付绍印
- 作品数:48 被引量:155H指数:8
- 供职机构:内蒙古农牧业科学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金内蒙古自治区自然科学基金国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域:农业科学生物学医药卫生更多>>
- 内蒙古白绒山羊肉质特色基因的发掘和研究
- 张文广张燕军杜琛苏蕊吴江鸿孟丽云韩志玲孟宪然杨波王瑞军郑竹清付绍印赵德超李金泉
- 该项目把最先进的高通量测序技术用于检测羊肉的基因表达特征与蛋白质谱分析相结合,揭示肉质特性与化学组成的数量关系;通过对绵羊肉和山羊肉肉质特性的比较分析,筛选肉质特性关联基因并进行部分功能验证;利用生物信息学方法建立肉质特...
- 关键词:
- 关键词:白绒山羊基因表达分子育种
- 利用种子序列检测山羊组织或器官中microRNA靶基因的方法
- 本发明涉及一种利用种子序列检测山羊组织或器官中microRNA靶基因的分子方法。具体而言,提供了种子序列介导的可控遗传操作,用于在基因表达检测中筛选与特定microRNA相关的靶基因。在设定上游种子序列的互补序列和下游锚...
- 付绍印赵德超张文广李金泉
- 文献传递
- 蒙古羊不同尾椎数相关选择信号的挖掘研究被引量:3
- 2019年
- 通过对比不同尾椎数的蒙古绵羊群体在基因组上的遗传分化水平,对全基因组选择信号、蒙古羊尾长性状的相关基因及可能的突变位点进行检测,试图解析尾椎形成的分子机制。基于全基因组重测序数据,使用两组群间的遗传分化系数(Fst)和遗传多样性比率(pi ratio)检测尾椎选择信号,将Fst值和pi ratio较大的染色体区段作为受选择候选区域。结果表明,共找到76个选择区域,这些区域分别落在了尾脂肪沉积和骨骼发育的QTL上,进一步对这些候选区域所包含的63个基因进行基因功能及通路的注释分析,富集到骨骼再生相关的Wnt和FGF信号通路,同时发现LRP6等功能候选基因。该研究确定了与尾椎数相关的受选择区域,推测不同尾椎数蒙古绵羊群体的形成可能由非基因编码区域的一个或者多个突变造成。
- 达赖付绍印付绍印何小龙王标陈欣方勤圆张兴夫姜卓张文广张文广
- 关键词:蒙古羊脂肪
- 褪黑激素对绒山羊皮肤相关miRNA的影响
- 付绍印郑竹青阿娜张文广
- 关键词:褪黑素MIRNA皮肤
- 外源褪黑激素对罕山白绒山羊绒毛生长相关基因表达差异的影响
- 2019年
- 试验旨在筛选罕山白绒山羊皮肤毛囊生长脱落相关的关键基因,并揭示外源褪黑激素(Melatonin,MT)对罕山白绒山羊绒毛生长相关基因表达差异的影响。选择10只体重平均为33.3 kg、年龄为20月龄的罕山白绒山为实验动物,分为2组,从2014年12月开始每隔1个月按照2 mg/(kg·BW)的剂量在埋植组绒山羊耳后皮下埋植MT,于2015年9月采集2组罕山白绒山羊皮肤组织进行RNA-Seq测序,对差异表达基因进行筛选、功能注释和富集分析。共筛选获得了475个在埋植组与对照组中差异表达的基因,其中,上调表达基因392个,下调表达基因83个。KEGG富集性分析表明,差异表达基因主要参与白细胞经内皮迁移、趋化因子信号通路、fcγ-R介导的吞噬作用、吞噬体、造血细胞谱系、补体级联和混凝级联、细胞因子—细胞因子受体相互作用、NF-kappa B信号通路、PI3K-Akt信号通路等。PI3K-Akt信号通路可能在褪黑激素调控皮肤毛囊发育中发挥重要作用。研究结果为进一步研究MT影响皮肤毛囊生长的分子机理提供依据。
- 丽春李金泉张文广王思珍王国富高树新付绍印
- 关键词:褪黑激素罕山白绒山羊差异表达基因
- 绒山羊肌内脂肪细胞成熟前后比较转录组分析被引量:14
- 2014年
