陈建群 作品数:51 被引量:339 H指数:11 供职机构: 南京大学生命科学学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 “九五”国家科技攻关计划 国家科技部专项基金 更多>> 相关领域: 生物学 农业科学 医药卫生 文化科学 更多>>
花粉介导的转Bt基因棉花田间基因流监测 被引量:12 2007年 采用花粉粒染色法对转Bt基因棉的花粉漂移距离和强度进行了观测,并应用PCR法检测转Bt基因棉的基因流频率.花粉粒染色法监测结果表明:同株异花间的花粉散布频率显著高于异株异花间(P<0.01);靠近转Bt基因棉花粉染色区1m处的平均花粉散布频率,在东、南、西、北4个方向分别为44.8%、48.9%、57.1%和21.5%,但随着距转基因棉田距离的增大,4个方向的平均花粉散布频率都呈下降趋势.PCR结果的统计分析表明,在25m内,花粉散布距离和方向对基因流频率有极显著影响(P<0.01),随着距转基因棉田距离的增大,基因流频率呈下降趋势,最远距离为25m时的最高基因流频率为2.0%. 王长永 刘燕 周骏 陈建群 钦佩关键词:基因流 云南色球藻科新分类群 被引量:7 2001年 在对云南石林国家级风景区碳酸盐岩表面的气生蓝藻类进行研究时 ,发现色球藻科中的 1个新种和 3个新变种。其中石林肾胞藻是中国特有属———肾胞藻属中至今发现的第 2个种 ;3个变种均属于星球藻属。 田友萍 陈建群 张捷 李升峰 包浩生关键词:新分类群 棉蚜获毒后禁食对其保持并传播黄瓜花叶病毒的影响 被引量:15 2003年 采用棉蚜Aphisgossypii-甜瓜Cumumismelo -黄瓜花叶病毒 (cucumbermosaicvirus,CMV)体系 ,研究棉蚜获毒后在空气中禁食对其保持并传播黄瓜花叶病毒的影响。结果表明获毒后的禁食时间与棉蚜传毒效率呈负相关。运用EPG (electricalpenetrationgraph)及其即时显示、即时中断技术研究分析棉蚜禁食后的早期传毒行为细节。结果显示 :禁食处理没有显著影响电势落差 (potentialdrop ,pd)数目及穿刺过程中出现的第一个pd波形前穿刺时间这两个重要指标 ,但禁食处理能引起pd波的两个亚波形pdⅡ 1和pdⅡ 2持续时间的显著减短。进一步分析未禁食棉蚜传毒作用与pd亚波形的关系 ,显示传毒可能与pdⅡ 2的持续时间相关 (P =0 0 6 )。因此 ,pdⅡ 2的持续时间可能是与棉蚜传毒相关的一个行为指标。该研究还建立了新的高效而稳定的获毒方法——— 5pd获毒法 ,与传统的 5min获毒法相比 ,获毒效率显著提高。 王斌 陈建群 张鹏飞 马亮 王咏妙关键词:棉蚜 黄瓜花叶病毒 甜瓜 禁食 传毒 一种基于单核苷酸多态性标记的互花米草遗传分型方法 本发明涉及一种基于单核苷酸多态性标记的互花米草遗传分型方法,本方法根据高通量转录组测序筛选得到目标基因,通过PCR反应、PCR产物测序得到多个单核苷酸多态性位点。再由所有有效的单核苷酸多态性位点组成单倍体型用于分子标记以... 王强 许颖 陈建群 丁静 吴娟子水溞基因组P450基因家族的分析 被引量:2 2009年 利用水溞基因组mRNA和氨基酸数据库对P450基因进行搜索和分析,结果显示:在水溞基因组中发现71个P450基因,它们分别属于15个P450家族和17个亚家族,是一个典型的多基因家族。以氨基酸相似度大于60%为标准对水溞P450基因进行分组,则71个P450基因中,16个为孤儿基因,不能被归入任何一组;其余55个可归入12个组,其中8个组,包含47条序列适合于正选择和基因转换分析。结果表明:有3个组,含22个基因显著受到正选择压力作用,其中的2个组,含18个基因有正选择概率大于95%的氨基酸位点228E或277T,228E和277T分别位于底物识别位点SRS2和SRS5;有5个组,包含19个基因显示显著的基因转换事件;既显著受到正选择压力作用,又参与基因转换的基因共12个;相反,检测出既没有受到显著的正选择压力作用,又没有基因转换的基因18个。可见,发生基因转换的基因与受到显著正选择的基因有高度的相关性:发生过基因转换的基因中63.2%都受到显著的正选择压力作用,同时,受正选择压力作用的基因中有54.5%发生了基因转换。此外,鉴定出20个不同的基序,其中有5条基序在90%以上的基因中出现。 