刘薇薇
- 作品数:2 被引量:25H指数:1
- 供职机构:复旦大学附属华山医院更多>>
- 发文基金:上海市青年科技启明星计划更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- 蛋白质芯片技术筛选膀胱癌尿液标记物的研究被引量:25
- 2004年
- 目的 寻找膀胱癌尿液中新的肿瘤标记物。 方法 采用表面增强激光解吸 /离子化 飞行时间质谱 (SELDI TOF MS)技术 ,选用IMAC Cu 3蛋白质芯片对 6 1例膀胱癌及 95例对照组尿液标本进行检测以筛选膀胱癌患者尿液中差异表达蛋白质。 结果 两组尿液标本结果比较发现 ,膀胱癌差异表达明显的潜在标记物 4个 ,相对分子质量分别为 344 5、370 3、3896、5 932。其中 344 5蛋白质被鉴定为α defensin ,诊断膀胱癌的敏感性为 80 % ,特异性为 75 % ;370 3蛋白质诊断膀胱癌的敏感性为32 % ,特异性为 94 % ,阳性者中 97%为高级别浸润性膀胱癌 ;3896、5 932诊断敏感性分别为 78%、5 5 % ,特异性分别为 4 0 %、35 %。 结论 SELDI TOF MS蛋白质芯片技术是一种快速、简便易行、用量少和高通量分析方法 ,能直接筛选出膀胱癌患者尿液中相对特异的潜在标记物 ,具有较好的临床应用价值。
- 吴登龙张元芳关明刘薇薇徐月敏金三宝金重睿张炯吕元
- 关键词:蛋白质芯片技术膀胱癌肿瘤蛋白质组学
- 树形模型用于尿液蛋白质谱鉴别膀胱移行细胞癌
- 2007年
- 目的 探讨用表面增强激光解吸/离子化-飞行时间质谱(surface enhanced laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry,SELDI—TOF—MS)技术建立尿液树形蛋白质谱模型,鉴别膀胱移行细胞癌。方法膀胱肿瘤组61例,均为移行细胞癌;对照组95例,其中正常人53例,非膀胱癌其他泌尿系疾病患者42例。以上随机分为训练组118例,测试组38例。用IMAC-Cu-3芯片检测各尿液标本,并绘制蛋白质谱谱图。结果 将膀胱肿瘤组与对照组尿液标本结果相比较,用ProteinChip Software3.0软件筛选出差异表达蛋白质。Biomarker Pattern Software分类决策树软件对118例训练样本进行分析,并建立树形蛋白质谱模型。最终以3896m/z、4977m/z、9638m/z、15 103m/z和15 509m/z作为判断依据,分出6个最终节点;其筛选膀胱肿瘤的敏感度和特异度分别达到84.8%和91.7%。以38例测试组样本为盲法测试,敏感度和特异度分别达到93.3%和87.0%。结论 利用SELDI—TOF—MS蛋白质技术结合决策树生物信息学分析方法,建立了较为满意的鉴别膀胱癌的尿液树型蛋白质谱模型,为膀胱癌的无创诊断提供了一条新的途径和方法。
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- 关键词:膀胱肿瘤蛋白质组学