孙志忠
- 作品数：45 被引量：87H指数：5
- 供职机构：湖南杂交水稻研究中心更多>>
- 发文基金：湖南省自然科学基金国家自然科学基金湖南省农业科学院科技创新项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学医药卫生更多>>
- 一种杂交水稻育种方法
- 本发明提供一种杂交水稻育种方法，包括以下步骤：1)将保持系T98B经过<Sup>60</Sup>Co-γ射线处理，获得光温敏不育系T98S；2)以T98S作为母本，以非野败恢复系R作为父本配制增产3％以上的杂交组合，筛选...
- 谭炎宁袁定阳段美娟袁隆平邓华凤杨震许可何强孙志忠余东孙学武袁光杰袁贵龙
- 文献传递
- 差异显示法克隆与小麦低温诱导相关的磷脂酰乙醇胺结合蛋白基因被引量：1
- 2013年
- 本研究利用差异显示技术检测经低温处理的小麦品种"石新828"及对照材料中的mRNA,获得2条差异片段序列。经Blast比对后,发现其中一条长为293bp的差异片段序列与小麦的一个冷调蛋白基因的mRNA(GenBank:AB097412.1)同源性为99%。该基因编码的蛋白属于磷脂酰乙醇胺结合蛋白家族,命名为wpebp。经荧光定量PCR分析,wpebp基因的表达量随低温处理时间的增长总体呈上升趋势,表明该基因与小麦的抗寒能力相关。
- 刘瑞芬余东孙学武谭炎宁孙志忠袁贵龙段美娟袁定阳
- 关键词：小麦
- 水稻转录因子NF-YB家族的生物信息学分析被引量：3
- 2018年
- 转录因子NF-YB (nuclear factor-YB)家族是核因子Y (nuclear factor Y, NF-Y)家族的一个亚家族,在调控胚发育、形态建成、开花时间、株高、穗粒数等方面,尤其是在非生物胁迫应答中发挥着重要的作用。为揭示水稻NF-YB基因家族的信息及特征,加快基因家族功能挖掘进程,本研究利用生物信息学手段对该基因家族及其编码蛋白进行分析。结果表明,水稻中共有13个NF-YB基因,在染色体上分布不均匀,所编码的蛋白都定位在细胞核,且不含跨膜结构域或信号肽。多重序列比对,二级结构,三级结构以及基序分析表明,该家族成员保守性较高,均含有高度保守的CBF/NF-Y结构域。进化分析表明NF-YB家族基因的分化早于物种的分化。磷酸化位点和互作蛋白网络分析初步预测了家族成员的互作蛋白网络。本研究为后期NF-YB家族成员的功能研究,加快家族基因的实际应用进程提供了帮助。
- 周天顺余东孙志忠孙志忠谭炎宁孙学武谭炎宁盛夏冰
- 关键词：水稻转录因子生物信息学
- 利用CRISPR/Cas9基因组编辑技术定向降低水稻落粒性被引量：5
- 2018年
- 【目的】易落粒既不利于稻谷收获,也不适宜于水稻机械化生产。利用现阶段前沿的分子育种手段——CRISPR/Cas9技术对水稻落粒性主效基因qSH1进行定点编辑,并调查分析易落粒性状的改良效果,为创制稳产和适合机械化生产的水稻新种质奠定材料基础和探索新途径。【方法】以qSH1为靶标基因,根据CRISPR/Cas9技术原理设计靶标位点。将所设计的靶点序列在水稻参考基因组中比对分析以排除非特异性靶位点,最终筛选出qSH1-T1和qSH1-T5靶标位点。化学合成靶位点寡核苷酸序列,退火后分别与pYLg RNA-U3、pYLg RNA-U6a载体连接构建U3-qSH1T5-g RNA、U6a-qSH1T1-g RNA表达盒,最后将2个g RNA表达盒同时连接至pYLCRISPR/Cas9表达载体中,构建pYLCRISPR/Cas9-qSH1-T51表达载体。利用农杆菌介导转化易落粒的籼稻品种HR1128,以潮霉素抗性为筛选标记筛选获得T0代转基因阳性植株。利用靶位点扩增测序法判断T0代转基因植株在预期靶标位点是否发生突变,并进一步分析突变类型及基因型。将靶点序列在水稻参考基因组中比对,选择与靶点序列匹配度大于或等于15 bp且3′端具有NGG的位点作为潜在脱靶位点进行脱靶效应评估。利用潮霉素基因及靶点检测进一步筛选无T-DNA成分的qsh1突变植株并进一步构建qsh1突变系,并分析qsh1突变系的落粒性、qSH1的表达量及预测编码氨基酸序列。【结果】pYLCRISPR/Cas9-qSH1-T51载体成功地实现了对qSH1靶标位点的定点编辑。在T0代转基因阳性植株中获得7个突变单株,其中qSH1-T1和qSH1-T5靶点的突变频率分别为54.55%和63.64%,突变基因型包括纯合突变、杂合突变、双等位突变和嵌合突变,突变类型包括碱基插入、碱基缺失及碱基突变。通过对T1代植株进行潮霉素基因筛选、靶位点扩增测序,结果表明,在T1代植株中Cas9载体骨架和qSH1突变位点都发生了分离,获得2种不含T-DNA成分的qsh1纯�
