CAZymes基因具有潜在的黄原胶降解活性。此外,预测到磷酸转移酶系统(phosphotransferase system,PTS)和ABC转运途径(ABC transporters)参与了胞外黄原胶降解中间产物的跨膜转运。挖掘了菌株XT11中黄原胶降解过程中的功能基因,并阐述了菌株XT11的黄原胶降解通路。 袁悦 王雪妍 李宪臻 杨帆关键词:转录组 差异表达基因 一类具有双荧光发射特性的聚集诱导发光化合物及其应用 本发明公开了一类具有双荧光发射特性的聚集诱导发光化合物及其制备方法与应用,所述的比例荧光探针具有通式Ⅰ的结构。该探针分子由极性响应基团四苯乙烯为荧光报告单元,引入具有亲水性的氧原子,再连接乙酰胺的α碳并在乙酰胺的氨基上连... 李苗 周金龙 蒋添曦 孔浩 李宪臻 杨帆纤维素外切酶CelC7的异源表达及降解黄原胶性能 2023年 为开发新型黄原胶外切酶、获得聚合度高度集中的黄原胶活性寡糖,对来自牛瘤胃真菌的纤维素酶CelC7的编码基因进行全基因合成,并在大肠杆菌中进行异源表达。该基因大小为1032 bp,编码344个氨基酸残基,表达蛋白产物理论分子质量为40 ku,属于糖苷水解酶GH7家族。该酶在大肠杆菌中高效可溶性表达,经过Ni-NTA亲和层析纯化后,可得到纯度达90%的纯酶。酶学性质分析结果表明,该酶最适反应温度为50℃,最适pH为6.0。CelC7能够有效地对黄原胶主链进行特异性切割,将其水解为低分子质量寡糖。亚铁离子螯合活性实验结果显示,该低分子质量寡糖对亚铁离子螯合活性的半清除活性IC50为3.60 mg/mL,表明成功制备黄原胶活性寡糖。 高媛 郝淼闻 李宪臻 杨帆PBL+CL在分子生物学实验课内涵式发展中的应用 2022年 分子生物学实验课对于提高工科院校生物工程专业本科生的动手实践能力和分析解决问题能力,实现从理论学习过渡到开展科学研究和生产实践具有非常重要的作用。通过提升课程内涵,能够有效提高教学质量。本工作探索了有利于实现分子生物学实验课内涵式发展的教学策略,通过将基于问题的学习(problem based learning,PBL)与协作学习(collaborative learning,CL)相结合,构建出通过团队协作来解决复杂问题的教学模式,有效激发了学生的学习热情、提高了学生的创新思维和解决复杂问题的能力。 王从纲 杨帆 李宪臻关键词:分子生物学实验 内涵式发展 提高微生物油脂生产能力的研究进展 被引量:12 2013年 微生物油脂是生物柴油生产领域具有广阔前景的新油脂资源。然而,利用产油微生物进行油脂的工业化生产仍存在限氮条件下油脂生产强度不够高、对廉价高氮生物质原料的利用效率低等瓶颈问题。随着近年来发酵工程、生物信息学及分子生物学技术的发展,国内外研究者利用不同策略优化微生物油脂的生产条件,并对其油脂积累代谢途径进行改造,旨在获得适用于工业化生产的产油性能优良的油脂菌。本综述总结了国内外利用生化工程、基因工程以及新兴的转录因子工程策略提高产油微生物油脂生产强度和扩大产油微生物廉价底物利用范围方面的研究进展,并展望了基于组学研究、模块途径工程以及反向代谢工程的综合策略在理性改造产油微生物以提高其油脂发酵性能中的应用。 郭小宇 杨兰 李宪臻 杨帆关键词:微生物油脂 生化工程 基因工程 基于产出导向的分子生物学实验教学改革实践 2021年 分子生物学实验是工科院校生物工程专业本科教学中的重要专业基础课,其内容具有较强的前沿性和创新性。当前分子生物学实验教学中存在的主要问题包括:教学内容陈旧、教学手段不丰富、考核方式未能有效考察学生学习全过程的效果和能力的提高水平,上述问题不利于培养和提高学生分析和解决复杂问题的能力。基于产出导向的教育理念是当前教育改革的主流理念,鉴于此,本工作探索了有利于践行该理念的教学模式,以学生的预期成果为导向进行课程内容的反向设计,通过改革教学内容、教学方法、考核方式以提高学生分析解决复杂问题的能力。 王从纲 杨帆 李宪臻关键词:分子生物学实验 教学改革 一种黄原胶寡糖的制备方法 本发明公开了一种黄原胶寡糖的制备方法,属于生物技术领域。本发明包括如下步骤:(1)配制黄原胶终浓度为1%的黄原胶‑酸溶液;(2)将离子液体加入到步骤(1)所得黄原胶溶液中,搅拌至黄原胶溶解,所得溶液中离子液体的终浓度为1... 杨帆 刘韪铭 李宪臻文献传递 一种预测纤维素结晶度的方法 本发明公开了一种预测纤维素结晶度的方法,该预测方法通过构建碳水化合物结合单元—荧光蛋白探针,可以与各种预处理的纤维素进行结合,通过荧光检测,即可对纤维素的结晶度进行预测。本发明方法只需通过荧光检测即可对纤维素的结晶度进行... 杨帆 郭小宇 李宪臻一种助听桌 本实用新型涉及家具领域,具体说是一种助听桌。包括桌面和桌腿;所述桌面侧面设有至少两个声音采集器,所述声音采集器左右两侧设有扩音器;靠近每个所述声音采集器的桌面上设有指向按键;所述声音采集器分别与指向按键及与该指向按键对应... 杨帆 任文东一株降解石油级黄原胶的菌株的分离纯化及性质研究 黄原胶是由野油菜黄单胞菌所产生的微生物胞外多糖,由于其独特的流变和剪切性能,已被广泛应用于石油开采工业中,可大大提高采油率.但黄原胶的存在同时也会增加原油的粘度,影响后续的运输及应用,因此需将其彻底降解.本工作主要研究黄... 陈晓艺 杨帆 吴秋燕 李宪臻关键词:黄原胶 石油工业 细菌分类 文献传递