- 为了研究绒山羊肌内脂肪细胞在成熟前后差异表达的基因和主要信号转导通路,从而进一步筛选出与脂肪沉积相关的基因。本研究通过利用Illumina MiSeq对绒山羊肌内脂肪细胞在成熟前后转录组进行高通量测序,并用测序评估,基因功能注释,鉴定基因的可变剪接等生物信息学方法进行分析。组装后共获得93 930个contigs,N50为1 586nt,通过CLCGenomicsworkbench6软件找到差异基因78个(Fold Change>4,FDR<0.01)。这些差异基因基于GO功能注释可分为骨骼肌发育、胞外区、胰岛素样生长因子结合等46个分支,利用KEGG数据库作为参考,这些基因主要参与吞噬体、I型糖尿病、风湿性关节炎等通路中。本研究中分析绒山羊肌内脂肪细胞中4种主要可变剪接类型,为A3SS(Alternative 3′splice site)、A5SS(Alternative 5′splice site)、SE(Exon skipping)和RI((Intron retention),其中A3SS最为普遍。高通量RNA-seq提供了全部转录本信息,获得了在肌内脂肪细胞增殖分化过程中有重要功能的基因,其中上调基因在与胰岛素样生长因子结合和糖尿病的代谢通路中有着重要的作用,为人们进一步研究绒山羊脂肪沉积的功能基因组学及优化山羊肉品质奠定基础。
- 杜琛付绍印高鸿雁郑竹清孟宪然阿娜萨仁张文广李金泉
- 关键词:绒山羊可变剪接
- 不同产羔数绵羊性腺轴比较转录组研究被引量:12
- 2017年
- 试验通过对巴美肉羊性腺轴进行转录组分析,旨在挖掘影响多羔性状的关键功能基因。分别选取双羔组巴美肉羊5只、单羔组4只,利用转录组测序(RNA-Seq)技术对下丘脑、垂体、卵巢转录组文库进行测序,然后对得到的测序数据进行生物信息学分析。测序数据经过质量控制后,27个样品共得到112Gb的有效数据。差异基因分析表明,与单羔组相比,双羔组下丘脑中,上调表达基因111个,下调表达基因106个;垂体组织中,上调表达基因97个,下调表达基因142个;卵巢组织中,上调表达基因182个,下调表达基因67个。功能富集性分析表明,神经活性的配体-受体相互作用信号通路在下丘脑-垂体-卵巢性腺轴调控排卵及卵泡发育方面发挥着重要的调控作用。通过不同产羔数巴美肉羊性腺轴比较转录组研究,提供了全部的转录本信息,筛选了影响产羔数的相关功能基因,丰富和补充了绵羊基因组信息,为进一步阐明绵羊繁殖力差异的分子机制奠定基础。
- 付绍印何小龙王标李虎山储明星刘永斌张文广
- 关键词:性腺轴
- 等位基因特异性表达形成机制及其应用的研究进展
- 2019年
- 基因作为遗传信息的介质,决定了生物的性状表现。基因序列变异的发生是生物体适应环境变化的必然趋势。在二倍体生物中等位基因是一对控制着相对性状的基因,因此,等位基因特异性表达效应根据细胞类型和发育阶段的不同而变化,表现出不同个体之间的差异。等位基因差异表达对基因的表达起到重要的调控作用,并最终可能与生物的表型多态性联系起来。等位基因特异性表达分析已经在动物研究中得到广泛应用,有助于提高鉴定调控遗传变异的能力。对等位基因特异性表达的形成机制及其应用研究进展进行了综述,以期为进一步揭示等位基因特异性表达的遗传学机制,以及加快其在动物生产中的应用提供理论依据。
- 戴豪杨白雪王建蒙王建蒙付绍印刘永斌张文广
- 一种山羊无角间性(PIS)有害基因的检测方法
- 本发明属分子遗传及家畜育种领域,具体涉及一种山羊无角间性(PIS)有害基因的检测方法。本方法首先设计三对引物,分别用于扩增含有显性基因、隐性基因和近邻基因序列的DNA片段。再将上述三对引物分别在单管中进行PCR,获得相对...
- 杨波付绍印贾丽丽赵德超刘雪峰张文广李金泉
- 文献传递
- 母牛养殖技术要点被引量:4
- 2015年
- 以科尔沁肉牛为例,从犊牛培育前期、犊牛培育后期、育成牛前期、育成牛后期、妊娠前期、妊娠后期、分娩及产后护理、哺乳期8个时间段详述母牛养殖中的技术要点。
- 付绍印荣威恒达赖何小龙刘永斌李良臣郭煜
- 关键词:肉牛