张云华 王强 张鹏飞 刘静 陈建群关键词:细胞色素P450 正选择 基因转换 基序 豌豆蚜基因组P450基因家族的分析 被引量:4 2010年 细胞色素P450在各种内源和外源物质代谢中起着非常重要的作用。利用豌豆蚜Acyrthosiphon pisum基因组mRNA和氨基酸数据库研究P450基因功能的进化规律。通过生物信息学方法对豌豆蚜全基因组P450进行分析,结果显示:在豌豆蚜基因组中发现69个P450基因,它们分别属于13个P450家族和18个亚家族,是一个典型的多基因家族。进一步将这些基因与豌豆蚜ESTs数据库进行了比对分析,其中39个候选基因有EST证据,证明了这些P450基因在转录水平的真实性。以氨基酸相似度大于60%为标准对豌豆蚜基因组中P450基因进行分组,69个P450基因中,除18个基因序列因差异太大,不能被归入任何一组,其余51个可归入10个组,其中8个组(包含47条序列)适合于正选择和基因转换分析。正选择和基因转换分析结果表明:仅有1个组(含9个基因)显著受到正选择压力作用,正选择概率大于95%的氨基酸位点分别是20T和27N,20T位于底物识别位点SRS1,27N位于D-helix;有3个组(包含8个基因)显示显著的基因转换事件。参与基因转换的基因均为CYP4家族成员,分别是CYP4C,CYP4G和CYP4V亚家族。参与基因转换的成员之间的蛋白相似度较高(70%~95%),且XM_001944991与XM_001951794同存在于SCAFFOLD12542上,XM_001945510与XM_001944057同存在于SCAFFOLD7010上。这可能暗示豌豆蚜P450基因通过基因复制,然后通过基因转换使P450获得新的功能,以适应多变的生存环境。此外,鉴定出20个不同的基序,其中有5条基序在90%以上的基因中出现。 张云华 王强 刘静 张鹏飞 陈建群关键词:豌豆蚜 表达序列标签 正选择 基因转换 基序 茄科植物叶绿体基因组插入、缺失和核苷酸替代的发生方式及影响 被引量:15 2008年 核苷酸替代和indels(插入、缺失统称)发生是进化的重要动力。以茄科植物为研究对象,探讨茄属中番茄和马铃薯、烟草属中绒毛状烟草和普通烟草分化时叶绿体基因组indels和核苷酸替代的发生方式,以及这两种突变对基因组造成的影响。结果显示:indels和核苷酸替代的发生都不是随意的。indels发生在A+T丰富的区域,1 bp indels占据总数的30%以上,大部分indels都为低于10bp的较短片段。核苷酸替代表现出Ts(转换)/Tv(颠换)偏差,但T→G,A→C颠换频率却明显增加。Ts/Tv比值出现种属特异性,番茄和马铃薯比较时替代的Ts/Tv比值低于绒毛状烟草和普通烟草比较时Ts/Tv比值。不同物种替代的(A+T)/(G+C)比值有一定差异,从而影响基因组的(G+C)%,此比值的差异与形成物种的生长习性有一定的关系。 唐萍 王强 陈建群关键词:茄科植物 叶绿体 棉蚜获得黄瓜花叶病毒的行为与取食过程的关系 被引量:28 2001年 利用刺吸电位 (EPG)及其即时中断技术研究了棉蚜Aphisgossypii传播黄瓜花叶病毒(CMV)的机理 ,分析电势落差波 (pd)及其亚波形在棉蚜获得CMV的取食行为过程中的作用。结果表明 :棉蚜的获毒需要pd波的发生 ,它的获毒效率与穿刺病株细胞膜的次数呈正相关。证明了这种行为是一种细胞内行为。对植物细胞内穿刺产生的电位落差 (pd)波亚波形分析的结果显示 ,棉蚜的获毒发生在pd波的Ⅱ 3阶段 ,与棉蚜主动吸食植物细胞汁液的活动相关 ,这支持了蚜虫获毒的“吸入假说”。 张鹏飞 陈建群 张闲 王斌 蒋群峰关键词:棉蚜 黄瓜花叶病毒 植物病毒病 传毒 互花米草种群的SNP标记的分型方法 本发明涉及一种互花米草种群的SNP标记的分型方法,本方法根据高通量转录组测序筛选得到目标基因,通过PCR反应、PCR产物测序得到多个SNP位点。再由所有有效的SNP位点组成单倍体型用于分子标记以达到遗传分型。本发明在一次... 陈建群 丁静 王强 许颖 吴娟子一种昆虫取食行为即时中断方法及装置 一种昆虫取食行为即时中断方法,在法拉第屏蔽框内进行昆虫对取食对象的取食行为的EPG信号采集,以昆虫口针为微电极和植物根部土壤为参比电极构成回路,昆虫口针电极由金属丝连接,并将采集信号传至即时显示计算机系统,以电子驱动方式... 陈建群 张鹏飞 王斌 张闲 马亮