- 盛夏冰谭炎宁孙志忠孙志忠汪雪峰余东袁定阳袁贵龙
- 关键词：水稻落粒性
- 盐胁迫对杂交稻隆两优华占及其亲本种子萌发和幼苗生长的影响被引量：6
- 2021年
- 以杂交稻组合隆两优华占及其2个亲本隆科638S和华占为试验材料,萌发期设置6个NaCl质量分数梯度(0.2%、0.4%、0.6%、0.8%、1.0%和1.2%)和苗期设置3个NaCl质量分数梯度(0.4%、0.8%和1.2%)来模拟盐胁迫试验,以清水为对照,分析盐胁迫对杂交稻及其亲本种子萌发和幼苗生长的影响。结果表明,在各质量分数的盐胁迫处理下,萌发期各项指标均不同程度地受到盐胁迫影响,多数指标值均随盐质量分数升高而下降,且质量分数0.6%是隆两优华占及其亲本的耐盐临界值。在0.2%~0.6%NaCl胁迫下3个品种发芽率、发芽指数、活力指数、胚芽长的盐胁迫抑制率在品种间存在显著差异,进一步通过隶属函数值综合评价,得出3个品种萌发期耐盐性由强到弱分别为隆两优华占、华占和隆科638S;苗期盐胁迫下3个品种中隆两优华占地上部分K^+/Na^+比值最大,表明其耐盐性最强。综合萌发期隶属函数值和苗期K^+/Na^+比值可以得出,杂交组合隆两优华占与其亲本比较,耐盐性更强,说明水稻的耐盐性具有一定的杂种优势。
- 汪雪峰盛夏冰谭炎宁孙志忠余东袁定阳段美娟
- 关键词：盐胁迫耐盐性种子萌发杂种优势
- 一种杂交水稻生产方法
- 本发明提供一种杂交水稻生产方法，选用温敏不育系T98S作为制作母本，选择T优组合的父本R作为制种父本；在T98S处于不育状态下对R进行高温制种；所述T98S是从三系保持系T98B辐射后代中获得的一个稳定遗传的温敏不育系，...
- 谭炎宁段美娟袁定阳杨震袁隆平邓华凤孙志忠余东孙学武何强郭国强彭锐刘瑞芬盛夏冰
- 文献传递
- 分子标记辅助改良培矮64S稻瘟病抗性被引量：8
- 2012年
- 为提高我国大面积应用的两系光温敏不育系培矮64S的稻瘟抗性,本研究通过杂交转育与分子标记选择相结合的途径,利用RM3330与RM262为标记,将Pi25与Pi-d(t)基因成功聚合于培矮64S中,经抗性、不育性、综合农艺性状评价,获得了5个基因型纯合且农艺性状稳定的F8代抗性改良候选不育系。抗性鉴定结果显示,抗性改良候选不育系及其抗性组合的叶瘟病情指数平均降幅为18.78%和23.24%,穗颈瘟病情指数平均降幅为18.58%和58.45%,抗性提高幅度极显著。育性观测结果表明抗性改良候选不育系不育度都在99.5%以上,柱头外露降低5.64%,包颈粒率降低8.55%。经济性状调查结果显示不育系除穗粒数下降、有效穗增加外,其余经济性状变化不明显;试配的杂交组合平均理论产量和实际产量比对照提高16.22%和6.89%,增产极显著。这些结果表明,通过Pi25与Pi-d(t)基因的导入显著提高了培矮64S稻瘟病抗性,获得了实用的光温敏不育系新材料。
- 袁定阳谭炎宁余东孙学武孙志忠段美娟
- 关键词：培矮64S稻瘟病分子标记辅助选择
- 一种水稻三交种的育种方法
- 本发明提供了一种水稻三交种的育种方法，属于水稻育种技术领域。本发明所述方法包括以下步骤：1)获得与第一籼稻品种A同基本遗传背景的tms5温敏不育系AS；2)以所述温敏不育系AS为母本，以第二籼稻品种B为父本进行杂交，得雄...
- 谭炎宁袁定阳段美娟李哲理孙学武孙志忠盛夏冰余东袁隆平
- 文献传递
- 水稻工程保持系的培育方法及其在水稻普通核不育系繁殖中的应用
- 本发明公开了一种水稻工程保持系的培育并将培育的工程保持系应用于水稻普通核不育系繁殖的方法，包括以下步骤：先采用图位克隆的方法定位并克隆水稻普通核不育系的不育基因s和不育系来源亲本的可育基因S；将颜色标记基因C与可育基因S...
- 袁定阳李新奇李莉段美娟余东邝翡婷宋书锋李娜谭炎宁孙志忠袁光杰袁贵龙符习勤赵炳然张大兵袁隆平
- 文献传递
- PRP蛋白及其编码基因和应用
- 本发明公开了一种PRP蛋白及其编码基因和应用，PRP蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示；编码基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。本发明的PRP蛋白可以提高植物C4光合循环速率、增加光合效率，通过导入所...
- 孙学武袁定阳段美娟余东谭炎宁欧阳宁孙志忠刘海袁贵龙陈劲彭锐
